|
|
Phylogenetic relationships of some spirurine nematodes (Nematoda: Chromadorea: Rhabditida: Spirurina) parasitic in fishes inferred from SSU rRNA gene sequences
ČERNOTÍKOVÁ, Eva
Small subunit rRNA sequences were obtained from 38 representatives mainly of the nematode orders Spirurida (Camallanidae, Cystidicolidae, Daniconematidae, Philometridae, Physalopteridae, Rhabdochonidae, Skrjabillanidae) and, in part, Ascaridida (Anisakidae, Cucullanidae, Quimperiidae). The examined nematodes are predominantly parasites of fishes. Their analyses provided well-supported trees allowing the study of phylogenetic relationships among some spirurine nematodes. The present results support the placement of Cucullanidae at the base of the suborder Spirurina and, based on the position of the genus Philonema (subfamily Philoneminae) forming a sister group to Skrjabillanidae (thus Philoneminae should be elevated to Philonemidae), the paraphyly of the Philometridae. Comparison of a large number of sequences of representatives of the latter family supports the paraphyly ofthe genera Philometra, Philometroides and Dentiphilometra. The validity of the newly included genera Afrophilometra and Caranginema is supported. These results indicate geographical isolation has not been the cause of speciation in this parasite group and no coevolution with fish hosts is apparent. On the contrary, the group of South-American species of Alinema, Nilonema and Rumai is placed in an independent branch, thus markedly separated from other family members. Molecular data indicate that the skrjabillanid subfamily Esocineminae (represented by Esocinema bohemicum) should be either elevated to the rank of an idependent family or Daniconematidae (Mexiconema africanum) should be decreased to Daniconematinae and transferred to the family Skrjabillanidae. Camallanid genera Camallanus and Procamallanus, as well as the subgenera Procamallanus and Spirocamallanus are confirmed to be paraphyletic. Paraphyly has also been found within Filarioidea, Habronematoidea and Thelazioidea and in Cystidicolidae, Physalopteridae and Thelaziidae. The results of the analyses also show that Neoascarophis, Spinitectus and Rhabdochona are monophyletic, in contrast to the paraphyletic genus Ascarophis. They further confirm the independence of two subgenera, Rhabdochona and Globochona, in the genus Rhabdochona. The necessity of further studies of fish-parasitizing representatives of additional nematode families not yet studied by molecular methods, such as Guyanemidae, Lucionematidae or Tetanonematidae, is underscored.
|
|
|
Tapinothrix clintonii sp. nov. (Pseudanabaenaceae, Cyanobacteria), nový druh na pomezí pěti rodů
BOHUNICKÁ, Markéta
Previously unknown cyanobacterium was found in Grand Staircase-Escalante National Monument, Utah, USA. Looking at morphological characteristics, an argument could be made to place this taxon in any of the following genera: Ammatoidea, Homoeothrix, Leptolyngbya, Phormidiochaete, and Tapinothrix. Phylogeny based on 16S rDNA suggested that the taxon belongs into family Pseudanabaenaceae and is closely related to Leptolyngbya sensu stricto. However, it possess distinctive morphology of heteropolar tapered filaments and unique 16S-23S ITS sequence and secondary structure. Therefore an assignment into pseudanabaenalean genus Tapinothrix was made and the species was described as Tapinothrix clintonii.
|
|
|
Fylogenetické analýzy myxosporeí na základě molekulárních dat
BARTOŠOVÁ, Pavla
Tato práce je zaměřena na posuzování fylogenetické pozice Myxozoa v rámci Metazoa, studium evolučních vztahů v rámci myxosporeí a výzkum kryptických druhů u některých myxosporeí na základe ribozomálních a protein-kódujících dat. Hlavní část práce byla potvrdit evoluční trendy v rámci myxosporeí založených na jednom genu pomocí jiných molekulárních markérů s cílem zjistit jestli rekonstruované vztahy odpovídají organizmální fylogenezi. To je klíčovým krokem pro budoucí řešení neshod mezi fylogenezí a taxonomií myxosporeí.
|
|
| |
|
| |
|
| |
|
| |
|
|
Floristický průzkum povodí Pozdeňského a Bílichovského potoka na Slánsku
BERANOVÁ, Hana
ANOTACE Hana Beranová Jihočeská univerzita {--} pedagogická fakulta {--} katedra biologie Studijní program {--} M7504 Učitelství pro střední školy Studijní obory - Učitelství biologie, Učitelství chemie Floristický průzkum povodí Pozdeňského a Bílichovského potoka na Slánsku Diplomová práce 2008 Diplomová práce se zabývá popisem vegetace v povodí Bakovského a Zlonického potoka. V názvu práce jsou uvedené potoky Bílichovský a Pozdeňský. Jedná se ale pouze o místní pojmenování toků. Výzkum proběhl ve vegetačních sezónách 2006 {--} 2007. Ve formě rešerše jsou charakterizovány geomorfologické, geologické, půdní, klimatické, hydrografické poměry a základní fytogeografická charakteristika této oblasti. Vybrané druhy zjištěných rostlin jsou charakterizovány a jejich výskyt je znázorněn ve schematických mapách oblasti. Bylo zde zjištěno celkem 299 druhů rostlin, z nichž 48 je uvedeno v Červeném a černém seznam cévnatých rostlin České republiky (stav v roce 2000) (Procházka F. (ed.), 2001). V textu jsou popsány významné lokality. V diskuzi jsou popsány faktory, které ovlivňují výskyt některých rostlinných druhů. V příloze jsou uvedeny schematické mapy s místy výskytu některých druhů rostlin a fotografická dokumentace. Vedoucí diplomové práce: Mgr. Rostislav Černý, CSc.
|
|
|
Taxonomie rodu \kur{Stigeoclonium} v ČR
CAISOVÁ, Lenka
The genus Stigeoclonium is taxonomically very problematic. The relationships between species of this genus are very little known. There are only a few studies that deal with only morphological revision of the genus Stigeoclonium. Hovewer, up to now no phylogenetic analysis of this genus exists. This study summarizes the knowledge about the genus Stigeoclonim in the Czech Republic and shows the first phylogenetic analysis of this genus.
|
|
|
Variation in the \kur{Melampyrum sylvaticum} group
TĚŠITEL, Jakub
This study deals with morphological variation in the Melampyrum sylvaticum group (Orobanchaceae). Populations of the Hercynian Massif, Western and Eastern Carpathians were investigated using both conventional and geometric morphometric methods. Individual morphological characters were evaluated in detail. Preliminary taxonomic concept of the group is presented. Biogeographical context of detected morphological variation is discussed.
|
host ::
RSS.