|
Příprava a charakterizace proteinu LmbX zúčastněného v biosyntéze antibiotika linkomycinu
Jiráčková, Petra ; Janata, Jiří (vedoucí práce) ; Janderová, Blanka (oponent)
Linkomycin je antibiotikum využívané v klinické praxi. Jeho producentem je Streptomyces lincolnensis. Linkomycin se skládá z aminocukerné a aminokyselinové složky, které jsou spojeny amidovou vazbou. Aminokyselinovým prekurzorem je propylprolin (PPL), jehož biosyntéza probíhá dráhou vycházející z tyrosinu. Modifikovaná PPL dráha byla také objevena u pyrrolobenzodiazepinů (PBD) a hormaomycinu. V biosyntéze PBD je PPL prekuzor dále modifikován reakcemi katalyzovanými specifickými enzymy nepřítomnými v biosyntéze linkomycinu. Geny kódující tyto enzymy by mohly být přeneseny do genového shluku pro biosyntézu linkomycinu. Tímto způsobem bychom mohli získat producenty hybridních antibiotik s lepšími vlastnostmi, a dokonce antimalarickými účinky. PPL dráhy se účastní šest enzymů, které jsou kódovány v genovém shluku pro biosyntézu linkomycinu. První dvě reakce biosyntézy PPL byly již prokázány, proto se tato práce zaměřuje na reakci třetí, kterou by měl podle literatury katalyzovat protein LmbX. Jeho předpokládaná funkce v biosyntéze PPL je hydrolýza C-C vazby. Podle sekvenční homologie však protein LmbX patří do rodiny isomeras. V této práci byl nadprodukován protein LmbX a byla testována jeho aktivita v přítomnosti předpokládaného substrátu. Produkty byly měřeny na kapalinovém chromatografu (UHPLC)....
|
|
Characterization of peptide proteinase inhibitors isolated from boar seminal plasma
Jelínková, Petra ; Tichá, M. ; Jonáková, Věra
Most of proteins of boar seminal plasma are present in this medium under physiological conditions in the form of aggregates and not of monomers. In the present communication we have shown that not only spermadhesins, but also proteinase inhibitors participate in the formation of associated complexes. Proteinase inhibitors were found after gel chromatographic separation mainly in the fraction with the lowest relative molecular mass. Two different types of serine proteinase inhibitors were isolated from boar seminal plasma ů (i) glycosylated inhibitor with Mr 12 kDa, (ii) non-glycosylated sperm-associated acrosin inhibitor with Mr 8 kDa, and a new type of low molecular weight protein that is probably composed of two subunits coupled by the -S-S- bridge. The proteinase inhibitor with Mr 8 kDa was proved to form a heterodimer with AQN 1 spermadhesin under physiological conditions, whereas inhibitor with Mr 12 kDa forms homodimers.
|
| |
| |
| |
| |
| |
|
Spektroskopické studium role karotenoidů ve fotosyntéze
Loew, Martin
I Spektroskopicke studium role karotenoidu ve fotosynteze Abstrakt diplornove prace Vypracoval: Martin Loew Vedouci diplomove prace: Prof. RNDr. Jan Hala, DrSc. Pracoviste; Katedra chemicke fyziky a optiky Studium role karotenoidu ve fotosyntezeje rychle se rozvijejici vetev vyzkumu biofyzikalnich a biochemickych zakladu fotosyntezy. Teto problematice se intenzivne venuje i pracoviste nizkoteplotnf laserove laboratofe KChFO MFF UK. Cilem prace byl spektroskopicky popis fotosyntetickych pigmentu izolovanych ze zelenych fas Scenedesmus Ouadricauda a nasledne lokalizace jejich absorpce ve spektru intaktm'ch bunek. Pfed vlastnfm mefenim bylo provedeno nekolik zasadnfch uprav experimentalniho zafizeni v nizkoteplotnf laserove laboratofi. Vyznamneho zlepseni v praci s kapalnym heliem bylo dosazeno instalaci noveho hloubkomeru do ponorneho optickeho kryostatu. Do aparatury pro fluorescencni mefeni byl instalovan novy fotonasobic Hamamatsu, chlazeny Peltierov^m jevem, umoznujici detekci i velmi slabych svetelnych signalu. Absorpcni aparatura byla rozsifena o stabilni zdroj svetla - wolframovou 1000W zarovku napajenou napetim ze stabilizovaneho zdroje. Podafilo se izolovat prakticky vsechny pigrnenty obsazene v fasach: neoxantin, violaxantin, lutein, p-karoten i chlorofyly. Na vzorcich jednotlivych karotenoidu v...
