|
|
Funkční nanočástice pro plasmonické biosenzory
Přítulová, Marie ; Salyk, Ota (oponent) ; Vala, Martin (vedoucí práce)
Tato diplomová práce je zaměřena na přípravu zlatých nanočástic a jejich použití pro citlivou detekci karcinoembryonálního antigenu (CEA) pomocí biosenzoru s povrchovými plasmony. V této práci byla studována příprava koloidních nanočástic. Sférické nanočástice s hladkým povrchem o velikosti 100 nm byly připraveny zoptimalizovanou tříkrokovou syntézou. Zlaté nanočástice byly následně funkcionalizovány monovrstvou alkyl-thiolů a molekulami streptavidinu. Takto funkcionalizované nanočástice byly charakterizovány UV/VIS spektroskopií a změřením zeta-potenciálu. Následně byly tyto nanočástice použity pro citlivou detekci CEA a bylo ukázáno, že zesilují odezvu senzoru 100krát v porovnání s odezvou senzoru při přímé detekci.
|
|
|
In situ study of nuclear acids interactions key for gene expression and therapy based on its silencing
Špringer, Tomáš
V dizertační práci studujeme nová analoga odvozená od R06 aptameru cílící na TAR vlásenku HIV viru s použitím citlivého biosensoru s povrchovými plasmony, který umožňuje sledování molekulárních interakcí v reálném čase. Vyšetřujeme sedm různých modifikací, které jsou umístěné na devíti pozicích R06 aptameru, a odhalujeme jejich použitelnost při tvorbě účinných a stálých anti-TAR oligonukleotidů. Dále zjišťujeme, které pozice jsou vhodné pro nahrazení modifikací, a zároveň interpretujeme výsledky v kontextu lokální nukleotidové geometrie a interakcí v TAR/anti-TAR komplexu. V dizertační práci dále vyvíjíme nový fluidický systém, který eliminuje disperzi vzorku a míšení vzorků, a tak umožňuje přesné sledování molekulárních interakcí na povrchu SPR čipu. Pro charakterizaci podmínek měření na povrchu oligonukleotidového čipu studujeme stínící efekt jednomocných a dvoumocných kationtů, které jsou klíčové pro interakci záporně nabitých oligonukleotidů.
|
|
|
In situ study of nuclear acids interactions key for gene expression and therapy based on its silencing
Špringer, Tomáš
V dizertační práci studujeme nová analoga odvozená od R06 aptameru cílící na TAR vlásenku HIV viru s použitím citlivého biosensoru s povrchovými plasmony, který umožňuje sledování molekulárních interakcí v reálném čase. Vyšetřujeme sedm různých modifikací, které jsou umístěné na devíti pozicích R06 aptameru, a odhalujeme jejich použitelnost při tvorbě účinných a stálých anti-TAR oligonukleotidů. Dále zjišťujeme, které pozice jsou vhodné pro nahrazení modifikací, a zároveň interpretujeme výsledky v kontextu lokální nukleotidové geometrie a interakcí v TAR/anti-TAR komplexu. V dizertační práci dále vyvíjíme nový fluidický systém, který eliminuje disperzi vzorku a míšení vzorků, a tak umožňuje přesné sledování molekulárních interakcí na povrchu SPR čipu. Pro charakterizaci podmínek měření na povrchu oligonukleotidového čipu studujeme stínící efekt jednomocných a dvoumocných kationtů, které jsou klíčové pro interakci záporně nabitých oligonukleotidů.
|
|
|
In situ study of nuclear acids interactions key for gene expression and therapy based on its silencing
Špringer, Tomáš ; Štěpánek, Josef (vedoucí práce) ; Brynda, Eduard (oponent) ; Vorlíčková, Michaela (oponent)
V dizertační práci studujeme nová analoga odvozená od R06 aptameru cílící na TAR vlásenku HIV viru s použitím citlivého biosensoru s povrchovými plasmony, který umožňuje sledování molekulárních interakcí v reálném čase. Vyšetřujeme sedm různých modifikací, které jsou umístěné na devíti pozicích R06 aptameru, a odhalujeme jejich použitelnost při tvorbě účinných a stálých anti-TAR oligonukleotidů. Dále zjišťujeme, které pozice jsou vhodné pro nahrazení modifikací, a zároveň interpretujeme výsledky v kontextu lokální nukleotidové geometrie a interakcí v TAR/anti-TAR komplexu. V dizertační práci dále vyvíjíme nový fluidický systém, který eliminuje disperzi vzorku a míšení vzorků, a tak umožňuje přesné sledování molekulárních interakcí na povrchu SPR čipu. Pro charakterizaci podmínek měření na povrchu oligonukleotidového čipu studujeme stínící efekt jednomocných a dvoumocných kationtů, které jsou klíčové pro interakci záporně nabitých oligonukleotidů.
|
|
|
Funkční nanočástice pro plasmonické biosenzory
Přítulová, Marie ; Salyk, Ota (oponent) ; Vala, Martin (vedoucí práce)
Tato diplomová práce je zaměřena na přípravu zlatých nanočástic a jejich použití pro citlivou detekci karcinoembryonálního antigenu (CEA) pomocí biosenzoru s povrchovými plasmony. V této práci byla studována příprava koloidních nanočástic. Sférické nanočástice s hladkým povrchem o velikosti 100 nm byly připraveny zoptimalizovanou tříkrokovou syntézou. Zlaté nanočástice byly následně funkcionalizovány monovrstvou alkyl-thiolů a molekulami streptavidinu. Takto funkcionalizované nanočástice byly charakterizovány UV/VIS spektroskopií a změřením zeta-potenciálu. Následně byly tyto nanočástice použity pro citlivou detekci CEA a bylo ukázáno, že zesilují odezvu senzoru 100krát v porovnání s odezvou senzoru při přímé detekci.
|
host ::
RSS.