|
|
Moderní metody predikce sekundární struktury proteinů a jejich srovnání
Kraus, Ondřej ; Novotný, Marian (vedoucí práce) ; Pleskot, Roman (oponent)
V současnosti existuje několik nástrojů k predikci sekundární struktury proteinů, většina moderních metod používá algoritmy, jako jsou skryté Markovovy modely nebo umělé neurální sítě. Ve své práci se proto pokusím s nimi čtenáře seznámit a vysvětlit na jakém principu pracují, jaké jsou jejich výhody a nevýhody. Většina moderních metod predikuje tři typy sekundární struktury (helix, list a smyčku) s úspěšností 70%-80%. Nicméně vzhledem k odlišné metodice testování úspěšnosti různých metod lze brát výsledky pouze jako orientační, a uživatel by se proto měl s metodou a metodikou jejího testování nejprve detailně seznámit. Klíčová slova: predikce proteinové struktury, skrytý Markovův model, umělá neuronová síť, nejbližší soused, sekundární struktura proteinů
|
host ::
RSS.