|
Návrh, syntéza a hodnocení heterocyklických sloučenin s potenciální antimikrobní aktivitou I
Brányik, Michal ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Demuth, Jiří (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Název diplomové práce: Návrh, syntéza a hodnocení heterocyklických látek s potenciální antimikrobní aktivitou I Řešitel: Michal Brányik Vedoucí diplomové práce: doc. PharmDr. Jan Zitko, Ph.D. Konzultant: PharmDr. Martin Juhás, Ph.D. Antimikrobiální rezistence je stále rostoucím celosvětovým problémem. Mnoho bakteriálních kmenů vykazuje rezistenci vůči doposud účinným sloučeninám a právě proto je stěžejní pokračovat v hledání nových účinných látek. Tento problém se nevyhýbá ani původci tuberkulózy, Mycobacterium tuberculosis. Právě toto onemocnění je dle statistik WHO nejčastější příčinou úmrtí, jenž je způsobeno jedním patogenem, a proto je věnováno velké úsilí vývoji nových léčiv. Látky navržené a připravené jako součást této diplomové práce strukturně vycházejí ze sloučenin obsahujících fragment 2-aminooxazolu (2-aminothiazolu) a substituovaných pyridinkarboxamidů a pyrazinkarboxamidů. Struktura sloučenin byla charakterizována 1 H a 13 C NMR spektry, IR spektry a hmotnostní spektrometrií. Takto bylo připraveno a popsáno 13 nových látek. U všech těchto látek byla testována jejich antimikrobiální aktivita na čtyřech grampozitivních a čtyřech gramnegativních kmenech bakterií, následně také...
|
|
Příprava konjugátů oligonukleotidových sond s funkčními molekulami.
Grossová, Petra ; Miletín, Miroslav (vedoucí práce) ; Demuth, Jiří (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Školitel: doc. PharmDr. Miroslav Miletín, Ph.D. Konzultantka: Mgr. Michaela Beranová Studentka: Petra Grossová Název diplomové práce: Příprava konjugátů oligonukleotidových sond s funkčními molekulami Cílem této diplomové práce bylo najít optimální podmínky konjugace oligonukleotidu s fluorescenčním barvivem pomocí click chemie na pevné fázi. Za značící molekulu bylo vybráno tradiční fluorescenční barvivo Cyanine5. Byl sledován vliv použité koncentrace fluorescenčního barviva, pozice značení, pevné fáze a doby reakce. Byly optimalizovány podmínky deprotekce. Byly provedeny 2 série reakcí s následnou deprotekcí a čištěním. Efektivita reakce byla vyhodnocována porovnáním ploch pod křivkou píků konjugovaných a nekonjugovaných molekul v chromatogramech vzorků po analýze metodou HPLC s UV detekcí. Integrace píků byla provedena v programu LabSolutions. Nejvyšší výtěžnost poskytovaly reakce probíhající na polystyrenové pevné fázi, a to při značení na všech pozicích řetězce. Pro značení na 5'-konci řetězce bylo dosaženo více než 90% výtěžnosti při použití všech námi testovaných pevných fází. Dále bylo zjištěno, že pro click reakci postačuje koncentrace fluorescenčního barviva 100× nižší, než je...
