|
|
Molecular mechanisms of genome integrity maintenance under conditions of replication stress
Boleslavská, Barbora ; Dobrovolná, Jana (vedoucí práce) ; Hanzlíková, Hana (oponent) ; Šebesta, Marek (oponent)
Přesné zdvojení chromozomální DNA je zásadní proces pro všechny dělící se buňky. V případě, že buňka nezvládne dokončit replikaci DNA, může tato skutečnost vést k buněčné smrti, případně k nezvratným změnám v genetické informaci, což může mít za následek tvorbu před-nádorových lézí a později vznik rakoviny. Sofistikovaný multiproteinový komplex zajišťující zdvojení DNA může být zpomalen či zastaven četnými překážkami jako jsou léze na DNA, sekundární DNA struktury ale i ostatními buněčnými aparáty jako je transkripční komplex. Čelní srážky replikace a transkripce asociované s tvorbou R-smyček jsou hlavním endogenním zdrojem genomové nestability. R-smyčky jsou genotoxické tří-vláknové struktury nukleových kyselin složené z RNA:DNA hybridu a nespárovaného vlákna DNA. Tyto R-smyčky mohou zastavit postup replikační vidlice. Eukaryotické buňky vyvinuly řadu mechanismů, které zajišťují odstranění anebo překonání překážek blokujících postup replikační vidlice, aby zajistily kompletní duplikaci DNA. Navzdory probíhajícímu intenzivnímu výzkumu nejsou zatím přesně pochopeny a definovány molekulární mechanismy, které zajišťují znovunastartování replikačních vidlic zastavených v důsledku interference s transkripčními komplexy a R-smyčkami. V této práci předkládáme naše poznatky o tom, jak lidské buňky za...
|
|
|
Genomic instability associated with formation of RNA:DNA hybrids and molecular mechanisms of its suppression
Naščáková, Zuzana ; Dobrovolná, Jana (vedoucí práce) ; Hanzlíková, Hana (oponent) ; Šolc, Petr (oponent)
Jednou z nejrozšířenějších infekcí lidského organizmu je infekce žaludku způsobená patogenní bakterií Helicobacter pylori (H. pylori). Předpokládá se, že tímto patogenem je nakažená každá druhá osoba a prevalence nákazy výrazně stoupá v méně rozvinutých zemích. H. pylori, jako nenápadný nepřítel, může kolonizovat prostředí žaludku po desítky let bez toho, aby se projevil jakýkoliv příznak onemocnění u infikované osoby. Avšak dlouhodobá infekce může způsobit závažné poškození žaludeční tkáně a následné onemocnění žaludku, jakými jsou gastritida, vředová nemoc nebo rakovina. Až 80 % karcinomů žaludku je spojeno s infekcí H. pylori, která je považována za hlavní faktor pro rozvoj tohoto onemocnění. Dlouhodobá přítomnost bakterií v lidském hostiteli je zabezpečena produkcí bakteriálních virulentních faktorů, které svou aktivitou utlumují imunitní systém. Nevratné změny epitelu žaludku jsou vyvolané aktivací imunitní odpovědi infikovaných buněk zprostředkované mimo jiné ALPK1/TIFA/NF-κB signální dráhou. Aktivátorem této signální dráhy je β-ADP-heptóza, meziprodukt biosyntézy bakteriálního lipopolysacharidu. Již dříve bylo ukázáno, že infekce buněk H. pylori a aktivace ALPK1/TIFA/NF-κB signální dráhy je spojena se zvýšeným výskytem dvouvláknových zlomů v DNA hostitelských buněk. My jsme pozorovali, že...
