|
|
Synthesis of aerothionin analogs as potential antimycobacterial agents
Šimovičová, Martina ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Zimčík, Petr (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutickej chémie a farmeceutickej analýzy Riešiteľ: Martina Šimovičová Vedúci diplomovej práce: doc. PharmDr. Jan Zitko, PhD.; Adjunct Prof. Paula Kiuru, Ph.D Názov diplomovej práce: Syntéza analógov aerothionínu ako potenciálnych antimykobakteriálnych zlúčenín Kľúčové slová: antimykobakteriálny, tuberkulóza, syntéza, aerothionín, bromotyrozíny Liečivá súčasne používané na liečbu tuberkulózy sú výsledkom štúdií uskutočnených pred 50 alebo 60 rokmi. So stále narastajúcim problémom rezistencie baktérií na súčasne používané liečivá rastie i význam výskumu zaoberajúceho sa hľadaním nových antimykobakteriálne účinných látok. Morské prostredie má nepochybne obrovský potenciál pre objav nových vedúcich štruktúr pre vývoj antituberkulotických zlúčenín. Jednou z týchto vedúcich štruktúr je spirocyklická zlúčenina aerothionín (1), u ktorej bola zistená aktivita proti multirezistentným kmeňom Mycobacterium tuberculosis, spolu s troma netuberkulotickými mykobaktériami (Obrázok 1). Navyše, v posledných rokoch sa u viacerých spirocyklických zlúčenín zistilo, že pôsobia na M. tuberculosis, čo robí tento štruktúrny segment atraktívny pre antituberkulotický výskum. Obrázok 1: Aerothionín (1) a všeobecná štruktúra produktov. Nadväzujúc na tieto...
|
|
|
Syntéza a hodnocení N-pyridylbenzamidů jako potenciálních antimikrobních sloučenin
Suchánková, Eliška ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Nováková, Veronika (oponent)
SYNTÉZA A HODNOCENÍ N-PYRIDYLBENZAMIDŮ JAKO POTENCIÁLNÍCH ANTIMIKROBNÍCH SLOUČENIN Eliška Suchánková Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, Univerzita Karlova, Česká republika Deriváty N-pyridylbenzamidu byly navrženy a připraveny pro in vitro testování jejich antimykobakteriální aktivity proti Mycobacterium tuberculosis H37Ra, M. smegmatis, M. aurum a in vitro cytotoxicity u HepG2 buněčné linie. Tyto sloučeniny jsou pyridinová analoga dříve připravených N-pyrazinylbenzamidů, které vykazovaly významnou in vitro antimykobakteriální aktivitu. Látky byly syntetizovány acylací aminopyridinu nebo chlorpyridin-2-aminu vybranými benzoylchloridy. Finální sloučeniny byly popsány pomocí elementární analýzy, teplot tání, 1 H a 13 C spektry a IČ spektroskopií. Obecně, připravené sloučeniny vykazují nižší antimykobakteriální aktivitu než dříve hodnocené N-pyrazinylbenzamidy. Nicméně jsou případy, ve kterých byly deriváty pyridinu v porovnání s pyrazinovými deriváty účinnější; především proti M. smegmatis. Nejlepší aktivita byla prokázána u derivátů odvozených od 2-amino-6-chlorpyridinu a substituovaných benzoylchloridů, což odpovídá i vyšší lipofilitě těchto látek; konkrétně nejúčinnější je N-(6- chlorpyridin-2-yl)-4-methylbenzamid (JZ-EV 14) s MIC 15,625...
|
|
|
Intracellular trafficking of an anti - Amyloid Protein Precursor antibody.
