|
|
Matematická analýza dat v hmotnostní spektrometrii
Vlachová Hutová, Eliška ; Adam, Vojtěch (oponent) ; Valla, Martin (vedoucí práce)
V této bakalářské práci je teoreticky popsán princip metody hmotnostní spektrometrie a tandemové hmotnostní spektrometrie, využití metody v praxi a popis funkčnosti jednotlivých analyzátorů. Dále je uveden popis hmotnostního spektra a algoritmy pro jeho analýzu. Praktická část práce popisuje tvorbu analytického nástroje pro vyhodnocování spekter a následné použití tohoto programového nástroje pro praktickou analýzu flavonoidních sloučenin, konkrétně isoflavonů.
|
|
|
Alternative Methods for the Analysis of Structural Changes in Muscle Tissue
Kaspar, Pavel ; Hrabovský, Miroslav (oponent) ; Adam, Vojtěch (oponent) ; Grmela, Lubomír (vedoucí práce)
In this dissertation the topic of structural change analysis of muscle tissue and the methodical approach to this measurement is explored. Even though a considerable number of detection methods for the evaluation of specific changes in muscles exist, especially in the meat intended for consumption, the vast majority focuses only on a single process within the tissue and requires complicated approach and expensive instruments. The topic of this work is therefore not finding more precise and specific means of analysis, than the already existing ones, but rather to select an alternative approach to the given problematic. Part of the explored approach is also the endeavor to find a way to bypass the technological requirements while staying as close to the informational value of the high end methods as possible. To this end an informational base of theoretical knowledge and the experience in experimental approaches in the field of physics, optics and biological tissues and processes is required. The three main approaches described in this work are based on the acquired information throughout the research of the topic and understanding of the basic workings of muscle tissue. The methods created for this thesis make use of photons in the transmission and reflection measurement setup. By observing the changes in absorption, dispersion and polarization of the light after the interaction with muscle tissue sample the other optical parameters are evaluated, including the refractive index and optical anisotropy. The identification of changes in optical parameters together with the Monte Carlo simulation allows for distinction between fresh, aged, dried, frozen and thawed, and refrozen and thawed samples.
|
|
|
Synthesis of spherical gold nanoparticles for biomedical applications
Gablech, Evelína ; Adam, Vojtěch (oponent) ; Drbohlavová, Jana (vedoucí práce)
This paper deals with synthesis of spherical gold nanoparticles for various biomedical applications. Gold nanoparticles were synthetized by green methods. Considerable part of this thesis is devoted to green procedures. The aim of this work was to synthetize stable colloid gold nanoparticles suitable for various biomedical applications; especially for in vivo and in vitro bioimaging techniques. Review of these methods is included in theoretical part of this thesis as well. A cytotoxicity test was also provided. Gold nanoparticles were characterized by methods SEM, DLS, UV-VIS.
|
|
| |
|
|
Biosenzory na bázi modifikovaných TiO2 nanočástic
Valkovičová, Jiřina ; Adam, Vojtěch (oponent) ; Hubálek, Jaromír (vedoucí práce)
Práce je zaměřena na výrobu deponovaných kvantových teček z oxidu titaničitého za použití nanoporézní masky. Zabývá se zejména jejich luminiscenčními (fluorescenčními) vlastnostmi, díky kterým jsou vhodným základem biosenzoru určeného pro optickou detekci DNA. Dále je v práci uveden postup modifikace povrchu kvantových teček oxidu titaničitého zlatem přes nanoporézní masku metodou elektrochemické depozice a následnou funkcionalizaci povrchu oligonukleotidem. V případě přítomnosti nukleové kyseliny tato funkciolanlizace zaručuje její navázání na oligonukleotid pomocí hybridizace. Celý systém biosenzoru (QDs TiO2 upravené zlatem) je určen pro rychlou optickou diagnostiku virových onemocnění.