|
|
|
Regulation of promyelocytic leukemia protein expression
Dobrovolná, Jana
Dizertační práce - ABSTRAKT Jana Dobrovolná, rozená Vlasáková Tumor supresorový protein promyelocytární leukemie (PML) a PML jaderná tělíska (multiproteinové jaderné struktury charakterizované zvýšenou koncentrací PML proteinu) jsou zapojena v řadě buněčných procesů jako je regulace buněčné proliferace, apoptóza, buněčná senescence a odpověď na různé formy buněčného stresu (poškození DNA, tepelný šok, virová infekce). Přes intenzivní výzkum zůstávají regulační mechanismy ovlivňující expresi PML proteinu a jeho přesná funkce nejasné. Chromozomální translokace mezi geny kódujícími PML protein a receptor retinové kyseliny alfa způsobuje stabilizaci represorových komplexů, které zahrnují deacetylázy histonů, na promotorech genů regulovaných retinovou kyselinou a vede k akutní promyelocytární leukemii (APL). Trichostatin A (TSA), jeden s inhibitorů histonových deacetyláz, byl úspěšně použit k opětovné aktivaci exprese genu stimulovaných retinovou kyselinou v APL buňkách. V prezentované dizertační práci jsme se zaměřili na regulaci exprese PML proteinu v odpovědi na interferonovou signalizaci a popsali jsme interferenci inhibitorů histových deacetyláz (HDACIs) s touto dráhou. Ukázali jsme, že interferonem alfa indukované zvýšení hladin PML na úrovni mRNA a proteinu a následné zvýšení počtu jaderných tělísek PML...
|
|
|
Genomic instability associated with formation of RNA:DNA hybrids and molecular mechanisms of its suppression
Naščáková, Zuzana ; Dobrovolná, Jana (vedoucí práce) ; Hanzlíková, Hana (oponent) ; Šolc, Petr (oponent)
Jednou z nejrozšířenějších infekcí lidského organizmu je infekce žaludku způsobená patogenní bakterií Helicobacter pylori (H. pylori). Předpokládá se, že tímto patogenem je nakažená každá druhá osoba a prevalence nákazy výrazně stoupá v méně rozvinutých zemích. H. pylori, jako nenápadný nepřítel, může kolonizovat prostředí žaludku po desítky let bez toho, aby se projevil jakýkoliv příznak onemocnění u infikované osoby. Avšak dlouhodobá infekce může způsobit závažné poškození žaludeční tkáně a následné onemocnění žaludku, jakými jsou gastritida, vředová nemoc nebo rakovina. Až 80 % karcinomů žaludku je spojeno s infekcí H. pylori, která je považována za hlavní faktor pro rozvoj tohoto onemocnění. Dlouhodobá přítomnost bakterií v lidském hostiteli je zabezpečena produkcí bakteriálních virulentních faktorů, které svou aktivitou utlumují imunitní systém. Nevratné změny epitelu žaludku jsou vyvolané aktivací imunitní odpovědi infikovaných buněk zprostředkované mimo jiné ALPK1/TIFA/NF-κB signální dráhou. Aktivátorem této signální dráhy je β-ADP-heptóza, meziprodukt biosyntézy bakteriálního lipopolysacharidu. Již dříve bylo ukázáno, že infekce buněk H. pylori a aktivace ALPK1/TIFA/NF-κB signální dráhy je spojena se zvýšeným výskytem dvouvláknových zlomů v DNA hostitelských buněk. My jsme pozorovali, že...
|
|
|
Úloha helikázy RECQ5 při stabilizaci a opravě replikačních vidlic po jejich kolizi s transkripčním komplexem
Fryzelková, Jana ; Dobrovolná, Jana (vedoucí práce) ; Vopálenský, Václav (oponent)
V průběhu replikace může docházet působením různých vnějších a vnitřních faktorů ke zpomalení či zastavení replikačních vidlic. Tento stav je označovaný jako replikační stres, který je velmi významným zdrojem genomové nestability pozorované v rakovinných buňkách. Jedním z endogenních faktorů, který představuje pro replikační komplex překážku, je transkripční aparát. Především za podmínek zvýšeného replikačního stresu jsou replikační vidlice postupující transkripčně aktivními oblastmi genomu zpomaleny nebo zastaveny, což vede k následnému kolapsu těchto vidlic spojeném s tvorbou dvouvláknových zlomů DNA. Na zachování genomové stability právě při působení replikačního stresu se významně podílí DNA helikáza RECQ5, avšak mechanismy jejího působení nejsou jasné. Tato práce ukázala, že se helikáza RECQ5 účastní řešení kolizí mezi replikačním a transkripčním komplexem v součinnosti s proteinem BRCA1. Protein BRCA1 je klíčovým faktorem procesu homologní rekombinace, jenž je nezbytný pro restart zastavených replikačních vidlic. Dále bylo ukázáno, že se helikáza RECQ5 podílí na ubiquitinaci proteinu PCNA u zastavených replikačních vidlic. Klíčová slova DNA helikáza RECQ5, replikační stres, kolize replikačního a transkripčního komplexu, protein BRCA1, ubiquitinace PCNA, restart replikace
