|
|
Detekce síňové fibrilace s využitím intrakardiálního EKG
Kašparová, Michaela ; Novotná, Petra (oponent) ; Ředina, Richard (vedoucí práce)
Fibrilace síní je jednou z nejčastějších poruch srdečního rytmu. Je způsobena nepravi- delnou aktivací síní, což způsobuje nekoordinované stahy síní s velmi vysokou frekvencí, a proto je její včasná diagnostika velmi důležitá. Cílem této bakalářské práce je automa- tická detekce fibrilace síní v intrakardiálních záznamech. Automatická detekce umožňuje nalezení úseků s výskytem fibrilace síní, a tak zprostředkovat rychlejší stanovení diagnózy. Testování vytvořeného algoritmu proběhlo na dostupné databázi dětských pacientů, kteří podstoupili elektrofyziologické vyšetření v Dětské nemocnici Fakultní nemocnice Brno v České republice.
|
|
|
ECG-based biomarkers for estimation of sudden death risk in patients with accessory atrioventricular pathway.
Tomková, Lucia ; Ředina, Richard (oponent) ; Hejč, Jakub (vedoucí práce)
The aim of this work is to acquaint the reader with the delta wave manifestation on the electrocardiogram in pediatric patients with Wolf-Parkinson-White syndrome who are at risk of sudden cardiac death. Subsequently, in the work we deal with the processing of data from the electrophysiological examination and the creation of algorithms for the extraction of biomarkers from the ECG signal in the Python programming language. The work includes statistical analysis of biomarkers, focusing on the difference in datasets for at-risk and non-at-risk patients. Biomarkers that have a statistically significant difference in the datasets are used to create and select a suitable model for predicting the risk of the accessory pathway in patients.
|
|
|
Prostoročasové epidemiologické modely onemocnění Covid-19
Schubert, Richard ; Ředina, Richard (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Tato práce má za cíl v první části vytvořit základní rozhraní pro studium prostorově difúzních modelů popisující dynamiku šíření infekčních chorob s konstantními parametry v homogenním prostředí. Nejdříve jsou studovány kompartmentové modely a jejich rozšíření do prostorové domény. Na ně navazuje teorie metapopulačních modelů, u kterých je diskutována míra závislosti spřažení populací na celkové reprodukční číslo R0. Dále je modelován vztah mezi reprodukčním číslem R0 a tvarem prostorového rozložení infikovaných u jednoduchého difúzního SIR modelu. Je dokázán vliv Neumannových okrajových podmínek vůči Dirichletovým okrajovým podmínkám na R0. Ve druhé části práce jsou shrnuty vybrané poznatky a závěry studií, které aplikovaly modely na prostoročasové doméně pro analýzu a predikci pandemie COVID-19. Ve třetí části práce je fitován model s difúzními a metapopulačními prvky na epidemiologická data s Lombardie roku 2020 a je provedena diskuse vhodnosti tohoto přístupu.
|
|
|
Pokročilé hodnocení kvality spánku
Benáček, Petr ; Ředina, Richard (oponent) ; Filipenská, Marina (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá hodnocením kvality spánku pomocí moderních metod hlubokého učení. V práci jsou popsány metriky automatické klasifikace spánkových fází. Je zde diskutována vybraná databáze spánkových dat. Vzhledem k nízkému počtu dat ve fázi bdění jsou popsány a provedeny různé způsoby augumentace dat. Základem pro klasifikaci jsou modely založené na 1D konvolučních sítích. Výsledkem jsou připravené modely pro binární klasifikaci a klasifikaci 3 a 4 fází spánku. Nakonec jsou pomocí těchto modelů vypočítány metriky hodnotící kvalitu spánku a výsledky jsou srovnány s literaturou.
|
|
|
Epidemiologické modelování šíření nemoci Covid-19
Motlíčková, Klára ; Ředina, Richard (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá matematickým kompartmentovým modelováním pandemie COVID-19. Jsou zde přiblíženy základní epidemiologické modely a uvedeno šest studií, které se zabývají chováním viru SARS-CoV-2 za různých podmínek. Na modelu SIR je proveden odhad parametrů, výpočetně pro první a čtvrtou vlnu epidemie, dále pomocí algoritmu v prostředí MATLAB provedena optimalizace pro všechny vlny epidemie v ČR a také pro čtvrtou vlnu epidemie na modelu SEIR. Pro model SIR je také modelován vliv protiepidemických opatření.