Zitko, Jan ; Doležal, Martin (vedoucí práce) ; Trejtnar, František (oponent)
Intracelulární sledování pohybu protilátky proti amyloidnímu prekurzorovému proteinu Alzheimerova choroba je neuropatologické onemocnění, klinicky se projevující postupným zhoršováním funkcí centrální nervové soustavy, především pak paměti, kognitivních funkcí, změněným chováním (včetně paranoii) a zhoršováním jazykových funkcí. Alzheimerova choroba je nejčastější příčinou demence ve středním a vyšším věku. Příčiny a samotný proces rozvoje choroby nejsou doposud plně objasněny, nicméně jedním z rozhodujících faktorů se zdá být nahromadění β-amyloidního peptidu (Aβ) v určitých oblastech CNS. Aβ je ovšem přirozeným a fyziologickým metabolitem a lze ho izolovat z tělesných tekutin zdravých jedinců. Aβ vzniká proteolytickým štěpením amyloidního prekurzorového proteinu (APP), což je fyziologický, evolučně vysoce konzervativní, membránový protein. APP může být štěpen v takzvané neamyloidogenní cestě α-sekretázou a následně γ-sekretázou za vzniku dobře rozpustných peptidů nepodílejících se na vzniků depozitů, nebo β-sekretázou a γ-sekretázou za vzniku Aβ s tendencí k agregaci (amyloidogenní cesta). Pohyb APP v buňce je velmi komplexní. Po jeho syntéze je posttranslačně modifikován a distribuován sekreční cestou k buněčnému povrchu, kde je exponován. Poměrně rychle je APP podroben endocytóze a následně...
|
|
|
Peanovo jádro kvadraturní formule
Valešová, Petra ; Kofroň, Josef (vedoucí práce) ; Zítko, Jan (oponent)
Nazev prace: Poanovo jadro kvadraturni formula Autor: Pctra Valcsova Katedra (ustav): Katedra numcricke matciriatiky Vcdouci bakalarskc pracc: Doc. RNDr. Josef Kofroii, CSc. c-inail vcdouciho: Josef.Kohxm^.tinff.cuni.cz Abstrakt: V pfedlozcnc praci studujcme vyjadfcni chyb kvadraturnich for- rnuli pomoci Peanova jadra. Nejprve je definovano Peanovo jadro kvadra- turni fornmlc. dale jsou uvcdcny a dokazany ricktcrc jcho vlastnosti a na dvou pfikladoch jc ukazan vypocct Peanovych jadcr. Kaslcdneje vyuzito Peanova jadra k nalezeni optimalni kvadraturni for mule. Potc jc popsana kon.strukce Rombergovy kvadraturni formulc a pfislusncho Peanova jadra. Jc uvcdcno a dokazano nekolik vlastnosti Peanovych jadcr Rombergova kvadraturniho vzorce. Dale jc na nekolika pfikladcch srovnan odhad chyby kvadraturnich formuli. Na /,;iver jc definovano Sardovo jadro kubatumi for mule a na pfi- kladc je ukazan vypocet Saixlova jadra. Klicova slova: kvadraturni vzorcc, Pcanovo jadro, chyba kvadraturni fonnule Title: Pcario kernel of the quadrature formula Author: Pctra Valesova Department: Department of Numerical Mathematics Supervisor: Doc. RNDr. Josef Kofroil, CSc. Supervisor's e-mail address: .loscf.Kofrori'il'mff.cuni.r/, Abstract: In the present work we study the expressing of errors of a qua- drature formula by Pcano kernel....
|
|
|
Syntéza anionických derivátů ftalocyaninů jako potenciálních fotodynamicky aktivních látek
Kollár, Jan ; Zimčík, Petr (vedoucí práce) ; Mosinger, Jiří (oponent) ; Zitko, Jan (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát: Mgr. Jan Kollár Školitel: prof. PharmDr. Petr Zimčík, Ph.D. Konzultant: doc. PharmDr. Veronika Nováková, Ph.D. Disertační práce: Syntéza anionických derivátů ftalocyaninů jako potenciálních fotodynamicky aktivních látek Ftalocyaniny (Pc) a jejich aza-analogy (např. tetrapyrazinoporfyraziny TPyzPz) představují nadějnou skupinu organických barviv se zajímavými fotofyzikálními vlastnostmi (silná absorpce v oblasti 650-750 nm, vysoká produkce singletového kyslíku) velmi vhodnými pro použití ve fotodynamické terapii (PDT) nádorových onemocnění. Mají však také některé nevýhody snižující jejich potenciální použití v PDT (nízká rozpustnost ve vodě, silná tendence k agregaci). Téma mé disertační práce úzce navazuje na téma mé diplomové práce, během které byl připraven TPyzPz s 16 karboxylátovými skupinami v rigidním uspořádání, u kterého jsme pozorovali výrazný negativní vliv pH a sérových proteinů na fotodynamickou aktivitu. V první části disertační práce jsem proto připravil nový zinečnatý TPyzPz s 8 sulfonátovými skupinami na periferii charakterizovaný dobrou rozpustností ve vodě. Sulfonové kyseliny byly vybrány jako silnější kyseliny než karboxylové, takže se očekávalo, že...
