|
| |
|
|
Anabaena - Phenotypic and genotypic diversity of planktonic strains in fishponds and reservoirs of the Czech Republic
ZAPOMĚLOVÁ, Eliška
U 61 populací sinic r. Anabaena příslušejících ke 13 různým morfotypům byla popsána morfologická diverzita v přírodních podmínkách českých rybníků a přehradních nádrží. Následně byl aplikován polyfázický přístup v klasifikaci 45 klonálních kmenů izolovaných z těchto populací. Podrobná morfologická analýza byla provedena a parciální sekvence 16S rRNA genu byla získána pro 33 z těchto kmenů. Produkce sekundárních metabolitů byla stanovena u 20 vybraných kmenů. U vybraných kmenů byla studována jejich teplotní a světelná růstová optima a také plasticita jejich morfologických charakteristik v různých světelných a teplotních podmínkách a v různých koncentracích fosforu a dusíku. Výsledky byly diskutovány s ohledem na vymezení jednotlivých morfotypů r. Anabaena. Nový rod Sphaerospermum byl ustanoven pro morfotypy Anabaena kisselevina, A. reniformis a Aphanizomenon aphanizomenoides, jejichž fenotypové i genotypové vlastnosti se výrazně lišily od ostatních morfotypů r. Anabaena. Mimo to byla podána první informace o recentním výskytu a rozšíření A. reniformis a Aph. aphanizomenoides v České Republice.
|
|
|
Floristická studie vodních sinic a řas v jihovýchodní části kraje Vysočina
MELICHAR, Antonín
V roce 2009 byly odebrány vzorky planktonu ze 45 lokalit v kraji Vysočina. Bylo studováno druhové složení a relativní abundance druhů; byly měřeny ekologické faktory jako pH, vodivost, teplota, průhlednost a obsah rozpuštěných iontů. Byly vypočteny hodnoty ekologických indexů (Shannonův a Simpsonův index diverzity) a ty byly poté porovnány s ostatními ekologickými faktory. Byl vytvořen seznam všech druhů nalezených v kraji Vysočina. Bylo nalezeno 262 druhů a 4 druhy nové pro ČR.
|
|
|
Metabolic rhythms of unicellular, nitrogen fixing cyanobacteria and possible interplay with modeled KaiABC circadian oscillator
Červený, Jan ; Nedbal, Ladislav
Circadian clocks of living organisms provide evolutionary advantage and make living in dynamic environment more efficient. The clocks affect human lives and health as well as control the simplest organisms such as prokaryotic cyanobacteria. The cyanobacteria represent an excellent model that is amendable to a multitude of genetic, biochemical, and biophysical methods. The cyanobacterium, Cyanothece sp. ATCC 51142 relies on the circadian clock to permit, in the same cell, anoxygenic nitrogen fixation at night and oxygenic photosynthesis during solar day. We measured real-time, in-situ photosynthetic and respiratory activities as well as the culture growth under light forcing conditions and also under constant light, i.e. free-running mode. Interestingly, the experiments show a strong 24h-period dynamic pattern that is replaced by apparent 12h-period in free running mode. The 24h-pattern does not change significantly when changing the light/dark ratio from 16hL/8hD to 12hL/12hD and 8hL/16hD. Furthermore, we tried to elucidate connection between these metabolic rhythms and known structure of KaiABC circadian oscillator by means of mathematical modeling. One of simulation results show a strong correlation between the presumed catabolic event indicated by significant peak in respiratory activity, and simulated dynamics of KaiB4 complex in modeled circadian pacemaker. A causal relationship between these 2 events is suggested because KaiB4 facilitates dephosphorylation of KaiC6 hexamer, which is known to signal upcoming dark period.
Plný text:  PDF
|
|
|
Změny kvality vody v koupalištích ve volné přírodě a v koupacích oblastech v průběhu letní sezóny
MARŠÁLKOVÁ, Alena
Dobrá kvalita vody ke koupání je stále významnejší faktor, podle kterého si vybíráme letní dovolenou, místo víkendového pobytu nebo cíl výletu. V Ceské republice lze vody ke koupání rozdelit dle zákonného statutu na koupalište ve volné prírode, povrchové vody využívané ke koupání (tzv. koupací oblasti), ostatní vodní plochy nebo koupalište umelá. V diplomové práci jsem se zabývala pouze koupališti ve volné prírode a koupacími oblastmi. Rozdíl mezi nimi spocívá v tom, že koupalište ve volné prírode má svého provozovatele, který sleduje jakost vody a zabezpecuje další služby na brehu. Obvykle je zde vybíráno vstupné. Koupací oblasti nemají žádného provozovatele a sledováními jakosti vody jsou povereny príslušné krajské hygienické stanice. V Ceské republice je v soucasné dobe pravidelne, každou koupací sezónu, sledováno 188 koupališt ve volné prírode a koupacích oblastí. Pro svuj výzkum jsem vybrala ctyri lokality z kraje Jihomoravského a ctyri z kraje Jihoceského. Ke každé z techto osmi lokalit jsem shromáždila výsledky laboratorních analýz vcetne kategorií jakosti vody za koupací sezóny posledních peti let, tedy od roku 2005. Pomocí techto získaných dat jsem posuzovala vývoj kvality vody jak v prubehu koupací sezóny roku 2009, tak její vývoj v posledních peti letech. Na základe jednotlivých kategorií jakosti vody jsem se také pokusila o srovnání kvality vody v Jihomoravském a Jihoceském kraji a také o srovnání kvality vody mezi jednotlivými odberovými místy jedné lokality. Posledním zámerem bylo zhodnocení nekterých opatrení a zákroku za úcelem zlepšení kvality vody. Zde jsem se zamerila zejména na rybník Olšovec v Jihomoravském kraji a VN Orlík v Jihoceském kraji. Z výsledku vyplývá, že zmeny kvality vody v prubehu koupací sezóny 2009 ani v prubehu posledních peti let nejsou nijak markantní. Výraznejší výkyvy v kvalite vody byly zaznamenány pouze u nekterých lokalit v prubehu koupací sezóny 2007. Ani mezi jednotlivými kraji nebyly v kvalite vody zjišteny významné rozdíly. Podíl jednotlivých kategorií jakosti vody se mezi temito dvema kraji nelišil o více jak o 4%. Dá se tedy ríci, že kvalita vody ve vybraných lokalitách Jihomoravského a Jihoceského kraje je srovnatelná. Co se týce nekterých zákroku a opatrení provádených za úcelem zlepšení kvality vody, je duležité zamerit pozornost také na širší okolí dané lokality, protože práve to muže být casto zdrojem látek zhoršujících kvalitu vody.
