|
|
Molecular mechanisms of genome integrity maintenance under conditions of replication stress
Boleslavská, Barbora ; Dobrovolná, Jana (vedoucí práce) ; Hanzlíková, Hana (oponent) ; Šebesta, Marek (oponent)
Přesné zdvojení chromozomální DNA je zásadní proces pro všechny dělící se buňky. V případě, že buňka nezvládne dokončit replikaci DNA, může tato skutečnost vést k buněčné smrti, případně k nezvratným změnám v genetické informaci, což může mít za následek tvorbu před-nádorových lézí a později vznik rakoviny. Sofistikovaný multiproteinový komplex zajišťující zdvojení DNA může být zpomalen či zastaven četnými překážkami jako jsou léze na DNA, sekundární DNA struktury ale i ostatními buněčnými aparáty jako je transkripční komplex. Čelní srážky replikace a transkripce asociované s tvorbou R-smyček jsou hlavním endogenním zdrojem genomové nestability. R-smyčky jsou genotoxické tří-vláknové struktury nukleových kyselin složené z RNA:DNA hybridu a nespárovaného vlákna DNA. Tyto R-smyčky mohou zastavit postup replikační vidlice. Eukaryotické buňky vyvinuly řadu mechanismů, které zajišťují odstranění anebo překonání překážek blokujících postup replikační vidlice, aby zajistily kompletní duplikaci DNA. Navzdory probíhajícímu intenzivnímu výzkumu nejsou zatím přesně pochopeny a definovány molekulární mechanismy, které zajišťují znovunastartování replikačních vidlic zastavených v důsledku interference s transkripčními komplexy a R-smyčkami. V této práci předkládáme naše poznatky o tom, jak lidské buňky za...
|
|
|
The role of Nuclear Phosphatidylinositol 4,5 bisphosphate in RNA Polymerase II Transcription
Balaban, Can ; Hozák, Pavel (vedoucí práce) ; Šebesta, Marek (oponent) ; Castano, Enrique (oponent)
(Česky) Fosfatidylinositoly jsou podtřídou glycerofosfolipidů s jejich inositolovou hlavní skupinou spojenou s diacylglycerolovou kostrou. Diferenciální fosforylace inositolové hlavní skupiny poskytuje sedm různých fosfoinositidfosfátů (PIP), které mohou být mono-, bi- nebo tri-fosforylované. Role cytoplazmatických PIP byly rozsáhle studovány ve vezikulárním transportu, iontových kanálech, transportérech, generujících druhé posly a membránové a cytoskeletální dynamice. Zatímco jejich cytoplazmatické funkce jsou velmi dobře popsány, molekulární mechanismus jejich jaderných funkcí je stále málo pochopen. Z jaderných PIP je fosfatidylinositol 4,5-bisfosfát (PIP2) nejhojnějším fosfoinozitidem v buněčném jádru a podílí se na vytváření jaderné architektury regulací procesů, jako je remodelace chromatinu, reakce na poškození DNA a genová exprese. V buněčném jádře se lokalizuje většinou do jaderných skvrn, kde interaguje se sestřihovým apárátemmRNA. V jadérku je PIP2 zapojen do mechanismu regulace transkripce rDAN RNA polymerázou I. Nedávno jsme definovali nukleoplazmatický pool PIP2, který je pozorován v ostrůvcích o průměru 40 - 100 nm (NLI). Vznikající transkripty RNA polymerázy II (RNAPII) byly vizualizovány na jejich periferii a ukázalo se, že RNA je nezbytná pro jejich integritu. V této studii jsme...
|
host ::
RSS.