|
|
|
Approximate Polynomial Greatest Common Divisor
Eliaš, Ján ; Zítko, Jan (vedoucí práce) ; Hnětynková, Iveta (oponent)
Název práce: Approximate Polynomial Greatest Common Divisor Autor: Ján Eliaš Katedra: Katedra numerické matematiky, MFF UK Vedoucí diplomové práce: Doc. RNDr. Jan Zítko, CSc., Katedra numerické matematiky, MFF UK Abstrakt: Výpočet najväčšieho spoločného delitel'a (GCD) dvoch polynómov patrí medzi základné problémy numerickej matematiky. Euklidov algoritmus je najstaršia a bežne používaná metóda na výpočet GCD, avšak táto metóda je značne nestabilná. Výpočet GCD je navyše zle postavená úloha v tom zmysle, že l'ubovol'ný šum pridaný ku koeficientom polynómov redukuje netriviálny GCD na konštantu. Jednu skupinu nových metód predstavujú metódy založené na odhade numerickej hod- nosti matíc. Operácie s polynómami sa tak redukujú na maticové počty. Ich nevýhodou je, že ani numerická hodnost' nemusí byt' spočítaná presne a hodnoverne kvôli citlivosti singulárnych čísel na šume. Ciel'om práce je prekonat' citlivost' výpočtu GCD na šume. Klíčová slova: AGCD, Sylvesterova matica, numerická hodnost', TLS
|
|
|
Synthesis of NK1 antagonists.
Puchnerová, Lucie ; Doležal, Martin (vedoucí práce) ; Zitko, Jan (oponent)
Syntéza NK1 antagonistů Lucie Puchnerová Katedra organické a farmaceutické chemie, Farmaceutická fakulta, Univerzita Seville Antagonisté NK-1 receptorů jsou doposud zastupovány pouze jediným na trhu dostupným léčivem Aprepitant, který je používán k prevenci pocitu nevolnosti a zvracení způsobených chemoterapií. Nicméně se předpokládá, že látky schopné antagonizace receptoru NK-1 by se mohly v budoucnu uplatnit také při terapii migrény, revmatické artritidy, astmatu, zánětlivých onemocněních střev, Parkinsonovy choroby, úzkosti anebo deprese. Tato práce se zabývá asymetrickou syntézou několika derivátů 2-amino-4H-pyranu, které díky své substituci odpovídají struktuře farmakoforu NK-1 antagonistů. Jako výchozí látka pro jejich přípravu byl použit methyl-(p-tolyl)sulfon a menthyl-(S)- p-toluensulfinát, z kterého byl nukleofilní substitucí nasyntetizován (R)-methyl-(p- tolyl)sulfoxid. Tyto sloučeniny byly podrobeny reakci s ethyl-2-pikolinátem za vzniku příslušného β- ketosulfoxidu a β-ketosulfonu, z kterých jsme prostřednictvím Michaelovi adice získali 2-amino-4H-pyrany. U derivátů nasyntetizovaných z β-ketosulfoxidu jsme nadále provedli redukci sulfoxidové skupiny a trifluoracetylaci aminoskupiny, čímž jsme získali sloučeniny, u kterých byl prokázán agonistický účinek na NK-1 receptory. Tímto byla potvrzena...
