|
|
Anabaena - Phenotypic and genotypic diversity of planktonic strains in fishponds and reservoirs of the Czech Republic
ZAPOMĚLOVÁ, Eliška
U 61 populací sinic r. Anabaena příslušejících ke 13 různým morfotypům byla popsána morfologická diverzita v přírodních podmínkách českých rybníků a přehradních nádrží. Následně byl aplikován polyfázický přístup v klasifikaci 45 klonálních kmenů izolovaných z těchto populací. Podrobná morfologická analýza byla provedena a parciální sekvence 16S rRNA genu byla získána pro 33 z těchto kmenů. Produkce sekundárních metabolitů byla stanovena u 20 vybraných kmenů. U vybraných kmenů byla studována jejich teplotní a světelná růstová optima a také plasticita jejich morfologických charakteristik v různých světelných a teplotních podmínkách a v různých koncentracích fosforu a dusíku. Výsledky byly diskutovány s ohledem na vymezení jednotlivých morfotypů r. Anabaena. Nový rod Sphaerospermum byl ustanoven pro morfotypy Anabaena kisselevina, A. reniformis a Aphanizomenon aphanizomenoides, jejichž fenotypové i genotypové vlastnosti se výrazně lišily od ostatních morfotypů r. Anabaena. Mimo to byla podána první informace o recentním výskytu a rozšíření A. reniformis a Aph. aphanizomenoides v České Republice.
|
|
|
Floristická studie vodních sinic a řas v jihovýchodní části kraje Vysočina
MELICHAR, Antonín
V roce 2009 byly odebrány vzorky planktonu ze 45 lokalit v kraji Vysočina. Bylo studováno druhové složení a relativní abundance druhů; byly měřeny ekologické faktory jako pH, vodivost, teplota, průhlednost a obsah rozpuštěných iontů. Byly vypočteny hodnoty ekologických indexů (Shannonův a Simpsonův index diverzity) a ty byly poté porovnány s ostatními ekologickými faktory. Byl vytvořen seznam všech druhů nalezených v kraji Vysočina. Bylo nalezeno 262 druhů a 4 druhy nové pro ČR.
|
|
|
Tapinothrix clintonii sp. nov. (Pseudanabaenaceae, Cyanobacteria), nový druh na pomezí pěti rodů
BOHUNICKÁ, Markéta
Previously unknown cyanobacterium was found in Grand Staircase-Escalante National Monument, Utah, USA. Looking at morphological characteristics, an argument could be made to place this taxon in any of the following genera: Ammatoidea, Homoeothrix, Leptolyngbya, Phormidiochaete, and Tapinothrix. Phylogeny based on 16S rDNA suggested that the taxon belongs into family Pseudanabaenaceae and is closely related to Leptolyngbya sensu stricto. However, it possess distinctive morphology of heteropolar tapered filaments and unique 16S-23S ITS sequence and secondary structure. Therefore an assignment into pseudanabaenalean genus Tapinothrix was made and the species was described as Tapinothrix clintonii.
|
|
| |
|
|
Photoautotrophic microorganisms in the glacial ecosystem of Svalbard, high Arctic
STIBAL, Marek
Photoautotrophic microorganisms, i.e. cyanobacteria and microalgae, are ubiquitous in the glacial ecosystem of the high Arctic archipelago of Svalbard. Their communities play significant roles in the ecosystem, including organic carbon production on the glacier surface and its supply to downstream environments, initiating microbial colonisation after glacier retreat and preparing proglacial substrata for further succession.
|
|
|
Sinice dostřikových zón dalmatského pobřeží
VONDRÁŠKOVÁ, Alžběta
Byla provedena primární studie sinic dostřikové zóny dalmatského pobřeží. Vzorky byly odebrány ze 7 lokalit. Bylo nalezeno 36 druhů sinic, ale pouze 27 druhů se podařilo určit, z nichž bylo 21 epilitických a 6 endolitických druhů. Výsledky byly porovnány s podobnými studiemi sinic dostřikových zón. Byl vytvořen přehled všech druhů sinic, které by se mohly nacházet v doštřikových zónách po celém světě. Tyto výsledky byly také porovnány s výsledky mé studie.
|
|
|
Cytotoxicita a produkce sekundárních metabolitů u sinic
HROUZEK, Pavel
Cyanobacteria are well-known producers of secondary metabolites of different chemical structures and a wide range of biological functions. In the present thesis, the cytotoxic activity of cyanobacteria, originating from different habitats, was studied in order to reveal whether cytotoxicity is an environmentally dependent characteristic. In addition, the data were compared with the toxicity of these extracts to the model invertebrate Artemia salina. The obtained data suggest that cytotoxic cyanobacteria are favoured under some conditions and thus more frequent in particular localities. The majority of the studied extracts and fractions exhibited cytotoxitity to the Sp/2 cell line not accompanied by toxicity to A. salina. Moreover, in most of the strains with both activities to A. salina and Sp/2 cells the toxic effect was caused by an identical fraction. This result suggests that the toxic effect of the cyanobacterial secondary metabolites is mostly affecting basal cell metabolism rather than targeting specific organisms. In one of studied strains, Cylindrospermum sp. C24/1989, novel lipopeptides puwainaphycin F and G have been detected, isolated and their structure and biological effect have been characterized. Both of these structures interfere with eucaryotic membranes and cause a Ca2+ leakage into the cell. Subsequently, an enhanced tyrosine phosohorylation and relocalization of f-actin in the cell was observed. Lastly, the correlation between metabolite production and the reconstructed phylogeny was studied in planktonic Dolichospermopsis strains. Most of the detected compounds were found to be randomly disspersed across the reconstructed phylogeny and thus cannot be considered as good chemotaxonomic markers. This result also hampers the possible detection of toxic cyanobacteria by morphological methods or molecular detection based on the 16SrDNA gene.
|
|
|
Analysis of the role of PilA proteins in the cyanobacterium \kur{Synechocystis} sp. PCC 6803.
LINHARTOVÁ, Markéta
The PilA proteins are major components of pili fibres which are essential for motility in bacteria. This project was focused on the role of the PilA proteins in cyanobacteria, specifically in the alternative functions that are not directly related to motility. The major task of this project was also to develop a method for the purification of the PilA1 protein from Synechocystis under native conditions and to analyze purified PilA1 protein in detail.
|
|
| |
|
|
Cytotoxicita bentických a nárostových sinic
SKÁCELOVÁ, Kateřina
Cílem práce bylo stanovit cytotoxickou aktivitu 14 kmenů bentických sinic proti buněčné linii HeLa. Extrakty kmenů vykazující silnou cytotoxicitu byly analyzovány a frakcionovány za pomocí HPLC-MS, za účelem zjištění aktivní frakce. Mechanismus účinku těchto frakcí na buňky byl sledován pomocí imunofluorescenčního barvení. Dva ze 14 studovaných kmenů vykazovaly silnou cytotoxickou aktivitu. Extrakt sinice Cylindrospermum sp. CY OM obsahoval aktivní frakci způsobující apoptózu a dále frakci narušující buněčnou adhezi. Aktivita kmene Anabaena oscillarioides HINDAK 1984/43 byla způsobena dvěmi cytotoxickými frakcemi, v jedné z nich byl zjištěn nový lineární peptid.
|
host ::
RSS.