|
|
Ion Specific Hofmeister Effects on Peptides and Proteins
Hladílková, Jana ; Jungwirth, Pavel (vedoucí práce) ; Ettrich, Rüdiger (oponent) ; Horinek, Dominik (oponent)
Název práce: Iontově specifické hofmeisterovské efekty na peptidy a proteiny Autor: Ing. Jana Hladílková Katedra: Fyzikální a makromolekulární chemie Vedoucí doktorské práce: Prof. Pavel Jungwirth, DSc., ÚOCHB AV ČR E-mail vedoucího: pavel.jungwirth@uochb.cas.cz Abstrakt: V této dizertaci byla použita klasická molekulová dynamika s pokročilými metodami analýzy dat pro doplnění a zároveň objasnění jevů týkající se Hofmeisterovy řady iontů. V kombinaci se širokým spekterem experimentálních metod byly studovány jak reálné proteiny, tak i modelové systémy v roztocích hofmeisterovských solí. Cílem práce bylo identifikovat a kvantifikovat specifické interakce iontů s peptidy a proteiny, které způsobují výsledné hofmeistrovské řazení kationtů a aniontů, či které toto pravidlo porušují. Příkladem nehofmeisterovského chování je zrychlení enyzmatické reakce BHMT transferázy pomocí draselných iontů, zatímco ostatní běžné monovalentní kationty nemají tento efekt. Molekulové simulace nám umožnily určit a detailně popsat vazebné místo poblíž aktivního místa enzymu, které bylo později krystalograficky potvrzeno. Specificita pro draselný kation byla vysvětlena na základě hydratačních vlastností jednotlivých kationtů a interakcí se záporně nabitými rezidui aktivního místa. Naproti tomu pouze malý efekt monovalentních...
|
|
|
Mobilization of neutral compounds by inorganic and small organic ions in capillary electrophoresis
Křížek, T. ; Martínková, E. ; Kubíčková, A. ; Hladílková, Jana ; Coufal, P. ; Heyda, J. ; Jungwirth, Pavel
The present study shows that neutral low-molecular-mass compounds that are presumed to possess zero electrophoretic mobility and are thus used as markers of electroosmotic flow in capillary electrophoresis can acquire electrophoretic mobility due to ion-specific interactions with constituents of background electrolyte. Therefore, these neutral markers, such as thiourea or dimethyl sulfoxide, can be separated in electric field and their migration order can vary depending on background electrolyte composition. This observation has some important implications for analytical and physico-chemical measurements using capillary electrophoresis because the choice of the marker-background electrolyte combination can influence the results of the measurement.
|
host ::
RSS.