|
|
Optimalizační metoda TRUST pro registraci medicínských obrazů
Pernicová, Lenka ; Mézl, Martin (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá optimalizací pro registraci medicínských obrazů. Základem bylo seznámit se s registrací obrazů a důkladně prostudovat jednotlivé globální optimalizační metody, zvláště optimalizační metodu TRUST. Na základě teoretických poznatků bylo možné přejít k návrhu optimalizační metody založené na metodě TRUST pro registraci medicínských obrazů a k následné realizaci v programovacím prostředí Matlab. Vytvořený algoritmus je otestován na testovacích datech a srovnán s dalšími optimalizačními metodami jako je Simulované žíhání.
|
|
|
Registrace obrazu pomocí metody Optical Flow
Bistrý, Jan ; Provazník, Ivo (oponent) ; Malínský, Miloš (vedoucí práce)
Registrace medicínských obrazů je technika, která se rozvíjí ruku v ruce s novými hybridními diagnostickými zobrazovacími modalitami. V dnešní době je prováděna registrace jak monomodálních, tak multimodálních obrazových dat. První část této diplomové práce je zaměřena na problematiku registrace obrazů. Konkrétně na jejich transformace, interpolace, kriteriální funkce a optimalizace. V následující části je představena realizovaná metoda Optical Flow a použitý algoritmus „Demon“ pro registraci obrazů. Dále se práce zaměřuje na prezentaci výsledného programu a realizovaného GUI. V poslední části diplomové práce je testována funkčnost navrženého programu na běžných obrazech i reálných CT snímcích.
|
|
|
Multimodální registrace obrazů sítnice
Štohanzlová, Petra ; CSc, Tomáš Suk, (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá možnostmi registrace retinálních snímků z různých modalit, konkrétně optické koherentní tomografie (OCT), skenovací laserové oftalmoskopie (SLO) a fundus kamery. V první fázi práce je zájem soustředěn na registraci obrazu SLO na fundus snímek, což slouží k vymezení oblasti zájmu pro následnou registraci dat z OCT. Závěrečná fáze slouží k nalezení správné pozice B-skenů ve fundus snímku. Na základě prostudování různých registračních metod byl pro registraci v obou případech použit postup využívající výpočet korelačního koeficientu. Pro nalezení optimálních parametrů registrace je použito prohledávání celého prostoru parametrů. V dílčích částech práce pak je vytvořen algoritmus pro vyrovnání OCT B-skenů s následnou detekcí cév a také jednoduchý algoritmus pro detekci cév z fundus snímku. Pro zpřehlednění registrace bylo vytvořeno grafické uživatelské rozhraní, které umožňuje načtení vstupních obrazů a přehledné zobrazení výsledku v několika možných formách.
|
|
|
Analýza obrazu pro korekci elektronových mikroskopů
Smital, Petr ; Schwarz, Daniel (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá fyzikální podstatou korekcí elektronového mikroskopu a matematickými metodami zpracování obrazu potřebnými pro jejich kompletní automatizaci. Jedná se o různé typy ostření, korekci astigmatismu, centrování elektronového svazku či stabilizaci obrazu. Mezi popsané matematické metody patří různé metody zjištění ostrosti a astigmatismu, jak s použitím Fourierovy transformace, tak bez ní, dále metody detekce hran, operace s histogramem a lícování snímků, tedy zjišťování prostorových transformací v obraze, včetně zmínky o optimalizačních metodách. Tato práce obsahuje podrobný popis matematických metod, jejich zhodnocení na základě testovací „offline“ aplikace, popis algoritmů jejich implementace do reálného elektronového mikroskopu a výsledek testu na reálném mikroskopu v podobě videozáznamu z obrazovky ovládacího počítače.
|
|
|
Lícování snímků sítnice pomocí metody fázové korelace
Šikula, Viktor ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá lícováním snímků sítnice pomocí metody fázové korelace. Jsou zde popsány vlastnosti obrazů sítnice a způsob jejich snímání. V práci je vysvětlen postup pro zjištění měřítka, rotace a posunu mezi dvěma obrazy sítnice metodou fázové korelace. K lícování jsou použity snímky z fundus kamery a skenovací laserové oftalmoskopie (SLO). V práci je popsáno vyhledávání korespondujících značek pomocí fázové korelace a registrace kvadratickou transformací. Výsledky registrace jsou objektivně i subjektivně vyhodnoceny.
