|
|
Computational Methods for Annotation Analysis of Genetic Variations
Fülöp, Tibor ; Bendl, Jaroslav (referee) ; Martínek, Tomáš (advisor)
Analýza a interpretace variací DNA je důležité pro zkoumání genetického pozadí dědičnosti, nemocí a jiných fenotypových rysů. Tato práce stručně úvadí oblasti molekulární biologie a základních principů genetiky, popisuje metody pro anotační analýzy genetických variací, genomové asociační studie a metody pro analýzy obohacení s jejich implementací. V rámci této práce jsme představili nový webový nástroj Varanto, který může být použit k anotaci, vizualizaci a analýze genetických variací. Může být použit k analýze obohacení anotací pomocí hypergeometrického testu pro danou množinu variací. Varanto obsahuje uživatelské webové rozhraní vyvinuté pomocí frameworku Shiny jazyka R. Výkon a funkcionalita nástroje jsou testovány a demonstrovány podle výkonových benchmarků a na základě analýzy a interpretace dat z dříve publikovaných genomových asociačních studií.
|
|
|
GUI for Microscopic Traffic Simulation
Fülöp, Tibor ; Petrlík, Jiří (referee) ; Korček, Pavol (advisor)
Nowadays the road traffic is more complex and number of vehicles increases. The goal of this thesis is to develop microscopic traffic simulator with graphical user interface which it is possible to experiment with. The simulator can be used to construction of road topology with multiple lane roads and crossroads. It supports creating uncontrolled crossroads, crossroads with main road or crossroad with traffic lights. It generates and shows macroscopic data during simulation. It is based on cellular automaton and model is inspired by Nagel-Schreckenberg traffic model. There are results of simulating simple traffic simulations in the thesis.
|
|
|
GUI for Microscopic Traffic Simulation
Fülöp, Tibor ; Petrlík, Jiří (referee) ; Korček, Pavol (advisor)
Nowadays the road traffic is more complex and number of vehicles increases. The goal of this thesis is to develop microscopic traffic simulator with graphical user interface which it is possible to experiment with. The simulator can be used to construction of road topology with multiple lane roads and crossroads. It supports creating uncontrolled crossroads, crossroads with main road or crossroad with traffic lights. It generates and shows macroscopic data during simulation. It is based on cellular automaton and model is inspired by Nagel-Schreckenberg traffic model. There are results of simulating simple traffic simulations in the thesis.
|
|
|
Computational Methods for Annotation Analysis of Genetic Variations
Fülöp, Tibor ; Bendl, Jaroslav (referee) ; Martínek, Tomáš (advisor)
Analýza a interpretace variací DNA je důležité pro zkoumání genetického pozadí dědičnosti, nemocí a jiných fenotypových rysů. Tato práce stručně úvadí oblasti molekulární biologie a základních principů genetiky, popisuje metody pro anotační analýzy genetických variací, genomové asociační studie a metody pro analýzy obohacení s jejich implementací. V rámci této práce jsme představili nový webový nástroj Varanto, který může být použit k anotaci, vizualizaci a analýze genetických variací. Může být použit k analýze obohacení anotací pomocí hypergeometrického testu pro danou množinu variací. Varanto obsahuje uživatelské webové rozhraní vyvinuté pomocí frameworku Shiny jazyka R. Výkon a funkcionalita nástroje jsou testovány a demonstrovány podle výkonových benchmarků a na základě analýzy a interpretace dat z dříve publikovaných genomových asociačních studií.
|
guest ::
