| |
| |
|
Regulace genové exprese v nádorové tkáni
Kulda, Vlastimil ; Černý, Radim (vedoucí práce) ; Vachtenheim, Jiří (oponent) ; Kleibl, Zdeněk (oponent)
Deregulace genové exprese způsobená genetickými a epigenetickými změnami hraje důležitou roli v patogenezi nádorových onemocnění. Tato disertační práce je komentovaným souborem deseti publikovaných prací zabývajících se problematikou molekulární biologie nádorů, na jejichž vzniku se autor významným způsobem podílel. Všechny práce obsažené v souboru spojuje téma stanovení molekul, které se podílejí na regulaci genové exprese (mikroRNA) nebo změn na úrovni DNA, které ovlivňují expresi genů (methylace promotoru, přítomnost fúzního genu). MikroRNA jsou krátké jednovláknové RNA molekuly, které regulují genovou expresi na posttranskripční úrovni urychlením degradace mRNA nebo inhibicí translace. Jedná se o základní mechanismus s vlivem na všechny buněčné procesy včetně patogeneze různých nemocí. MikroRNA mohou působit jako onkogeny snižováním exprese tumor supresorových genů nebo naopak jako tumor supresory snižováním exprese onkogenů, ale dnes už víme, že síť mikroRNA - RNA interakcí je mnohem komplexnější. Námi publikované výsledky, které jsou součástí této práce, se týkají kolorektálního karcinomu (CRC), karcinomu prostaty, dlaždicobuněčných karcinomů hlavy a krku (HNSCC), karcinomu žaludku a nemalobuněčného karcinomu plic (NSCLC). U pacientů s CRC jsme prokázali prognostický význam miR-21. Ve tkáni...
|
|
Regulace genové exprese v nádorové tkáni
Kulda, Vlastimil ; Černý, Radim (vedoucí práce) ; Vachtenheim, Jiří (oponent) ; Kleibl, Zdeněk (oponent)
Deregulace genové exprese způsobená genetickými a epigenetickými změnami hraje důležitou roli v patogenezi nádorových onemocnění. Tato disertační práce je komentovaným souborem deseti publikovaných prací zabývajících se problematikou molekulární biologie nádorů, na jejichž vzniku se autor významným způsobem podílel. Všechny práce obsažené v souboru spojuje téma stanovení molekul, které se podílejí na regulaci genové exprese (mikroRNA) nebo změn na úrovni DNA, které ovlivňují expresi genů (methylace promotoru, přítomnost fúzního genu). MikroRNA jsou krátké jednovláknové RNA molekuly, které regulují genovou expresi na posttranskripční úrovni urychlením degradace mRNA nebo inhibicí translace. Jedná se o základní mechanismus s vlivem na všechny buněčné procesy včetně patogeneze různých nemocí. MikroRNA mohou působit jako onkogeny snižováním exprese tumor supresorových genů nebo naopak jako tumor supresory snižováním exprese onkogenů, ale dnes už víme, že síť mikroRNA - RNA interakcí je mnohem komplexnější. Námi publikované výsledky, které jsou součástí této práce, se týkají kolorektálního karcinomu (CRC), karcinomu prostaty, dlaždicobuněčných karcinomů hlavy a krku (HNSCC), karcinomu žaludku a nemalobuněčného karcinomu plic (NSCLC). U pacientů s CRC jsme prokázali prognostický význam miR-21. Ve tkáni...
|
| |
|
Transkripční regulace diferenciace buněk embryonálního karcinomu a maligního melanomu: Úloha proteinů p21(WAF1) a MITF
Šestáková, Blanka ; Vachtenheim, Jiří (vedoucí práce) ; Černý, Radim (oponent) ; Pavel, Stan (oponent)
V buňkách F9 (embryonální karcinom) lze indukovat pomocí kyseliny retinové a dbcAMP diferenciaci na buňky podobné parietálnímu endodermu (PE). V naší práci jsme ukázali, že hladina inhibitoru cyklin-dependentních kinas, p21 proteinu, prudce stoupá na konci této diferenciace. Klony F9 buněk stabilně exprimující exogenní p21 měly při diferenciaci zvýšenou hladinu trombomodulinu, specifického markeru PE diferenciace. Transfektovaný p21 aktivoval trombomodulinový promoter-reportér a vazebné místo pro cyklin E v molekule p21 bylo postradatelné pro tuto aktivitu. Promoterová aktivita byla inhibována kotransfekcí antisense p21 cDNA nebo p21-specifickými siRNA komplexy. p21 protein tedy positivně reguluje transkripci trombomudulinu, a to mechanismem dereprese represorové domény transkripčního koaktivátoru p300. V části buněčné populace se p21 protein během diferenciace akumuloval kromě jádra i v cytoplasmě. Tato lokalizace p21 je asociována s jeho antiapoptotickou funkcí. Souhrnně jsme tedy zjistili, že p21 protein má kromě účinků na regulaci buněčného cyklu i transkripčně aktivační a pravděpodobně antiapoptotickou úlohu při diferenciaci F9 buněk na PE. Dále jsme studovali expresi a transkripční úlohu p21 proteinu v melanomových buňkách. p21 protein byl exprimován ve většině buněčných linií v relativně vysoké...
|
| |
| |
| |