|
|
|
Head Pose Estimation and Tracking
Pospíšil, Aleš ; Krajsa, Ondřej (oponent) ; Přinosil, Jiří (vedoucí práce)
This thesis is focused on head pose estimation as a possibility to bridge a gap between human and computers. The main contribution of the thesis is usage of a novel hardware and software technology such as Kinect, Point Cloud Library and CImg Library. In the beginning of the thesis overview of prior works in a field of head pose estimation is provided. Own database was created in order to test and evaluate developed algorithm. The head pose estimation and tracking system is based on 3D image data acquisition and Iterative Closest Point registration algorithm. In the end of thesis performance and limitation of the system are described and further improvement is proposed.
|
|
|
Neuroinformatika: metody kalibrace v multicentrické MR studii
Kovalčík, Tomáš ; Říha, Ivo (oponent) ; Provazník, Ivo (vedoucí práce)
Práce se zabývá metodami kalibrace multicentrických studii magnetické rezonance. Magnetická rezonance je jev, kdy se látce v magnetickém poli o indukci B0 dodá energie v podobě RF impulzu s Larmorovou frekvencí a tím se částice vybudí do vyšších energetických hladin. Kalibraci je možné provádět pomocí rozlišovacích a radiofrekvenčních homogenních fantomů. Dále můžeme kalibraci provádět pomocí registrace obrazů. Pro kalibraci pomocí registrace obrazů jsou v práci popsány klasické metody lineární(afinní) a nelineární. Dále jsou uvedeny simulátory, které jsou užitečné mimo jiné pro modelování různých artefaktů.
|
|
|
Strojové učení pro analýzu MR obrazů mozku
Král, Jakub ; Říha, Ivo (oponent) ; Provazník, Ivo (vedoucí práce)
Diplomová práce se věnuje metodám strojového učení v rozpoznávání první fáze schizofrenie na obrazech získaných z nukleární magnetické rezonance. Úvod práce je zaměřen především na fyzikální princip magnetické rezonance. V práci se dále pozornost věnuje registračním metodám, redukci dat a strojovému učení. V části klasifikace jsou popsány míry podobnosti, metoda podpůrných vektorů, nejbližších sousedů a metoda K-means. Závěr teoretické části se věnuje hodnocení klasifikátorů. V praktické části práce jsou uvedeny výsledky redukce dat metodou PCA, CRLS-PCA a subjektové PCA. Dále je praktická část zaměřena na rozpoznávání tvarů metodou K-NN a K-means a testování klasifikátoru K-NN na reálných datech. Abnormality rozpoznané některou z klasifikačních metod pak mohou umožnit rozlišení pacientů se schizofrenií od zdravých dobrovolníků.
|
|
|
Image database system for glaucoma diagnosis support
Peter, Roman ; Roleček, Jiří (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
This master thesis describes a conception of standard and advanced eye examination methods used for glaucoma diagnosis in its early stage. According to the theoretical knowledge, a web based information system for ophthalmologists with three main aims is implemented. The first aim is the possibility to share medical data of a concrete patient without sending his personal data through the Internet. The second aim is to create a patient account based on a complete eye examination procedure. The last aim is to improve the HRT diagnostic method with an image registration algorithm for the fundus and intensity images and create an optic nerve head web based 3D visualization. This master thesis is a part of project based on DAAD co-operation between Department of Biomedical Engineering, Brno University of Technology, Eye Clinic in Erlangen and Department of Computer Science, Friedrich-Alexander University, Erlangen-Nurnberg.
|
|
|
Registrace autofluorescenčních obrazů sítnice
Říha, František ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Autofluorescenčních obrazů sítnice, které se snímají konfokálním laserovým skenovacím oftalmoskopem (HRA, Heidelberg Retina Angiograph), se využívá k diagnostice glaukomového onemocnění. Glaukom je nemoc, při které dochází k postupnému poškozování zrakových nervů, a to vede ke zhoršování zraku a může dojít až k úplnému oslepnutí. Systémem HRA se získá sada obrazů sítnice, kde každý obraz představuje určitou část sítnice. Z těchto obrazů se pak skládá tzv. kompozitní snímek, který pokrývá snímanou oblast sítnice. V našem případě se jedná o okolí optického disku. V této práci jsou představeny metody registrace obrazů založené na globální podobnostní funkci nebo na detekci významných značek. Významné značky jsou detekovány v místech větvení krevního řečiště.
|
host ::
RSS.