|
|
Tail labelled oligonucleotide probes for the detection of DNA-protein interactions
Pivoňková, Hana ; Němcová, Kateřina ; Horáková Brázdilová, Petra ; Havran, Luděk ; Macíčková-Cahová, Hana ; Hocek, Michal ; Fojta, Miroslav
DNA-protein interactions can be monitored via different ways. We introduce novel, fast and simple approaches in DNA-protein interaction detection based on electrochemical measurements of DNA alone (structure-sensitive DNA sensing), or DNA modified with osmium tetroxide bearing nitrogenous ligands, or measurements of redox-active moieties enzymatically attached to the end of a DNA substrate thus forming a labeled tail (by terminal transferase).
|
|
|
Redox labelling of nucleic acids for analyzing nucleotide sequences and monitoring DNA-protein interactions
Fojta, Miroslav ; Havran, Luděk ; Horáková Brázdilová, Petra ; Pivoňková, Hana ; Kostečka, Pavel ; Macíčková-Cahová, Hana ; Raindlová, Veronika ; Vrábel, Milan ; Hocek, Michal
Nucleobase labelling of DNA for electrochemical sensing was attained through chemical modification of thymine bases with osmium tetroxide in the presence of nitrogenous ligands, or via enzymatic incorporation of nucleotide conjugates with redox-active moieties using labelled deoxynucleoside triphosphates. DNA hybridization, primer extension and PCR techniques were used for sequence-specific DNA assays. Tail-labelled DNA substrates were applied to monitor DNA binding by tumour suppressor p53 protein.
|
|
| |
|
| |
|
|
Některé nové přístupy k charakterizaci uhlíkových pastových elektrod
Mikysek, T. ; Švancara, I. ; Ludvík, Jiří ; Vytřas, K. ; Kalcher, K.
Carbon paste electrodes (CPEs) have several substantial advantages: their surface is easily renewable and it is possible to modify the electrode material in the bulk in order to prepare a specific sensor. The properties of the electrodes depend strongly on the used materials, that means on the carbon powder as well as on the oily binder, and on their proportions. Therefore the characterization of every type of such electrodes is very significant. We have found that the graph of the dependence of electrode resistance on the percentual composition manifests itself as two crossing lines. For the explanation of this dependence, a model based on the tight packing of spheres was suggested, formulated, tested and discussed. The other possibility how to characterize the electrodes is detailed interpretation of cyclic voltammetry of a reversible redox system. Both methods are compatible and enable to explain also problems with storage and ageing of electrodes.
|
|
| |
|
|
Elektrochemická detekce stopových množství nitrovaných výbušnin
Barek, J. ; Fischer, J. ; Vyskočil, V. ; Pecková, K. ; Navrátil, Tomáš ; Josypčuk, Bohdan
Nitrované organické sloučeniny patří k nejčastěji užívaným výbušninám. Detekce nízkých koncentrací těchto sloučenin je v současné době velice atraktivní. Díky snadné redukovatelnosti nitroskupiny se voltametrie jeví jako velmi vhodná metoda pro tyto účely. Pro tato stanovení byly užívány následující elektrody: visicí rtuťová kapková elektroda, meniskem modifikovaná stříbrná pevná amalgámová elektroda, miniaturizovaná pastová stříbrná amalgámová elektroda a pastová elektroda na bázi prášku stříbrného pevného amalgámu a vhodné organické pastovací kapaliny.
|
|
| |
|
| |
|
|
Využití prototypu multikanálového přístroje pro elektrochemickou detekci hybridizace DNA
Brázdilová, P. ; Navrátil, Tomáš ; Josypčuk, Bohdan ; Fojta, Miroslav
Příspěvek se zabývá nově zkonstruovaným 8-kanálovým přístrojem, který umožňuje sekvenční analýzu až na 8 různých nebo stejných čidlech. Přístroj je řízený počítačem. K tomuto přístroji byly připojovány uhlíkové tištěné elektrody (SPCE). Byla detekována hybridizace hybridizace DNA. DNA přítomná ve vzorku spontánně adsorbovala na povrch SPCE a volný povrch byl následně blokován pomocí hovězího sérového albuminu. Na adsorbovanou DNA byla poté hybridizována sonda značená biotinem a na ni pak byl navázán konjugát streptavidinu s enzymem alkalickou fosfatázou (SALP). Tento enzym katalyzuje přeměnu elektrochemicky neaktivního 1-naftylfosfátu přítomného v elektrolytu na aktivní 1-naftol, jehož anodický signál byl detekován pomocí stejnosměrné voltametrie (DCV).
|
host ::
RSS.