|
|
Diatoms of Acadia National Park, Maine, USA, with a detailed account on taxonomy and morphology of several remarkable species
VESELÁ, Jana
This thesis was focused on studying diatoms (Bacillariophyceae) from Acadia National Park, Maine, USA. First, the park is introduced and the preliminary study of freshwater algae, including diatoms, is presented. Extraordinary species richness of algae was discovered, especially in the group of diatoms, which is documented by a complete list of 674 diatom taxa in 92 genera encountered in the freshwater and brackish habitats within the park. Of those a considerable number of species unfortunately remained unidentified, as they did not conform to any described taxon in the available scientific literature. Therefore, several of those unnamed taxa were studied in close detail using light and scanning electron microscopes, exhaustive literature and herbaria search, and yielded description of three new species from genus Eunotia, and rediscovery of two rare and almost forgotten Surirella species.
|
|
|
Monozoické tasemnice rodu \kur{Monobothrium} (Cestoda: Caryophyllidea) z Palearktické a Nearktické zoogeografické oblasti
ČAPKOVÁ, Lenka
Rod Monobothrium Diesing, 1863 zahrnuje dva evropské druhy (parazitující u kaprovitých ryb, s postovariálními vitelárii, postrádající vnější semenný váček a mající digitiformní nebo "cuneicrispitate" skolex) a pět severoamerických druhů (parazitujících ryby čeledi Catostomidae, postrádajících postovariální vitelária, s vnějším semenným váčkem a lokulomonobotriátním, monobotriátním nebo lokulotrunkátním skolexem). Na základě těchto morfologických rozdílů je navržen přesun pěti severoamerických druhů z rodu Monobothrium do rodu Promonobothrium Mackiewicz, 1968 jako nové kombinace jmen, tj. P. fossae, P. hunteri, P. ingens, P. mackiewiczi, P. ulmeri a k přesunu evropského druhu M. auriculatum do rodu Caryophyllaeus Gmelin, 1790 jako C. auriculatus. Navrhované změny jsou podpořeny i předběžnou fylogenetickou analýzou. V jejich důsledku se rod Monobothrium stává rodem monotypickým, zahrnujícím pouze M. wageneri Nybelin, 1922.
|
|
|
Taxonomic study of the Eurasian taxa of Tortula muralis (Pottiaceae, Musci) complex
KOŠNAR, Jiří
Práce se zabývá problematikou taxonomie mechů komplexu Tortula muralis. Taxony komplexu byly zkoumány pomocí morfometrické analýzy, stanovení ploidie průtokovou cytometrií a analýzou sekvencí ITS regionu jaderné ribozomální DNA. Morfometrická a cytometrická analýza odhalila pouze dvě dobře odlišené skupiny, které odpovídaly nápadně variabilní T. muralis a poměrně uniformní T. lingulata. Variabilita ITS sekvencí byla pravděpodobně způsobena genovým tokem mezi některými morfologicky definovanými taxony komplexu. U některých taxonů komplexu byl detekován opakovaný a polytopický autopolyploidní původ polyploidních rostlin. Na základě získaných dat byly navrženy změny v taxnomickém konceptu T. muralis. Hybridizace se jeví jako pravděpodobný zdroj morfologické a taxonomické diverzity komplexu T. muralis.