|
|
|
Cytotoxicita a produkce sekundárních metabolitů u sinic
HROUZEK, Pavel
Cyanobacteria are well-known producers of secondary metabolites of different chemical structures and a wide range of biological functions. In the present thesis, the cytotoxic activity of cyanobacteria, originating from different habitats, was studied in order to reveal whether cytotoxicity is an environmentally dependent characteristic. In addition, the data were compared with the toxicity of these extracts to the model invertebrate Artemia salina. The obtained data suggest that cytotoxic cyanobacteria are favoured under some conditions and thus more frequent in particular localities. The majority of the studied extracts and fractions exhibited cytotoxitity to the Sp/2 cell line not accompanied by toxicity to A. salina. Moreover, in most of the strains with both activities to A. salina and Sp/2 cells the toxic effect was caused by an identical fraction. This result suggests that the toxic effect of the cyanobacterial secondary metabolites is mostly affecting basal cell metabolism rather than targeting specific organisms. In one of studied strains, Cylindrospermum sp. C24/1989, novel lipopeptides puwainaphycin F and G have been detected, isolated and their structure and biological effect have been characterized. Both of these structures interfere with eucaryotic membranes and cause a Ca2+ leakage into the cell. Subsequently, an enhanced tyrosine phosohorylation and relocalization of f-actin in the cell was observed. Lastly, the correlation between metabolite production and the reconstructed phylogeny was studied in planktonic Dolichospermopsis strains. Most of the detected compounds were found to be randomly disspersed across the reconstructed phylogeny and thus cannot be considered as good chemotaxonomic markers. This result also hampers the possible detection of toxic cyanobacteria by morphological methods or molecular detection based on the 16SrDNA gene.
|
|
|
Analysis of the role of PilA proteins in the cyanobacterium \kur{Synechocystis} sp. PCC 6803.
LINHARTOVÁ, Markéta
The PilA proteins are major components of pili fibres which are essential for motility in bacteria. This project was focused on the role of the PilA proteins in cyanobacteria, specifically in the alternative functions that are not directly related to motility. The major task of this project was also to develop a method for the purification of the PilA1 protein from Synechocystis under native conditions and to analyze purified PilA1 protein in detail.
|
|
|
Cytotoxicita bentických a nárostových sinic
SKÁCELOVÁ, Kateřina
Cílem práce bylo stanovit cytotoxickou aktivitu 14 kmenů bentických sinic proti buněčné linii HeLa. Extrakty kmenů vykazující silnou cytotoxicitu byly analyzovány a frakcionovány za pomocí HPLC-MS, za účelem zjištění aktivní frakce. Mechanismus účinku těchto frakcí na buňky byl sledován pomocí imunofluorescenčního barvení. Dva ze 14 studovaných kmenů vykazovaly silnou cytotoxickou aktivitu. Extrakt sinice Cylindrospermum sp. CY OM obsahoval aktivní frakci způsobující apoptózu a dále frakci narušující buněčnou adhezi. Aktivita kmene Anabaena oscillarioides HINDAK 1984/43 byla způsobena dvěmi cytotoxickými frakcemi, v jedné z nich byl zjištěn nový lineární peptid.
|
|
|
Cytotoxicita vláknitých sinic v návaznosti na jejich ekologii
TOMEK, Petr
Cílem této studie bylo vyhodnotit cytotoxickou aktivitu 53 kmenů sinic rodů Nostoc a Anabaena pocházejících z různých biotopů a porovnat její výskyt v závisloti na ekologii zkoumaných izolátů. Složení aktivních extraktů bylo vyhodnoceno pomocí HPLC-MS. Kmeny obsahující neznámé sekundární metabolity se silným cytotoxickým efektem byly podrobněji analyzovány a frakcionovány. Získané aktivní frakce byly dále charakterizovány pomocí HPLC-MS a TLC postupu. Nakonec byla hodnocena toxicita vybraných kmenů v závislosti na expoziční koncentraci a čase.
|
|
| |
host ::
RSS.