|
|
|
Regulation of promyelocytic leukemia protein expression
Dobrovolná, Jana
Dizertační práce - ABSTRAKT Jana Dobrovolná, rozená Vlasáková Tumor supresorový protein promyelocytární leukemie (PML) a PML jaderná tělíska (multiproteinové jaderné struktury charakterizované zvýšenou koncentrací PML proteinu) jsou zapojena v řadě buněčných procesů jako je regulace buněčné proliferace, apoptóza, buněčná senescence a odpověď na různé formy buněčného stresu (poškození DNA, tepelný šok, virová infekce). Přes intenzivní výzkum zůstávají regulační mechanismy ovlivňující expresi PML proteinu a jeho přesná funkce nejasné. Chromozomální translokace mezi geny kódujícími PML protein a receptor retinové kyseliny alfa způsobuje stabilizaci represorových komplexů, které zahrnují deacetylázy histonů, na promotorech genů regulovaných retinovou kyselinou a vede k akutní promyelocytární leukemii (APL). Trichostatin A (TSA), jeden s inhibitorů histonových deacetyláz, byl úspěšně použit k opětovné aktivaci exprese genu stimulovaných retinovou kyselinou v APL buňkách. V prezentované dizertační práci jsme se zaměřili na regulaci exprese PML proteinu v odpovědi na interferonovou signalizaci a popsali jsme interferenci inhibitorů histových deacetyláz (HDACIs) s touto dráhou. Ukázali jsme, že interferonem alfa indukované zvýšení hladin PML na úrovni mRNA a proteinu a následné zvýšení počtu jaderných tělísek PML...
|
|
|
Regulation of promyelocytic leukemia protein expression
Dobrovolná, Jana ; Hodný, Zdeněk (vedoucí práce) ; Novotný, Jiří (oponent) ; Kovarik, Pavel (oponent)
4. CONCLUSIONS Major resultsof this PhD thesiscanbe summarizedas follows: |. For full tÍanscTiptionalactivationof ISG @ML' Sp100'IRFI) by inteďeronor'the deaceýlationof unknownfactor(s)is necessary.IFNer.inducedexpressionof PML at mRNA andproteinlevel and zubsequentincreaseof PML NBs are suppressedby all tested HDACIs independentlyon cellular origin. Importantly,baml (i.e. IFNc- nonstimulated)expressionof PML is not influencedby ÍIDACIs. The classical Jak. STAT pathwaymediatingtransitionof IFNo signalremainsunaffectedby HDACIs and the targetof HDACIs lies downstreamof ISGF3 binding to PML promoter. AdverseaffectsofHDACIs usedin clinical praxisarepredicted. 2. Human mesenchymalstem cells (gfowing, confluent or terminally differentiated) expressPML protein,form PML nuclearboďes and respondto IFNcr teaEnent by dramaticelevationof PML mRNA andproteinlevels and mďerate increaseof PML NBs. Numberof PML NBs per cell nucleusis depende,nton thecultureproliferative age. ln normal diploid but not in immorbl cells PML forms various nucleoli- associatedshuctuÍes.The localization of PML into nucleoli is teestablishedin senescentcells. The importanc€ of PML association with nucleoli for its fumor suppressoractivitiesis hypothesized. 3. Drug-induced senescencein several human cell lines leads to increased PML...
|
|
|
Problematika zásob z hlediska českých účetních předpisů a mezinárodních standardů s rozšířením o audit dané oblasti
Dobrovolná, Jana ; Roubíčková, Jaroslava (vedoucí práce) ; Černý, Václav (oponent)
Diplomová práce se zabývá problematikou zásob ze dvou různých pohledů, a to z hlediska českých účetních předpisů a Mezinárodních standardů účetního výkaznictví IAS/IFRS, včetně doplnění o oblast auditu zásob. Pozornost je věnována samotnému postavení zásob v majetku podniku, vymezení pojmu, základní charakteristice zásob, české legislativní úpravě a úpravě dle IAS/IFRS, systémům evidence zásob, způsobům a technikám oceňování, auditorským postupům a také konkrétním postupům auditu oblasti zásob.
|
|
| |
host ::
RSS.