|
|
A high-temperature LC-MS method for bottom-up proteomic analyses with reduced artifacts
Starovoit, Mykyta ; Lenčo, Juraj (vedoucí práce) ; Sklenářová, Hana (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra analytické chemie Kandidát: Mykyta Starovoit Školitel: PharmDr. Juraj Lenčo, Ph.D. Název diplomové práce: Vysokoteplotní LC-MS metoda pro bottom-up proteomické analýzy se sníženým výskytem artefaktů Proteomické bottom-up LC-MS analýzy vyžadují účinnější chromatografickou separaci, aby udržely krok s rozvojem hmotnostní spektrometrie a plně tak využily potenciál i těch nejmodernějších MS přístrojů. Zvýšení teploty separační kolony představuje jedno z nejefektivnějších a nejdostupnějších řešení, jak separaci peptidů v proteomických aplikacích zlepšit. Vysoká teplota však zároveň vede ke vzniku nežádoucích modifikací v chemické struktuře peptidů, což proteomické analýzy významně komplikuje. Tato metoda je zaměřená na snížení výskytu artefaktů vznikajících na koloně za vysoké teploty. Řešením je zavedení nového vysokoprůtokového trap-elute systému za použití rozdílného vyhřívání kolon. Vyvinuté trap-elute uspořádání zkracuje čas, který peptidy stráví na vyhřívané separační koloně, což snižuje počet vzniklých modifikovaných peptidů. Zmirňuje to jeden z negativních následků využití zvýšené teploty, avšak neomezuje její pozitivní vliv na separační účinnost. Ve výsledku se použití vysoké teploty kolony stává výhodnější cestou ke zlepšení...
|
host ::
RSS.