|
|
|
Phylogeny, Phytogeography, and Taxonomy of Polar Oscillatoriales
STRUNECKÝ, Otakar
V práci byla studována morfologická a fylogenická diverzita 143 kmenů patřících do Oscillatoriáles, s primárním zaměřením na tradiční rody Phormidium sensu lato a Microcoleus. U 88 kmenů sinic určených jako Ph. autumnale, Ph. setchelianum, Ph. subfuscum, Ph. favosum etc. a M. vaginatus byla potvrzena jejich shodnost s druhem Microcoleus vaginatus Desmazi?res ex Gomont. Nomenklatorické přesuny byly uskutečněny a revidovaný rod Microcoleus byl popsán. Revize taxonomického zařazení antarktické sinice Ph. murrayi (Lyngbya murray West & West) byla provedena podle studia fylogeneze a morfologie získaných kmenů a tak byl popsán nový rod Wilmottia. Fylogenetické studium morfotypů Ph. lloydianum and Ph. acuminatum Gomont vedlo k ustanovení druhu Oxynema thaianum spec. nova. Srovnání temperátních, arktických a antarktických sinic patřících do druhu M. vaginatus ukázalo, že antarktické kmeny byly izolovány od ostatních částí světa před ~31?45 Ma, zatímco arktické populace jsou ovlivnovány relativně častým prenosem kmenů z geogreaficky blízkých oblastí. V práci se potvrdilo, že jednotlivé genotypy sinic druhu M. vaginatus nejsou rozšířeny ubikvitně a polární genotypy přítomné v Arktidě a Antarktidě jsou odlišné.
|
|
|
Anabaena - Phenotypic and genotypic diversity of planktonic strains in fishponds and reservoirs of the Czech Republic
ZAPOMĚLOVÁ, Eliška
U 61 populací sinic r. Anabaena příslušejících ke 13 různým morfotypům byla popsána morfologická diverzita v přírodních podmínkách českých rybníků a přehradních nádrží. Následně byl aplikován polyfázický přístup v klasifikaci 45 klonálních kmenů izolovaných z těchto populací. Podrobná morfologická analýza byla provedena a parciální sekvence 16S rRNA genu byla získána pro 33 z těchto kmenů. Produkce sekundárních metabolitů byla stanovena u 20 vybraných kmenů. U vybraných kmenů byla studována jejich teplotní a světelná růstová optima a také plasticita jejich morfologických charakteristik v různých světelných a teplotních podmínkách a v různých koncentracích fosforu a dusíku. Výsledky byly diskutovány s ohledem na vymezení jednotlivých morfotypů r. Anabaena. Nový rod Sphaerospermum byl ustanoven pro morfotypy Anabaena kisselevina, A. reniformis a Aphanizomenon aphanizomenoides, jejichž fenotypové i genotypové vlastnosti se výrazně lišily od ostatních morfotypů r. Anabaena. Mimo to byla podána první informace o recentním výskytu a rozšíření A. reniformis a Aph. aphanizomenoides v České Republice.
|
|
|
Taxonomy of selected groups of the genus \kur{Caloplaca}
ŠOUN, Jaroslav
Práce se zabývá fylogenezí, taxonomií a nomeklaturou vybraných skupin lišejníků rodu Caloplaca. Detailně byla studována s použitím molekulárních metod (sekvencí ITS), morfologie a chemie především skupina C. cerina. Studie byla založena na materiálu z Evropy a v menším rozsahu také ze Severní Ameriky a západní Asie. Studie odhalila neočekávané množství fylogenetických linií a popsány byly tři nové druhy (C. sterilis, C. subalpina, C. thracopontica). Další studie se detailně zabývala nomenklaturou, taxonomií, morfologií a v menší míře též ekologií dvou blízce příbuzných druhů ze skupiny C. aurantia (C. aurantia, C. flavescens). Stanoven byl neotyp druhu C. aurantia. Zrevidováno bylo rozšíření obou druhů v rámci České republiky. Málo známý druh C. aurantiomurorum z Alžírska byl lektotypifikován a synonymizován s C. aurantia. Vyjma dvou zmíněných skupin byly s použitím molekulárních (sekvencí ITS) a fenotypických dat studovány druhy C. phlogina and C. scythica. Přestože se druhy částečně liší v barvě stélky a výrazně v rozšíření bylo zjištěno, že se jedná o stejný druh.
|
|
|
Datový standard XBRL
Najmanová, Veronika ; Vašek, Libor (vedoucí práce) ; Procházka, David (oponent)
Tato práce zkoumá a shrnuje datový standard XBRL. V práci jsou přiblíženy nejdůležitější taxonomie a instituce, které se podílí na vývoji a přijetí XBRL ve světě jako formátu pro vykazování finančních i nefinančních informací. Nejvíce pozornosti je věnováno implementaci XBRL v jednotlivých částech světa a v České republice. Praktická část práce je zaměřena na možnosti využití XBRL v rámci České republiky a zhodnocení připravenosti České republiky pro přijetí XBRL v porovnání s ostatními státy světa.
