|
|
How predictable is genome evolution? Insights from convergent adaptations across Brassicaceae
Bohutínská, Magdalena ; Kolář, Filip (vedoucí práce) ; Novikova, Polina Yu (oponent) ; Hobza, Roman (oponent)
Adaptace, proces šíření výhodných alel, umožňuje populacím a druhům čelit nepříznivým podmínkám prostředí. Příklady konvergentní adaptace (zde použita jako synonymum k paralelní) ukazují důležitost přírodního výběru pro formování biologické diversity a umožňují zjišťovat, do jaké míry je genetická podstata evoluce předvídatelná. Mnoho nedávných genomických studií odhalilo, že je konvergentní evoluce na úrovni genomu rozšířená. Jenže konkrétní podoba se velmi liší, od odpovědi pomocí stejných molekulárních drah ale různých míst v genomu (funkční konvergence) po opakovanou adaptaci pomocí stejných genů (opětovné použití genů). To vede k otázce, jestli takto variabilní systém umožňuje jakékoliv predikce ohledně mechanismů zodpovědných za konvergentní adaptaci. Spekuluje se, že se způsoby konvergentní adaptace liší podle příbuznosti zkoumaných linií. Jenže tato možná závislost nikdy nebyla testována na jednotném modelovém systému napříč škálou různých příbuzností, a tak se nemohla potvrdit ani ona, ani její možné příčiny. V předkládané PhD práci jsem empiricky zjišťovala jak a proč se genomická konvergence liší s klesající příbuzností. Jako příklad jsem použila konvergentní adaptaci k vnějším (alpinské prostředí) a vnitřním (celogenomová duplikace) podmínkám. Ty jsem studovala v rostlinné modelové...
|
|
|
Structure and evolution of plant sex chromosomes: The use of BAC library
Kejnovský, Eduard ; Lengerová, Martina ; Hobza, Roman ; Široký, Jiří ; Vyskot, Boris
Sex chromosomes of plant species Silene latifolia are the ideal model for evolutionary biology studies because they represent early stages of X and Y chromosomes history. We used fluorescence in situ hybridization (FISH) with bacterial artificial chromosome (BAC) clones in studies of chromosome structure to demonstrate that a majority of genes are located in subtelomeric regions of all chromosomes. Our results also indicate the absence of accumulation of main classes of repetitive sequences - retroelements and centromeric tandem repeats - in non-recombining parts of the sex chromosomes.
|
|
|
Genetic and epigenetic acpects of sex determination
Janoušek, Bohuslav ; Hodurková, Jaromíra ; Žlůvová, Jitka ; Lengerová, Martina ; Hobza, Roman ; Nix, Tomáš ; Vyskot, Boris
The article concentrates on the latest knowledge concerning the role of epigenetic mechanisms in sex determination in model dioecious species Silene latifolia. Results suggest that the locus suppressing development of female organs in male plants is hypersensitive to the action of agents influencing level of DNA methylation (5-azacytidine) and histone acetylation (trichostatin A). According to the results obtained via inter-specific hybridisation and the ability of the smut Ustilago violacea to activate development of male organs in female plants, it can be deduced that there is a locus suppressing male organ development in standard female plants. Function of this locus is not influenced by the drugs mentioned above.
|
host ::
RSS.