|
|
|
Analýza časově-frekvenčních charakteristik signálů
Vitouš, Jiří ; Ředina, Richard (oponent) ; Poměnková, Jitka (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá časově-frekvenční analýzou diskrétních signálů. Cílem práce je porovnat hlavní známé metody pro odhad spektro/škálogramu. Hlavní důraz je kladen na problematiku spojenou s kompromisem mezi časovým a frekvenčním rozlišením a také na vliv míry zašumění vstupních dat na kvalitu odhadnutého spektrogramu. Pro tyto účely je sestavena databáze reálných a umělých signálů, na kterých je demonstrována úspěšnost jednotlivých metod odhadu spektrogramů. Databáze je následně využita v demonstračním programu, sloužícím k porovnání jednotlivých metod analýzy. Kolem tohoto programu je také sestaveno počítačové cvičení.
|
|
|
Algoritmy pro zlepšení detekce vybraných arytmií v EKG
Šandová, Hana ; Ředina, Richard (oponent) ; Novotná, Petra (vedoucí práce)
Práce se zabývá navyšováním datových sad arytmií v EKG, které bývají v databázích méně často zastoupené. Teoretická část je věnována literární rešerši odborných prací, které se zabývají klasifikátory srdečních arytmií s využitím hlubokého učení a augmentací EKG signálů. V praktické části byly realizovány generátory šumu, které by po přičtení do reálně změřených signálů mohly obohatit datovou sadu. Také byla realizována metoda pro augmentaci flutteru síní. Byly vytvořeny funkce, které uměle vytvářejí signály napodobující atrioventikulární blokády II. a III. stupně. Nakonec byla snaha generovat atrioventikulární blokády II. stupně pomocí generativních kompetitivních sítí (GAN). Úspěšnost augmentace byla hodnocena přidáním různě kombinovaných syntetických dat do trénovacích množin pro EKG klasifikátor v podobě hluboké neuronové sítě.
|
|
|
Detekce vybraných typů srdečních arytmií v EKG
Němečková, Karolína ; Ředina, Richard (oponent) ; Ronzhina, Marina (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá klasifikací EKG záznamů se zaměřením na hůře klasifikovatelné arytmie (flutter síní, atriventrikulární blokáda II. a III. stupně). V teoretické části je uvedena literární rešerše v oblasti metod hlubokého učení, které byly využity pro klasifikaci EKG záznamů, se zaměřením na konvoluční neuronové sítě. Dále je popsána použitá databáze EKG záznamů se stručným popisem detekovaných arytmií. Praktická část provádí implementaci navržených konvolučních neuronových sítí v prostředí Python. Hodnocení kvality klasifikátorů proběhlo pomocí vybraných metrik se zaměřením na F1 skóre. Výsledky jsou na konci práce diskutovány.
|
|
|
Atrial Fibrillation Model
Ředina, Richard
The aim of this thesis is to create a basic 2D electroanatomic model of a heart atria andperform an atrial fibrillation on this model. Model development and simulations are performed inCOMSOL Multiphysics. Depolarization wave propagation is simulated by using FitzHugh-Nagumo model. A representation of the pathology is obtained by parameter modulation of thismodel. The achieved results can be used later to predict the locations of different pathologies inheart which should improve diagnostics and hopefully shorten the duration of operations.
|
|
|
Model fibrilace síní
Ředina, Richard ; Smíšek, Radovan (oponent) ; Ronzhina, Marina (vedoucí práce)
Cílem diplomové práce je vytvořit 3D elektroanatomický model srdečních síní schopný simulovat fibrilaci síní. Pro řízení modelu byly vybrány diferenciální rovnice FitzHugova-Nagumova modelu, které popisují změnu napětí na buněčné membráně. Rovnice mají zavedené parametry, jejichž úprava vede ke změnám chování modelu. Simulace byly prováděny v prostředí COMSOL Multiphysics. V prvním kroku byly simulace prováděny na 2D modelech. Byly vytvořeny simulace zdravého srdce, flutteru síní a síňové fibrilace. Nabyté poznatky posloužily jako základ pro vytvoření 3D modelu na němž byla simulována fibrilace síní na podkladě ektopické aktivity a reentry mechanismu. Bylo dosaženo přesvědčivých výsledků v souladu s použitou literaturou. Výhodami výpočetního modelování je jeho dostupnost, nulová etická zátěž a možnost simulovat i vzácnější arytmie. Nevýhodou zvoleného postupu je nutnost volby mezi přesností a výpočetní náročností simulací.
|
host ::
RSS.