Hlavní stránka > Výsledky hledání: MALCHER, Pavel
Hledej:
Tipy pro vyhledávaní :: Rozšířené hledání
Hledej ve sbírkách:
Seřadit podle: Zobrazit výsledky: Výstupní formát:
Národní úložiště šedé literatury Nalezeno 2 záznamů.  Hledání trvalo 0.01 vteřin. 
Strukturní studie mutantní varianty halogenalkandehalogenasy DhaA106
 MALCHER, Pavel
Cílem diplomové práce bylo porovnání halogenalkandehalogenasy DhaA106 s jinými studovanými mutantními variantami téhož proteinu. Pro difrakční analýzu bylo nejprve nutno vypěstovat vhodné krystaly uvedeného proteinu. Pro krystalizaci byla použita základní metoda sedící kapky. Vypěstované tyčinkovité krystaly byly použity pro difrakční analýzu. Při difrakční analýze bylo získáno celkem 500 difrakčních záznamů, ze kterých byla vytvořena mapa elektronové hustoty a z níprostorový model molekulární struktury dehalogenasy.V modelu struktury byly následně přidány alternativní konformace aminokyselin, molekuly vody, zbytky srážecího roztoku a chlorid do aktivního místa. Po uvedené softwarové úpravě modelu byla provedena rafinacea validace finální struktury molekuly. Následně byla analyzována pentáda aminokyselin aktivního místa a celý protein. Hodnoty validace, rafinace a meziatomových vzdáleností v aktivním místě byly porovnány s několika mutantními variantami dehalogenasy, dále byly porovnány srážecí roztoky pro krystalizaci a sběr difrakčních dat. V posledním kroku práce byla studována interakce zvoleného substrátu na povrchu proteinu v blízkosti tunelu spojující aktivní místo s povrchem. Uvedená studie interakcí byla provedena na principu kombinace Monte-carlo metody s algoritmy predikce proteinové struktury.
Úplný záznam
Biodegradace environmentálních polutantů - charakterizace mutantní halogenalkandehalogenasy DhaA31 z Rhodococcus rhodochrous NCIMB 13064
 MALCHER, Pavel
Cílem práce bylo naučit se používat metody proteinové krystalografie v praxi a pokusit se připravit krystaly mutantní formy halogendehalogenasy DhaA31 a modelového proteinu Thermolysinu pomocí základních a pokročilých krystalizačních metod a následně vyřešit a graficky zobrazit jejich struktury pomocí počítačových nástrojů používaných pro molekulární modelování. Výsledkem projektu bylo vypěstování krystalů obou proteinů a popis struktury a aktivního místa proteinu DhaA31, který byl připraven z důvodu zvýšení rychlosti katalytické reakce při odbourávání chlorovaných derivátů uhlovodíků, především 1,2,3-trichlorpropanu (TCP) z volných vod.
Úplný záznam

Chcete být upozorněni, pokud se objeví nové záznamy odpovídající tomuto dotazu?
Přihlásit se k odběru RSS.
Digitální repozitář :: Hledej :: Nový záznam :: Personalizace :: Nápověda
Powered by Invenio v1.1.2
Spravuje admin.invenio@techlib.cz
Tato stránka je dostupná také v následujících jazycích:
Česky  English