|
|
Syntéza a studium supramolekulárních vlastností azaftalocyaninů využitelných jako senzory
Sikorová, Eliška ; Demuth, Jiří (vedoucí práce) ; Kučerová, Marta (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát Eliška Sikorová Školitel PharmDr. Jiří Demuth, Ph.D. Název diplomové práce Syntéza a studium supramolekulárních vlastností azaftalocyaninů využitelných jako senzory Azaftalocyaniny jsou planární aromatické makrocykly, které byly odvozeny od přírodních porfyrinů. Základní skelet tvoří čtyři isoindolové jednotky, které jsou spojeny v pozicích 1 a 3 azamethinovými můstky, čímž vzniká rozsáhlý systém konjugovaných dvojných vazeb, díky němuž vykazují tyto sloučeniny unikátní optické a elektrické vlastnosti. Azaftalocyaniny nacházejí široké využití, a to jako průmyslová barviva, konduktory, fotosenzitizéry používané ve fotodynamické terapii, zhášeče fluorescence či fluorescenční senzory a další. Sloučeniny nasyntetizované během této diplomové práce lze použít jako zajímavý typ senzorů pro sledování koordinačních analytů v roztoku. Proto se tato práce dále zabývá studiem supramolekulárních vlastností nasyntetizovaných sloučenin, a to především schopností tvořit agregáty typu J-dimerů, které vznikají koordinací periferního dusíku pyridylu na centrální zinečnatý kationt druhého azaftalocyaninu. J-dimery připomínají "schodovité" uspořádání na rozdíl od druhého typu agregace, a to...
|
|
Návrh, syntéza a hodnocení heterocyklických sloučenin s potenciální antimikrobní aktivitou I
Brányik, Michal ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Demuth, Jiří (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Název diplomové práce: Návrh, syntéza a hodnocení heterocyklických látek s potenciální antimikrobní aktivitou I Řešitel: Michal Brányik Vedoucí diplomové práce: doc. PharmDr. Jan Zitko, Ph.D. Konzultant: PharmDr. Martin Juhás, Ph.D. Antimikrobiální rezistence je stále rostoucím celosvětovým problémem. Mnoho bakteriálních kmenů vykazuje rezistenci vůči doposud účinným sloučeninám a právě proto je stěžejní pokračovat v hledání nových účinných látek. Tento problém se nevyhýbá ani původci tuberkulózy, Mycobacterium tuberculosis. Právě toto onemocnění je dle statistik WHO nejčastější příčinou úmrtí, jenž je způsobeno jedním patogenem, a proto je věnováno velké úsilí vývoji nových léčiv. Látky navržené a připravené jako součást této diplomové práce strukturně vycházejí ze sloučenin obsahujících fragment 2-aminooxazolu (2-aminothiazolu) a substituovaných pyridinkarboxamidů a pyrazinkarboxamidů. Struktura sloučenin byla charakterizována 1 H a 13 C NMR spektry, IR spektry a hmotnostní spektrometrií. Takto bylo připraveno a popsáno 13 nových látek. U všech těchto látek byla testována jejich antimikrobiální aktivita na čtyřech grampozitivních a čtyřech gramnegativních kmenech bakterií, následně také...
|
|
Synthesis and study of subphthalocyanines axially modified with an amino adamantyl
Danková, Eva ; Nováková, Veronika (vedoucí práce) ; Demuth, Jiří (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát Eva Danková Školiteľ doc. PharmDr. Veronika Nováková, Ph.D. Názov diplomovej práce Syntéza a studium subftalocyaninů axiálně modifikovaných amino adamantylem Fotodynamická terapia je sľubným prístupom liečby rakoviny, ktorý spočíva v aplikácii fotosenzitizéru a následnej iluminácii tumoru. Vzniknutý oxidačný stres aktivuje niekoľko mechanizmov bunkovej smrti. Jednou z nových skupín fotosenzitizérov sú subftalocyaníny s kužeľovitým π povrchom, ktorý ich činí menej náchylnými k agregácii a umožňuje vedľa klasickej periférnej substitúcie aj ich axiálnu modifikáciu. Pretože je makrocyklus sám o sebe pomerne lipofilný, je nutné zvýšiť jeho rozpustnosť vo vode. Táto práca sa zaoberala možnosťou tvorby supramolekulárnych komplexov s navonok hydrofilnými makrocyklami s cieľom zvýšit hydrofilitu subftalocyanínu. Konkrétne bol vybraný kukurbituril-7 (CB[7]), pretože vytvára vo vode jednu z najstabilnejších supramolekulárnych interakcií s 1-aminoadamantánom, ktorý bol zamýšľaný ako axiálny substituent na subftalocyanínovom jadre. Syntéza pôvodne plánovaných látok periférne substituovaných etylsulfanylovými skupinami nepriniesla uspokojivé výsledky. Preto boli navrhnuté alternatívne...