|
|
|
Deriváty amidoximů jako syntetické intermediáty a potenciální léčiva
Hariková, Michaela ; Kučerová, Marta (vedoucí práce) ; Zitko, Jan (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Název diplomové práce: Deriváty amidoximů jako syntetické intermediáty a potenciální léčiva Student: Michaela Hariková Školitel: PharmDr. Marta Kučerová, Ph.D. V teoretické části této diplomové práce jsou shrnuty biologické účinky N-hydroxykarbimidoylchloridů a aminoderivátů. Dále jsou popsány biologicky aktivní sloučeniny, které jsou syntetizovány z N-hydroxykarbimidoylchloridů, konkrétně sloučeniny obsahující isoxazol. V experimentální části jsou uvedeny použité postupy pro syntézy derivátů amidoximů. Výchozí sloučeniny pro syntézu N-hydroxykarbimidoylchloridů byly příslušné alkylované amidoximy, které byly dostupné na Katedře farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy nebo byly připraveny radikálovou alkylací pyrazinkarbonitrilu a následným převedením na amidoxim. Z N-hydroxykarbimidoylchloridu byl následně připraven aminoderivát. Všechny připravené sloučeniny byly charakterizovány teplotou tání, NMR a IČ spektry. Čistota látek byla zkontrolována pomocí TLC a elementární analýzy. Připravené deriváty byly podrobeny testování in vitro na jejich antibakteriální, antimykobakteriální a antifungální aktivitu.
|
|
|
Kationické tenzidy jako hydrolytické micelární katalyzátory
Janošcová, Petra ; Doležal, Martin (vedoucí práce) ; Zitko, Jan (oponent)
Souhrn Kationické tenzidy jako hydrolytické micelární katalyzátory Petra Janošcová Byla testována hydrolytická účinnost řady kationických tenzidů při rozkladu organofosforového pesticidu fenitrothionu. Všechny testované tenzidy zvyšovaly rychlost rozkladu fenitrothionu, což bylo důkazem probíhající micelární katalýzy. U některých látek byl patrný pokles rychlosti hydrolýzy při nejvyšších koncentracích, což bylo důsledkem jevu nazývaného efekt prázdných micel. Nejvyšší hydrolytické výkonnosti bylo dosaženo u tenzidů, které v molekule obsahovaly ionizovatelné hydroxylové skupiny. Zcela kromobyčejnou výkonnost vykazoval farmaceuticky významný tenzid benzoxonium.
|
|
|
Syntéza arylsulfanyl ftalocyaninů a jejich aza-analogů
Málková, Anna ; Zimčík, Petr (vedoucí práce) ; Zitko, Jan (oponent)
7 2. ABSTRAKT Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Kandidát: Anna Málková Školitel: doc. PharmDr. Petr Zimčík, Ph.D. Téma práce: Syntéza arylsulfanyl ftalocyaninů a jejich aza-analogů. Ftalocyaniny (Pc) a jejich aza-analogy (AzaPc) jsou sloučeniny využívající se v rámci fotodynamické terapie. Jsou charakterizovány rozličnými fotofyzikálními vlastnostmi, které se různí v závislosti na charakteru periferních substituentů. Například součet kvantových výtěžků singletového kyslíku a fluorescence dosahuje běžně hodnot okolo 1 u komplexů s centrálními kationty kovů (např. Mg2+ , Zn2+ ), zatímco bezkovové deriváty se v těchto výsledcích liší, jejich hodnoty jsou nižší. Předpokládáme, že toto chování by mohlo souviset s velikostí periferních substituentů. Cílem této práce byla syntéza různých komplexů ftalocyaninů a jeho aza-analogů substituovaných objemným 2,6-difenylfenylsulfanylovým substituentem jako látek určených pro studium fotofyzikálních vlastností. Syntéza začínala komerčně dostupným 2,6-difenylfenolem, který byl pomocí dimethylkarbamoylchloridu převeden na příslušný O-karbamothioát. Použitím Newman- Kwartova přesmyku za vysokých teplot se podařilo získat isomerní S-karbamothioát, a ten zredukovat pomocí LiAlH4 na...
|
host ::
RSS.