|
|
Detekce genomových variací
Beluský, Tomáš ; Vogel, Ivan (oponent) ; Martínek, Tomáš (vedoucí práce)
Vliv variací v lidském genomu je znatelný již při prvním pohledu na člověka, kde se projevují odlišnosti mezi jedinci i celými populacemi. Rovněž chování, nebo pravděpodobnost výskytu určité choroby jsou do značné míry ovlivněny právě změnami na úrovni genomu. Tato práce se zabývá studiem metod detekujících variace v lidském genomu, které byly vyvinuty po nástupu druhé generace sekvenovacích technologií. V rámci této práce byl dále navržen a implementován nový nástroj kombinující metodu read pair a metodu split read s využitím informace o hloubce pokrytí. Nástroj byl otestován na simulačních i reálných datech a porovnán s referenčními výstupy.
|
|
|
Evoluční návrh neuronových sítí
Beluský, Tomáš ; Vašíček, Zdeněk (oponent) ; Minařík, Miloš (vedoucí práce)
Práce se zabývá vytvořením genetického algoritmu pro návrh struktury a učení neuronových sítí. Fitness funkce zahrnuje i počet skrytých neuronů a tím získáváme nejoptimálnější možné struktury. Představí se vlastní verze operátorů, které řídí celý proces evoluce. Výsledkem práce je knihovna pro evoluční návrh neuronových sítí a kromě ní bylo vytvořeno i grafické rozhraní pro nastavování parametrů a zobrazování výsledků. V experimentální části je návrh porovnán s jinými systémy a algoritmy. Na závěr jsou zhodnoceny výsledky a naznačen postup pro následující vývoj systému.
|
|
|
Evoluční návrh neuronových sítí
Beluský, Tomáš ; Vašíček, Zdeněk (oponent) ; Minařík, Miloš (vedoucí práce)
Práce se zabývá vytvořením genetického algoritmu pro návrh struktury a učení neuronových sítí. Fitness funkce zahrnuje i počet skrytých neuronů a tím získáváme nejoptimálnější možné struktury. Představí se vlastní verze operátorů, které řídí celý proces evoluce. Výsledkem práce je knihovna pro evoluční návrh neuronových sítí a kromě ní bylo vytvořeno i grafické rozhraní pro nastavování parametrů a zobrazování výsledků. V experimentální části je návrh porovnán s jinými systémy a algoritmy. Na závěr jsou zhodnoceny výsledky a naznačen postup pro následující vývoj systému.
|
|
|
Detekce genomových variací
Beluský, Tomáš ; Vogel, Ivan (oponent) ; Martínek, Tomáš (vedoucí práce)
Vliv variací v lidském genomu je znatelný již při prvním pohledu na člověka, kde se projevují odlišnosti mezi jedinci i celými populacemi. Rovněž chování, nebo pravděpodobnost výskytu určité choroby jsou do značné míry ovlivněny právě změnami na úrovni genomu. Tato práce se zabývá studiem metod detekujících variace v lidském genomu, které byly vyvinuty po nástupu druhé generace sekvenovacích technologií. V rámci této práce byl dále navržen a implementován nový nástroj kombinující metodu read pair a metodu split read s využitím informace o hloubce pokrytí. Nástroj byl otestován na simulačních i reálných datech a porovnán s referenčními výstupy.
|
host ::
RSS.