|
|
Návrh, syntéza a hodnocení derivátů pyridinu jako potenciálních antimikrobních sloučenin
Bachtíková, Andrea ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Demuth, Jiří (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Název diplomové práce: Návrh, syntéza a hodnocení derivátů pyridinu jako potenciálních antimikrobních sloučenin Řešitel: Andrea Bachtíková Vedoucí diplomové práce: doc. PharmDr. Jan Zitko, Ph.D. Konzultant: PharmDr. Martin Juhás I v dnešní době je tuberkulóza celosvětovým problémem. Dle WHO se jedná o 2. nejčastější příčinu úmrtí na infekční onemocnění, přičemž u klasických antituberkulotik, která jsou v terapii využívána už desítky let, je čím dál častěji zaznamenáván výskyt rezistence. Tyto skutečnosti jsou hlavními důvody, proč je potřeba věnovat se výzkumu nových potenciálních léčiv. V této diplomové práci je prezentován design, syntéza a hodnocení antimikrobních vlastností série substituovaných N-oxazolyl a N-thiazolylkarboxamidů různých pyridinkarboxylových kyselin. Finální sloučeniny byly charakterizovány 1 H a 13 C-NMR spektroskopií, IČ spektry, teplotou tání a HRMS (hmotnostní spektrometrie s vysokým rozlišením). U získaných sloučenin byla testována aktivita in vitro proti M. tuberculosis H37Rv, M. tuberculosis H37Ra a čtyřem dalším, klinické méně významným mykobakteriálním kmenům. Dále byla u sloučenin testována antibakteriální aktivita na čtyřech kmenech G+ a čtyřech kmenech G-...
|
|
Syntéza a studium subftalocyaninů axiálně modifikovaných amino adamantylem
Danková, Eva ; Nováková, Veronika (vedoucí práce) ; Demuth, Jiří (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát Eva Danková Školiteľ doc. PharmDr. Veronika Nováková, Ph.D. Názov diplomovej práce Syntéza a studium subftalocyaninů axiálně modifikovaných amino adamantylem Fotodynamická terapia je sľubným prístupom liečby rakoviny, ktorý spočíva v aplikácii fotosenzitizéru a následnej iluminácii tumoru. Vzniknutý oxidačný stres aktivuje niekoľko mechanizmov bunkovej smrti. Jednou z nových skupín fotosenzitizérov sú subftalocyaníny s kužeľovitým π povrchom, ktorý ich činí menej náchylnými k agregácii a umožňuje vedľa klasickej periférnej substitúcie aj ich axiálnu modifikáciu. Pretože je makrocyklus sám o sebe pomerne lipofilný, je nutné zvýšiť jeho rozpustnosť vo vode. Táto práca sa zaoberala možnosťou tvorby supramolekulárnych komplexov s navonok hydrofilnými makrocyklami s cieľom zvýšit hydrofilitu subftalocyanínu. Konkrétne bol vybraný kukurbituril-7 (CB[7]), pretože vytvára vo vode jednu z najstabilnejších supramolekulárnych interakcií s 1-aminoadamantánom, ktorý bol zamýšľaný ako axiálny substituent na subftalocyanínovom jadre. Syntéza pôvodne plánovaných látok periférne substituovaných etylsulfanylovými skupinami nepriniesla uspokojivé výsledky. Preto boli navrhnuté alternatívne...
