|
|
Lokalizace intrakraniálních hemoragií v axiálních řezech CT snímků hlavy.
Kopečný, Kryštof ; Chmelík, Jiří (oponent) ; Nemček, Jakub (vedoucí práce)
Tématem této práce je lokalizace intrakraniálních krvácení na snímcích počítačové tomografie pomocí jednofázového a dvoufázového detektoru založených na konvolučních neuronových sítích. Práce mimo základní poznatky z umělé inteligence klíčové pro pochopení procesu detekce objektů podává medicínské informace o patologii a zobrazování krvácení. Znalosti ze zmíněných okruhů se využijí pro vlastní návrh algoritmu pracujícím s veřejně dostupnými databázemi CT snímků hlavy a jejich anotací CQ500 a BHX. Součástí práce je vyhodnocení výsledků a jejich diskuse.
|
|
|
Thrombi detection in main brain arteries in CT image data
Líška, Martin ; Nemček, Jakub (oponent) ; Chmelík, Jiří (vedoucí práce)
The master’s thesis deals with automatic preprocessing, segmentation and consecutive analysis of volume data of anonymized patient CTA acquisitions with an indication of stroke. Preprocessing of volume data is an essential step for proper vascular tree segmentation and analysis. The region growing method was used to segment the vascular tree of the brain. After extracting the vascular tree, the labeling of individual branches was applied in the algorithm and the appropriate features were extracted. The analysis examined the features of vessel lengths, their diameter and local brightness profiles, which are important indicators of possible stenosis or occlusion of the main vessels of the brain. The output of the algorithm are various modalities of diagnostic, assisted visualizations of the segmented vascular tree. The segmentation and analysis algorithm of cerebrovascular system was created in the MATLAB programming environment.
|
|
|
Detekce a segmentace lumbálních obratlů v 3D CT datech
Nemček, Jakub ; Kolář, Radim (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Práca sa zaoberá detekciou a segmentáciou lumbálnych stavcov v CT obrazových dátach. Popísaná detekčná metóda je založená na používaní natrénovaného SVM klasifikátora a histogramoch orientovaných gradientov ako obrazových príznakoch. Detekcia je aplikovaná na dvojrozmerné sagitálne rezy CT obrazu. Segmentácia je realizovaná metódou deformovania trojuholníkových mriežkových modelov získaných zo spriemerovaných stavcov z reálnych CT dát. V prvej časti práce sú popísané potrebné teoretické poznatky o anatómii osového skeletu, počítačovej tomografii, metódach spracovania obrazu a o problematike detekcie a segmentácie. Druhá časť obsahuje postup realizácie algoritmov, ďalej vyhodnotenie a diskusiu výsledkov u detekčného a segmentačného algoritmu. Na záver je diskutované možné využitie algoritmov v CAD systémoch. Aplikácia všetkých praktických bodov je realizovaná v programovacom prostredí Matlab.
|
|
|
Segmentace meziobratlové ploténky v obrazových datech
Meloun, Jan ; Nemček, Jakub (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Práce je zaměřena segmentaci meziobratlové ploténky v obrazových datech. Úvod prácese věnuje problematice páteře, výhřezu meziobratlové ploténky. Dále se věnuje zobrazo-vacím modalitám, především výpočetní tomografii a magnetické rezonanci. V praktickéčásti práce je popsána segmentace obrazových dat a následně provedena. realizace tří zpublikovaných segmentačních metod.
|
|
|
Detection of intracranial hemorrhages in head CT data
Nemček, Jakub ; Jan, Jiří (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
This thesis deals with the detection of intracranial haemorrhages and their type classification in head CT images. The method of haemorrhages detection is based on a series of classifiers of the presence and type of haemorrhages in 2D CT slices in axial, sagittal and coronal plane, that may localise the bleedings and determine their types. The classifiers are based on the convolutional neural network architecture Inception-ResNet-v2. The head CT dataset CQ500 which is made available for public access, is used for the experiments. The thesis describes an additional manual annotation of the data, as the available annotations are insufficient for the purposes of the experiments. This thesis includes a theoretical basis of the essential medical knowledge, machine learning based classification and detection methods, and the detection algorithm proposal, realisation and testing. The algorithm performance is evaluated and discussed together with the potential implementation of the algorithm in computer-aided diagnosis systems.
|
|
|
Segmentace meziobratlové ploténky v obrazových datech
Meloun, Jan ; Nemček, Jakub (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Práce je zaměřena na segmentaci meziobratlových plotének v obrazových datech z dvou medicínských zobrazovacích modalit - výpočetní tomografie (CT) a zobrazovaní pomocí magnetické rezonance (MRI). Teoretický úvod práce se věnuje problematice výhřezu meziobratlové ploténky a popisu relevantních zobrazovacích modalit. Též je uveden teoretický popis základních a pokročilých segmentačních metod. V praktické části byly vybrány a implementovány tři různé segmentační metody (jedna pro CT data a dvě pro obrazy z MRI), které byli aplikovány na obrazy získané z Radiodiagnostického oddělení Nemocnice Havlíčkův Brod. Úspěšnost segmentace byla vyhodnocena kvantitativně porovnáním výsledků jednotlivých metod s manuálně vytvořenou referenční segmentací meziobratlových plotének.
