|
|
Příprava neprosinu I - unikátní kyselé proteasy s potenciálem pro použití ve strukturní biologii, proteomice a terapii glutenových intolerancí.
Pelechová, Kamila ; Man, Petr (vedoucí práce) ; Šmídová, Aneta (oponent)
Proteasy se vyskytují napříč všemi říšemi, od virů a mikroorganismů po rostliny a živočichy, včetně lidí. Pro živé organismy jsou nezbytné. Degradují proteiny na peptidy a jednotlivé aminokyseliny, což umožňuje organismům lépe vstřebávat živiny. Zároveň plní funkci regulátoru - kontrolují buněčný cyklus, jsou zodpovědné za přeměnu prekurzorů na biologicky aktivní látky, jsou součástí signalizačních kaskád. Díky svým vlastnostem jsou proteasy využívány pro terapeutické účely a nalézají uplatnění i v průmyslu a výzkumu. Tato práce se zabývá produkcí rekombinantně připraveného neprosinu - nově objevené prolyl-endopeptidasy izolované z masožravých rostlin Nepenthes ventrata. Jedná se o kyselou proteasu s potenciálem pro využití ve strukturní biologii, proteomice a medicíně. Díky své schopnosti štěpit především C-koncové prolinové zbytky se neprosin stává slibnou možností pro enzymovou terapii celiakie.
|
|
|
Strukturní studie komplexů proteinů 14-3-3
Šmídová, Aneta
Proteiny 14-3-3 jsou malé regulační biomolekuly, které jsou významné pro mnoho důležitých metabolických nebo signálních drah. Tyto konzervované proteiny byly identifikovány ve všech typech eukaryotních buněk a ovlivňují např. aktivitu a stabilitu svých vazebných partnerů, jejich buněčnou lokalizaci a interakce s dalšími proteiny. Proteiny 14-3-3 jsou předmětem výzkumu mnoha laboratoří zejména pro svoji klíčovou úlohu v regulaci mnoha biologických procesů včetně neurodegenerativních onemocnění, rakoviny a dalších patologických stavů. Předkládaná dizertační práce se zabývá studiem proteinů 14-3-3 a několika vazebných partnerů, které jsou důležité pro různé metabolické procesy u člověka nebo kvasinek. Vzhledem k významnému počtu již potvrzených interakčních partnerů proteinů 14-3-3 je jejich strukturní charakterizace klíčová pro pochopení mechanismu jejich působení v rozmanitých buněčných procesech. V této práci je zkoumán mechanismus regulace kvasničné neutrální trehalasy 1, dále inhibice lidské kaspasy-2 a vliv proteinu 14-3-3 na regulaci kvasničného cytoplasmatického Na+ ,K+ /H+ antiporteru Nha1. V rámci výzkumu byla použita široká škála metod strukturní biologie, dominovaly fluorescenční metody a proteinová krystalografie. Na základě získaných dat byla vyřešena krystalová struktura plně aktivní...
|
|
|
Příprava neprosinu I - unikátní kyselé proteasy s potenciálem pro použití ve strukturní biologii, proteomice a terapii glutenových intolerancí.
Pelechová, Kamila ; Man, Petr (vedoucí práce) ; Šmídová, Aneta (oponent)
Proteasy se vyskytují napříč všemi říšemi, od virů a mikroorganismů po rostliny a živočichy, včetně lidí. Pro živé organismy jsou nezbytné. Degradují proteiny na peptidy a jednotlivé aminokyseliny, což umožňuje organismům lépe vstřebávat živiny. Zároveň plní funkci regulátoru - kontrolují buněčný cyklus, jsou zodpovědné za přeměnu prekurzorů na biologicky aktivní látky, jsou součástí signalizačních kaskád. Díky svým vlastnostem jsou proteasy využívány pro terapeutické účely a nalézají uplatnění i v průmyslu a výzkumu. Tato práce se zabývá produkcí rekombinantně připraveného neprosinu - nově objevené prolyl-endopeptidasy izolované z masožravých rostlin Nepenthes ventrata. Jedná se o kyselou proteasu s potenciálem pro využití ve strukturní biologii, proteomice a medicíně. Díky své schopnosti štěpit především C-koncové prolinové zbytky se neprosin stává slibnou možností pro enzymovou terapii celiakie.