|
|
Purifikace a charakterizace membránově vázané reduktasy z lidské jaterní tkáně
Pelcová, Vendula ; Wsól, Vladimír (vedoucí práce) ; Kvasničková, Eva (oponent)
Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biochemických věd Kandidát: Mgr. Vendula Pelcová Školitel: Prof. Ing. Vladimír Wsól, Ph.D. Název rigorózní práce: Purifikace a charakterizace membránově vázané reduktasy z lidské jaterní tkáně. Tato práce byla zaměřena na zavedení experimentálních technik pro purifikaci lidské jaterní mikrosomální frakce. Byly zvoleny tři základní kroky purifikačního schématu. Jako první krok byla zařazena iontově výměnná chromatografie na silném anexu následována dvěma separacemi na koloně pro gelovou filtraci. Před purifikací bylo nutno mikrosomální frakci solubilizovat, aby se uvolnily proteiny z vazby na membránu a podmínky optimalizovat. Jednotlivé najímané frakce byly následně inkubovány se specifickým substrátem reduktas oracinem a množství vzniklého metabolitu 11-dihydrooracinu bylo stanoveno pomocí achirální HPLC analýzy. U nejaktivnějších frakcí byla provedena SDS- PAGE a určena velikost hledaného enzymu. Použitím protilátky na 11beta-HSD1 byla vyloučena přítomnost této reduktasy v analyzovaných frakcích. S využitím popsaných purifikačních technik se podařilo zakoncentrovat frakci s dosud nepopsanou lidskou jaterní reduktasou.
|
|
Transkriptomika embryonální genomové aktivace preimplantačního vývoje skotu v podmínkách in vivo a in vitro kultivace
Vodičková Kepková, Kateřina ; Kaňka, Jiří (vedoucí práce) ; Petr, Jaroslav (oponent) ; Krylov, Vladimír (oponent)
Cílem práce bylo charakterizovat transkripční profil in vivo a in vitro získaných embryí během bovinní minoritní a majoritní genomové aktivace a dále identifikovat mRNA transkripty, které jsou nově syntetizované během těchto stádií. V naší první studii jsme se zaměřili na studium minoritní aktivace genů ve 4-buněčném stádiu embrya. Pomocí metody supresivní subtraktivní hybridizace (SSH) jsme nalezli 31 amplikonů homologních s již známými geny. Pro podrobnější studium exprese během celého období preimplantačního vývoje jsme vybrali 5 genů: centromere protein, 350/400 kDa (CENPF, mitosin), splicing factor arginine/serine-rich 3 (SRFS3), high mobility group nucleosomal binding domain 2 (HMGN2) protein a eukaryotické translační iniciační faktory EIF4A2 a EIF4E. Všechny tyto geny hrají důležitou roli v raném vývoji embrya. Gen SRFS3 je prvním genem s významnou funkcí, jehož exprese byla nalezena již v průběhu minoritní genomové aktivace, což potvrdila citlivost jeho transkripce k α-amanitinu v tomto stádiu. Pro další studium jsme si vybrali gen CENPF (centromeric protein F, mitosin), jehož funkci během preimplantačního vývoje bovinního embrya jsme podrobně studovali pomocí specifického umlčení injikací double- stranded (dsRNA) do embrya ve stádiu zygoty. Zjistili jsme, že mikroinjekce CENPF dsRNA...
|
host ::