|
|
| |
|
|
Izolace a purifikace nukleových kyselin pomocí magnetizovatelných mikro- a nanočástic
Dostálová, Simona ; Adam, Vojtěch (oponent) ; Kizek, René (vedoucí práce)
Nukleové kyseliny jsou zcela jedinečnou složkou každého organismu. Určují jeho vzhled, chování nebo například dispozice k různým chorobám. I přes jejich důležitost je stále mnoho informací, které o nukleových kyselinách nejsou známy. Pro zkoumání nukleových kyselin je nutné je očistit od všech ostatních složek organismu. Běžné metody izolace a purifikace nukleových kyselin jsou ale často pracné a časově náročné, proto se nově vyvíjejí postupy využívající magnetickou separaci. Bakalářská práce se zabývá magnetizovatelnými mikro- a nanočásticemi a jejich využitím právě v oblasti izolace a purifikace nukleových kyselin. V práci jsou shrnuty obecné podmínky této izolace a jsou zde uvedeny metody detekce nukleových kyselin se zaměřením na elektrochemické metody. Je prezentován vhodný postup pro izolaci a purifikaci nukleových kyselin využívající magnetizovatelné částice a detekci pomocí square-wave voltametrie. V praktické části bakalářské práce byl tento postup optimalizován pro dosažení maximální výtěžnosti. Optimalizovány byly kroky promývání, imobilizace a eluce. Bylo zjištěno, že pro promytí částic před imobilizací nukleových kyselin na jejich povrch byl vhodným roztokem fosfátový pufr. Imobilizace probíhala po dobu 5 minut při teplotě 20 °C a mikrozkumavka během ní byla intenzivně třepána. Imobilizační roztok byl složen z 0,1M Na2HPO4 + 0,1M NaH2PO4, 0,6M guanidium thiokyanátu, 0,15M Tris-HCl o pH 7,5 a 2,5M CsCl. Pro promytí komplexu částice-nukleová kyselina po imobilizaci bylo vhodné použití 5M NaCl. Eluce probíhala po dobu 15 minut při teplotě 99 °C a optimálním elučním roztokem byl Tris-EDTA o pH 9,1.
|
|
|
The Effect of temperature treatment TiO2 nanoparticles on antibacterial properties
Bytesnikova, Z. ; Valeckova, V. ; Švec, P. ; Richtera, L. ; Šmerková, K. ; Vítek, Petr ; Adam, V.
The synthesis of TiO2 nanoparticles (NPs) under various temperature treatments was described and TiO2 NPs was subsequently tested as an antibacterial agent. Scanning electron microscopy (SEM), Raman spectroscopy, Dynamic light scattering (DLS) were used to confirm structure of TiO2 NPs and detect differences between individual batches treated with different temperature. Antibacterial properties were tested on Escherichia coli (E. coli). TiO2 NPs as photocatalyst was incubated with bacterial cells under ambient light. Changes in temperature treatment can affect diameter size and crystal structure of TiO2 NPs as well as its antibacterial properties.
|
|
|
Examination of the Spatial Structure of Pigs' Melanoma in Tissue Sections Based on Histology and Mass Spectrometry
Anýz, J. ; Vysloužilová, L. ; Horák, Vratislav ; Štěpánková, O. ; Vaculovič, T. ; Adam, V.
We examine the spatial structure of the melanoma in tissue sections. The pigs melanoma was examined in 10 tissue samples obtained from animals of age between 4 and 22 weeks. The tissue sections were measured by light microscopy and Laser Ablation Ion Inductively Coupled Plasma Mass Spectrometry to obtain spatial metal (Cu, Zn) distribution. The exploratory analysis of the tissue sections indicates there is clearly a pattern in the spatial structure. Different projections of the spatial structure of the melanoma are obtained by the different measurement methods. The spectral clustering on the data was utilized to describe the structure in the data. According to the clustering results, there are distinct clusters of observations in the histological data. The spatial elemental distribution of the metals Cu and Zn cannot be clustered -the data form one compact cluster. The clustering of the histological images produces clusters which are related to the annotation of the biological samples in broader terms -the differences between fibrous and cancerous tissue.
|
|
|
Characterization of upconversion nanoparticles by fluorescence spectrometry and capillary electrophoresis
Vaněčková, T. ; Zítka, J. ; Hlaváček, Antonín ; Adam, V. ; Vaculovičová, M.
Upconversion nanoparticles (UCNPs) are a novel class of luminescent tags for applications in life and material sciences. Unlike traditional fluorophores, UCNPs exhibit emission of shorter wavelength under near-infrared excitation (typically 980 nm). In this work, we have examined these unique photophysical properties by fluorescence spectrometry and capillary electrophoresis. UCNPs co-doped with Yb(III) and Er(III) were characterized using laboratory-made fluorescence spectrometer. We have exploited and evaluated two excitation sources and the dependence of the fluorescence of UCNPs on the relative excitation power. Moreover, capillary electrophoresis with laser-induced fluorescence (CE-LIF) detection was for the first time used for characterization of the nanoparticles. It was proved that CE-LIF is a valuable method to be used for investigation of upconversion luminiscence and monitoring of the interactions of UCNPs with other molecules of interest.
|
host ::
RSS.