|
|
|
Systematika jepic (Ephemeroptera) čeledi Baetidae
SROKA, Pavel
Předložená práce se zabývá několika dílčími problémy souvisejícími se systematickým uspořádáním čeledi Baetidae (řád jepic, Ephemeroptera) a je založena na studiu jak morfologických, tak i molekulárních znaků. Práce přispívá k řešení některých dílčích taxonomických problémů a k objasnění fylogenetických vztahů v rámci vybraných taxonů.
|
|
|
Phylogenetic relationships of some spirurine nematodes (Nematoda: Chromadorea: Rhabditida: Spirurina) parasitic in fishes inferred from SSU rRNA gene sequences
ČERNOTÍKOVÁ, Eva
Small subunit rRNA sequences were obtained from 38 representatives mainly of the nematode orders Spirurida (Camallanidae, Cystidicolidae, Daniconematidae, Philometridae, Physalopteridae, Rhabdochonidae, Skrjabillanidae) and, in part, Ascaridida (Anisakidae, Cucullanidae, Quimperiidae). The examined nematodes are predominantly parasites of fishes. Their analyses provided well-supported trees allowing the study of phylogenetic relationships among some spirurine nematodes. The present results support the placement of Cucullanidae at the base of the suborder Spirurina and, based on the position of the genus Philonema (subfamily Philoneminae) forming a sister group to Skrjabillanidae (thus Philoneminae should be elevated to Philonemidae), the paraphyly of the Philometridae. Comparison of a large number of sequences of representatives of the latter family supports the paraphyly ofthe genera Philometra, Philometroides and Dentiphilometra. The validity of the newly included genera Afrophilometra and Caranginema is supported. These results indicate geographical isolation has not been the cause of speciation in this parasite group and no coevolution with fish hosts is apparent. On the contrary, the group of South-American species of Alinema, Nilonema and Rumai is placed in an independent branch, thus markedly separated from other family members. Molecular data indicate that the skrjabillanid subfamily Esocineminae (represented by Esocinema bohemicum) should be either elevated to the rank of an idependent family or Daniconematidae (Mexiconema africanum) should be decreased to Daniconematinae and transferred to the family Skrjabillanidae. Camallanid genera Camallanus and Procamallanus, as well as the subgenera Procamallanus and Spirocamallanus are confirmed to be paraphyletic. Paraphyly has also been found within Filarioidea, Habronematoidea and Thelazioidea and in Cystidicolidae, Physalopteridae and Thelaziidae. The results of the analyses also show that Neoascarophis, Spinitectus and Rhabdochona are monophyletic, in contrast to the paraphyletic genus Ascarophis. They further confirm the independence of two subgenera, Rhabdochona and Globochona, in the genus Rhabdochona. The necessity of further studies of fish-parasitizing representatives of additional nematode families not yet studied by molecular methods, such as Guyanemidae, Lucionematidae or Tetanonematidae, is underscored.
|
|
|
Tapinothrix clintonii sp. nov. (Pseudanabaenaceae, Cyanobacteria), nový druh na pomezí pěti rodů
BOHUNICKÁ, Markéta
Previously unknown cyanobacterium was found in Grand Staircase-Escalante National Monument, Utah, USA. Looking at morphological characteristics, an argument could be made to place this taxon in any of the following genera: Ammatoidea, Homoeothrix, Leptolyngbya, Phormidiochaete, and Tapinothrix. Phylogeny based on 16S rDNA suggested that the taxon belongs into family Pseudanabaenaceae and is closely related to Leptolyngbya sensu stricto. However, it possess distinctive morphology of heteropolar tapered filaments and unique 16S-23S ITS sequence and secondary structure. Therefore an assignment into pseudanabaenalean genus Tapinothrix was made and the species was described as Tapinothrix clintonii.
|
host ::
RSS.