|
|
|
Stereotypes about bilingualism
ŠMÍDOVÁ, Aneta
Předmětem této bakalářské práce je fenomén bilingvismu, konkrétně určité stereotypy spojené s bilingvismem a bilingvní výchovou. Cílem práce je tyto stereotypy popsat, případné předsudky vyvrátit, nebo naopak potvrdit jejich pravdivost. Práce bude obsahovat obecné seznámení s bilingvismem, převážně u dětí, typologii bilingvismu, teoretické poznatky o bilingvní výchově a dále strategie výchovy v bilingvních rodinách. Budou též diskutovány stereotypy a mýty všeobecně zakotvené v našich představách o bilingvních dětech. Empirická část bude analyzovat mluvu bilingvních dětí do osmi let věku. Na jejich mluvě bude zkoumána pravdivost vybraných stereotypů a předsudků.
|
|
|
Příprava a charakterizace neutrální trehalasy pro strukturní studie
Šmídová, Aneta ; Obšilová, Veronika (vedoucí práce) ; Jiráček, Jiří (oponent)
Předkládaná diplomová práce je součástí projektu, jehož cílem je vyřešení struktury trehalasové domény neutrální trehalasy Nth1 pocházející ze Saccharomyces cerevisiae. Hlavním cílem této diplomové práce je příprava nových konstruktů kvasničné Nth1 a optimalizace jejich purifikačních protokolů, dále pak výběr nejvhodnějšího pufru pro hledání krystalografických podmínek pomocí metody diferenční skenovací fluorimetrie (DSF) a následná krystalizace připraveného proteinu. Další částí diplomové práce je stanovení enzymové aktivity Nth1 WT a jejích mutantních forem za přítomnosti proteinu Bmh1, dále pak ověření vazby trehalosy na vybrané konstrukty Nth1 pomocí DSF a mikrotermoforézy (MST) a následná krystalizace s trehalosou. Neutrální trehalasa se řadí mezi vysoce konzervované trehalasy, které byly objeveny v široké škále organismů. Tyto enzymy patří do třídy hydrolas, podskupiny glykosidas, hydrolyticky štěpí molekulu trehalosy na dvě molekuly glukosy. Trehalosa je přirozeně se vyskytující neredukující disacharid, který slouží v buňkách kvasinek jako zdroj uhlíku a energie a dále jako ochrana před stresy jako je např. tepelný šok. Hydrolýza trehalosy je životně důležitá pro létavý hmyz, neboť je přítomná jako hlavní cukerná složka hemolymfy hmyzu, proto inhibitory trehalas mohou být využity jako...
|
|
|
Studium stability katalytické domény neutrální trehalasy pomocí diferenční skenovací fluorimetrie
Šmídová, Aneta ; Obšilová, Veronika (vedoucí práce) ; Kacířová, Miroslava (oponent)
Předkládaná bakalářská práce je součástí projektu, jehož záměrem je krystalizace trehalasové domény neutrální trehalasy Nth1 ze Saccharomyces cerevisiae. Hlavním cílem této bakalářské práce je optimalizace purifikačního protokolu dvou různých konstruktů kvasničné Nth1 a určení optimálního pufru pro krystalografii těchto konstruktů pomocí metody diferenční skenovací fluorimetrie DSF. Trehalasy jsou důležité, vysoce konzervované enzymy, které se nacházejí v řadě organismů. Tyto enzymy patří do třídy hydrolas, podskupiny glykosidas a jejich společnou vlastností je to, že hydrolyticky štěpí molekulu trehalosy na dvě jednotky glukosy. Trehalosa je přirozeně se vyskytující neredukující disacharid, který slouží v buňkách kvasinek jako zásobárna uhlíku a energie a dále jako universální ochrana proti stresovým podmínkám. Trehalosa a její hydrolýza je důležitá v životním cyklu hmyzu, neboť je přítomná jako hlavní cukerná složka hemolymfy hmyzu, takže některé trehalasové inhibitory by mohly být využity jako insekticidy. Do této doby však byla vyřešena pouze jediná struktura trehalasy z prokaryotního organismu Escherichia coli. Z tohoto důvodu je velmi důležité vyřešit strukturu trehalasy z eukaryotního organismu. Klíčová slova Nth1, exprese, purifikace, DSF Klíčové předměty Proteinová biochemie, biofyzikální...
|
host ::
RSS.