|
|
|
Vytvoření automatizovaného měřicího pracoviště pro nábojová a vysokoimpedanční měření
Nemček, Jakub ; Bartušek, Karel (oponent) ; Gescheidtová, Eva (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce je o vytvoření automatizovaného měřicího pracoviště pro nábojová a vysokoimpedanční měření. Toto automatizované měřicí pracoviště je realizováno pomocí válcového aspiračního kondenzátoru, který je připojen přes diferenciální převodník U/I k měřicí ústředny HP 34970A. Ústředna je zároveň připojena pomocí sériové linky RS-232 k počítači tipu PC, na kterém je nainstalován řídící program Agilent VEE Pro 7.0, Agilent I/O Libraries verze M.01.01.04 a také Agilent Visa Com I/O a VXI Plug&Play driver pro HP34970A. Ke správnému propojení měřicí ústředny HP34970A a PC je nutné nastavení stejných parametru na této ústředně, tak i v I/O configu a také v Instrument manageru programu Agilent VEE Pro 7.0, kde se mimo jiné nastaví i Plug&Play driver pro HP34970A. Programování v Agilent VEE Pro 7.0 je založeno na objektově orientovaném programování. Sestavený program se spustí po stisknutí tlačítka “START“ a začne provádět automatické měření koncentrace vzdušných iontů, jehož trend vykresluje do grafu. Program dále indikuje jestli je zapnut/vypnut ventilátor,který vhání vzduch do aspiračního kondenzátoru a vykresluje trend napětí na tomto ventilátoru do grafu. Zastavení programu se provede stiskem tlačítka “STOP“. Změřená data exportuje mnou sestavený program do programu Excel, který musí být spuštěn před začátkem měření. Funkce programu je ověřena změřením pozadí kladných a záporných iontů, vlivem polohy zdroje iontů před aspiračním kondenzátorem a vlivem různých materiálů (plech, papírový karton, dřevo, vodivý nátěr) na koncentraci záporných iontů.
|
|
|
Lokalizace intrakraniálních hemoragií v axiálních řezech CT snímků hlavy.
Kopečný, Kryštof ; Chmelík, Jiří (oponent) ; Nemček, Jakub (vedoucí práce)
Tématem této práce je lokalizace intrakraniálních krvácení na snímcích počítačové tomografie pomocí jednofázového a dvoufázového detektoru založených na konvolučních neuronových sítích. Práce mimo základní poznatky z umělé inteligence klíčové pro pochopení procesu detekce objektů podává medicínské informace o patologii a zobrazování krvácení. Znalosti ze zmíněných okruhů se využijí pro vlastní návrh algoritmu pracujícím s veřejně dostupnými databázemi CT snímků hlavy a jejich anotací CQ500 a BHX. Součástí práce je vyhodnocení výsledků a jejich diskuse.
|
|
|
Thrombi detection in main brain arteries in CT image data
Líška, Martin ; Nemček, Jakub (oponent) ; Chmelík, Jiří (vedoucí práce)
The master’s thesis deals with automatic preprocessing, segmentation and consecutive analysis of volume data of anonymized patient CTA acquisitions with an indication of stroke. Preprocessing of volume data is an essential step for proper vascular tree segmentation and analysis. The region growing method was used to segment the vascular tree of the brain. After extracting the vascular tree, the labeling of individual branches was applied in the algorithm and the appropriate features were extracted. The analysis examined the features of vessel lengths, their diameter and local brightness profiles, which are important indicators of possible stenosis or occlusion of the main vessels of the brain. The output of the algorithm are various modalities of diagnostic, assisted visualizations of the segmented vascular tree. The segmentation and analysis algorithm of cerebrovascular system was created in the MATLAB programming environment.
|
|
|
Segmentace meziobratlové ploténky v obrazových datech
Meloun, Jan ; Nemček, Jakub (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Práce je zaměřena na segmentaci meziobratlových plotének v obrazových datech z dvou medicínských zobrazovacích modalit - výpočetní tomografie (CT) a zobrazovaní pomocí magnetické rezonance (MRI). Teoretický úvod práce se věnuje problematice výhřezu meziobratlové ploténky a popisu relevantních zobrazovacích modalit. Též je uveden teoretický popis základních a pokročilých segmentačních metod. V praktické části byly vybrány a implementovány tři různé segmentační metody (jedna pro CT data a dvě pro obrazy z MRI), které byli aplikovány na obrazy získané z Radiodiagnostického oddělení Nemocnice Havlíčkův Brod. Úspěšnost segmentace byla vyhodnocena kvantitativně porovnáním výsledků jednotlivých metod s manuálně vytvořenou referenční segmentací meziobratlových plotének.
|
host ::
RSS.