|
|
Synthesis of isoprenoid naringenin derivatives
Kernal, Jakub ; Zimčík, Petr (vedoucí práce) ; Demuth, Jiří (oponent)
4 Abstrakt Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát Jakub Kernal Konzultant Hubert Chapuis, Ph.D. Název diplomové práce , intenzivního výzkumu pro své antibakteriální, antimykotické a cytotoxické - v této práci (Fig. 1) cí hydroxylové skupiny flavonoidu v poloze 4 , nebo esterifikací hydroxylových skupin na obou kruzích flavonoidu A -uhlík na kruhu A flavonoidu. Fig. 1. Modifikace molekuly naringeninu esterifikace (modrá) nebo tvroba vazby uhlík-uhlík .
|
|
Studium azaftalocyaninů jako zhášečů fluorescence v oligodeoxynukleotidových sondách
Demuth, Jiří ; Nováková, Veronika (vedoucí práce) ; Hocek, Michal (oponent) ; Vávrová, Kateřina (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát: Mgr. Jiří Demuth Školitel: doc. PharmDr. Veronika Nováková, Ph.D. Konzultant: prof. PharmDr. Petr Zimčík, Ph.D. Disertační práce: Studium azaftalocyaninů jako zhášečů v oligo-deoxynukleotidových sondách Ftalocyaniny (Pcs) a azaftalocyaniny (AzaPcs) jsou planární makrocyklické sloučeniny, které mají čistě syntetický původ, byť jsou odvozeny od přírodních barviv - porfyrinů. Díky rozsáhlému 18 -elektronovému konjugovanému systému mají Pcs a AzaPcs velice zajímavé fotofyzikální vlastnosti, a proto nacházejí uplatnění v elektrotechnice, jako materiál v průmyslu či v medicinálních disciplínách. Oktaaminoalkyl substituované tetrapyrazinoporfyraziny (TPyzPzs), které patří do rodiny AzaPcs, mají díky extrémně rychlému intramolekulárnímu přenosu náboje prakticky nulovou vlastní fluorescenci. Využitím této schopnosti v oblasti vývoje fluorescenčních sond, kde se dají tyto TPyzPzs použít jako účinné zhášeče pro různé fluorofory, se zabývá tato disertační práce. Takovéto sondy mohou najít uplatnění v různorodých experimentech napříč vědními obory např. biochemie, forenzní či genetická analýza. Syntetická část disertační práce navazuje na předchozí studium TPyzPzs v naší výzkumné...
|
|
Studium azaftalocyaninů jako zhášečů fluorescence v oligodeoxynukleotidových sondách
Demuth, Jiří ; Nováková, Veronika (vedoucí práce) ; Hocek, Michal (oponent) ; Vávrová, Kateřina (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát: Mgr. Jiří Demuth Školitel: doc. PharmDr. Veronika Nováková, Ph.D. Konzultant: prof. PharmDr. Petr Zimčík, Ph.D. Disertační práce: Studium azaftalocyaninů jako zhášečů v oligo-deoxynukleotidových sondách Ftalocyaniny (Pcs) a azaftalocyaniny (AzaPcs) jsou planární makrocyklické sloučeniny, které mají čistě syntetický původ, byť jsou odvozeny od přírodních barviv - porfyrinů. Díky rozsáhlému 18 -elektronovému konjugovanému systému mají Pcs a AzaPcs velice zajímavé fotofyzikální vlastnosti, a proto nacházejí uplatnění v elektrotechnice, jako materiál v průmyslu či v medicinálních disciplínách. Oktaaminoalkyl substituované tetrapyrazinoporfyraziny (TPyzPzs), které patří do rodiny AzaPcs, mají díky extrémně rychlému intramolekulárnímu přenosu náboje prakticky nulovou vlastní fluorescenci. Využitím této schopnosti v oblasti vývoje fluorescenčních sond, kde se dají tyto TPyzPzs použít jako účinné zhášeče pro různé fluorofory, se zabývá tato disertační práce. Takovéto sondy mohou najít uplatnění v různorodých experimentech napříč vědními obory např. biochemie, forenzní či genetická analýza. Syntetická část disertační práce navazuje na předchozí studium TPyzPzs v naší výzkumné...
|