|
|
Interactions of Trypanosoma brucei FOF1 ATP Synthase Subunits - An Application of Yeast Two Hybrid
GUGGENBERGER, Matthias
Trypanosoma brucei je jednobuněčný parazit způsobující závažnou spavou nemoc u lidí a nemoc zvanou nagana u zvířat. Tato onemocnění jsou endemická v rozvojových zemí subsaharské Afriky. I když v poslední době klesá počet nakažených lidí, spavá nemoc je letální pokud je neléčena. Bohužel i dostupná léčba je silně nevyhovující z důvodů své toxicity, efektivity vůči rezistentním kmenům a náročnosti na aplikaci. Proteinový komplex FoF1 ATPsyntáza je životně důležitý pro buňku parazita a jeho složení a funkce je rozdílná od komplexu buňky lidské. Kromě velmi dobře konzervativních podjednotek FoF1 ATP syntázy tento komplex také obsahuje nové podjednotky, které nemají homology mimo skupinu trypanozóm. I funkce tohoto komplexu je jedinečná, jelikož tento komplex nevytváří ATP, jak jeho jméno napovídá, ale tuto molekulu hydrolyzuje za účelem vytvoření membránového potenciálu a tudíž funguje jako FoF1 ATPáza. Díky těmto vlastnostem je tento proteinový komplex považován za možný cíl pro vývoj nových chemoterapeutik. Detailní zkoumání tohoto komplexu může osvětlit funkci nových podjednotek a také jejich pozici v rámci komplexu. Z tohoto důvodu jsme se rozhodli studovat proteinové interakce znamých i nových podjednotek in vivo metodou ?yeast-two-hybrid?. Z dostupných výsledků je patrné, že tento přístup je možný a přínosný a pomůže vytvořit mapu proteinových interakcích podjednotek FoF1 ATPázového komplexu u T. brucei.
|
|
|
Studium interakce membránových proteinů na molekulární úrovni pomocí silové spektroskopie, optické spektroskopie a metod výpočetní biochemie
MATĚNOVÁ, Martina
Práce se zabývá studiem role malých aminokyselin v proteinových interakcích za využití experimentálních a teoretických metod. Na základě simulace molekulární dynamiky peptidů představujících zjednodušený model D helixů D1 a D2 proteinů reakčního centra fotosystému II byla formulována hypotéza o interakcích mezi těmito peptidy. Stabilita předpokládaných vodíkových vazeb byla studována experimentálně pomocí silové spektroskopie na mikroskopu atomárních sil. Výsledky obou metod se shodují v tom, že D1-Gly208 hraje zásadní roli ve stabilitě a funkčnosti fotosystému II tím, že vytváří podmínky pro vznik slabých interakcí mezi třemi kontaktními místy helixů: D1-Gly208 (O) a D2-Cys211 (O?), D1-Ser209 (O?) a D2-Ile204 (O), D1-Ser212 (O?) a D2-Gly207 (O). Mutace D1-Gly208 vede ke zvýšené pravděpodobnosti vazby mezi výše zmíněnými aminokyselinami a zvyšuje tak sílu celkové interakce mezi proteiny, [11:08:37 AM] David Kaftan: coz vede k mirnemu snizeni fotosynteticke kapacity PSII (D1-Ser208) nebo k takovym zmenam ve funkcnosti PSII jenz vedou k letalnimu fenotypu (D1-Val208).
|
|
|
Studium interakce membránových proteinů na molekulární úrovni pomocí silové spektroskopie, optické spektroskopie a metod výpočetní biochemie
MATĚNOVÁ, Martina
Práce se zabývá studiem role malých aminokyselin v proteinových interakcích za využití experimentálních a teoretických metod. Na základě simulace molekulární dynamiky peptidů představujících zjednodušený model D helixů D1 a D2 proteinů reakčního centra fotosystému II byla formulována hypotéza o interakcích mezi těmito peptidy. Stabilita předpokládaných vodíkových vazeb byla studována experimentálně pomocí silové spektroskopie na mikroskopu atomárních sil. Výsledky obou metod se shodují v tom, že D1-Gly208 hraje zásadní roli ve stabilitě a funkčnosti fotosystému II tím, že vytváří podmínky pro vznik slabých interakcí mezi třemi kontaktními místy helixů: D1-Gly208 (O) a D2-Cys211 (O?), D1-Ser209 (O?) a D2-Ile204 (O), D1-Ser212 (O?) a D2-Gly207 (O). Mutace D1-Gly208 vede ke zvýšené pravděpodobnosti vazby mezi výše zmíněnými aminokyselinami a zvyšuje tak sílu celkové interakce mezi proteiny, [11:08:37 AM] David Kaftan: coz vede k mirnemu snizeni fotosynteticke kapacity PSII (D1-Ser208) nebo k takovym zmenam ve funkcnosti PSII jenz vedou k letalnimu fenotypu (D1-Val208).
|
host ::
RSS.