|
|
Radarový výškoměr pro ultralehký letoun
Zahradník, Jiří ; Zemčík, Pavel (oponent) ; Maršík, Lukáš (vedoucí práce)
V této bakalářské práci se autor zabývá návrhem a částečnou implementací radarového výškoměru. V této práci je kladen důraz na modulární architekturu a proto je tento výškoměr navržen jako soubor samostatných modulů komunikujících pomocí BSD schránek. Implementace programového vybavení je v C++ a pro generování zvuku je použita knihovna PulseAudio. Dále je zde řešena bezpečnost mezivláknové fronty a zásobníku pomocí třídy implementované jako šablona pro zachování jednoduchosti a obecnosti pro další využití.
|
|
|
Testování zranitelností v průmyslových sítích
Zahradník, Jiří ; Fujdiak, Radek (oponent) ; Blažek, Petr (vedoucí práce)
Práce simuluje vybrané zranitelnosti standardu IEC 61850 a následně řeší mitigační opatření pro zvolené zranitelnosti. Autor simuloval zranitelnosti protokolu GOOSE, útok na NTP a útok na MMS klienta. Konkrétně se jedná o GOOSE stNum, GOOSE semantic, GOOSE test bit, GOOSE replay, GOOSE flood, NTP spoofing a MMS password capture. Útoky na protokoly GOOSE a MMS byly úspěšné, útok na NTP byl pouze částečně úspěšný, kdy došlo k potvrzení přijatého času, ale ne k jeho převzetí. Autor následně navrhnul možná mitigační opatření. Byl také vytvořen automatizační nástroj pro testování daných zranitelností, parser pro protokol GOOSE a přenositelný parser konfiguračních souborů.Výsledky práce umožňují implementovat rozsáhlejší nástroj pro penetrační testování prů-myslových sítí, stejně jako umožňují implementovat daná mitigační opatření.
|
|
|
Evoluce systému RAYT/REP u bakterií rodu Stenotrophomonas
Staněk, Tadeáš ; Nunvář, Jaroslav (vedoucí práce) ; Zahradník, Jiří (oponent)
REP (repetitivní extragenové palindromy) jsou krátké DNA elementy nacházející se v mezigenových oblastech řady bakterií, běžně ve stovkách kopií na genom. Neschopny vlastní mobilizace jsou REP šířeny pomocí RAYT (REP asociovaná tyrosinová transpozáza). Stenotrophomonas jsou gamaproteobakterie s širokou ekologickou nikou. RAYT/REP systémy jsou u těchto bakterií rozšířené, u 102 kmenů bylo celkem nalezeno přes 132 tisíc elementů. V genomech koexistuje několik sekvenčních tříd REP, pro vysokou početnost daného REP je zásadní přítomnost asociovaného RAYT. REP jsou lokalizovány v "REP lokusech", řadě intergenových oblastí s vysokou evoluční dynamikou - v daném lokusu se mění počty, sekvence i orientace REP. Kromě genomových ostrovů chybí REP v oblasti terminace replikace, v regionu vykazujícím nestandardní evoluční dynamiku (proměnlivý počet a pořadí genů), pravděpodobně související se segregací chromozomu. Stenotrophomonas jsou bohaté na inserční sekvence (IS). Bylo identifikováno 35 unikátních IS a ověřen cíl jejich inzerce. Zástupci deseti IS specificky insertují do REP, další čtyři IS cílí do YPAL (Yersinia palindromické elementy) - intergenových DNA motivů doposud známých jen u rodu Yersinia. Celkem 14 z 35 IS u Stenotrophomonas cílí na intergenové motivy, počtem kopií přitom tvoří 75% všech IS....
|
|
| |
|
| |
|
| |
|
|
Rychlé interferenční vlny a 1D seismické modely kůry
Vackář, Jiří ; Zahradník, Jiří (vedoucí práce) ; Prokop Brokešová, Johana (oponent)
Při nedávném mělkém zemětřesení v Korintském zálivu v Řecku (Mw 5,3) byly po- zorovány neobvyklé dlouhoperiodické vlny (periody 5 sekund a více). Zaznamenány byly na několika regionálních stanicích mezi příchodem P- a S-vlny. Pětisekundová perioda je mnohem delší než trvání zdroje a ukazuje na efekt struktury. Pozorované seismogramy byly zkoumány metodami frekvenčně-časové analýzy. Určené disperzní křivky rychlé dlou- hoperiodické vlny měly grupové rychlosti od 3 do 5,5 km/s pro periody v rozsahu 4-10 s, s velkými rozdíly mezi stanicemi. Zobecněná disperzní křivka se rozděluje do dvou hlav- ních pásů, pravděpodobně spojených s laterálními variacemi zemské kůry. Řešením přímé úlohy pro více existujících modelů kůry a jejich modifikací jsme provedli analýzu citli- vosti, která ukázala, že zkoumaná vlna je ovlivněna zejména nízkorychlostními vrstvami v nejsvrchnějších cca 4 kilometrech kůry. Závěrem jsme získali model mělké kůry inverzí seismogramů pomocí algoritmu nejbližší soused. Inverze potvrdila, že zkoumanou vlnu je možné vysvětlit 1-D modelem kůry, ale ne na více stanicích najednou. Modely závislé na dráze šíření představují částečné vysvětlení pro pásy tvořené pozorovanými disperzními křivkami. Jinou alternativou je příspěvek několika tzv. prosakujícíh módů.
|
|
| |
|
|
Y1 a Y2 transponázy, mechanizmus transpozice, biologická funkce.
Zahradník, Jiří ; Lichá, Irena (vedoucí práce) ; Schierová, Michaela (oponent)
Transponázy jsou enzymy katalyzující štěpení, přenos a opětovné vložení mobilního genetického elementu do DNA. Tyrozinové transponázy zaujímají mezi těmito enzymy zcela unikátní postavení. Jejich výjimečnost je dána strukturou a odlišným mechanizmem transpoziční reakce, v kterém vždy figuruje kovalentní fosfotyrozinový intermediát. Nezbytná přítomnost katalytického tyrozinu dala těmto enzymům jméno a zároveň je umožňuje dále členit na skupinu nesoucí pouze jeden katalytický tyrozin - Y1 transponázy a na skupinu se dvěma - Y2 transponázy. Tato práce shrnuje současné poznatky o skupině tyrozinových transponáz. Zabývá se jejich výskytem, strukturou, reakčním mechanizmem a biologickou funkcí. Detailně je popsán reakční mechanizmus nejvíce prostudované Y1 transponázy asociované s IS608 elementem. Dále se práce zaměřuje na ostatní členy rodiny tyrozinových transponáz nesoucí charakteristický HUH motiv: Transponázy asociované s inzerčními sekvencemi rodiny IS200/IS605 (Y1), transponázy asociované s REP elementy (tzv. RAYT proteiny), transponázy asociované s IS91 (Y2), transponázy se společným regionem (ISCRs, Y1) a neobvyklé eukaryotní transponázy rodiny Helitron (Y2). Mezi tyrozinové transponázy patří dva jedinečné příklady domestikace těchto enzymů u prokaryot (RAYT, IStrony). Charakterizace mechanizmu...
|
|
|
Studium zdrojového procesu řeckých zemětřesení
Červinková, Dana ; Zahradník, Jiří (vedoucí práce) ; Opršal, Ivo (oponent)
Nazev pracc: Studium zdrojoveho procesu feckych zemetfeseni Autor: Dana Cervinkova Katedra (ustav): Katedra geofy/iky Vedouci bakalarskc pracc: Prof. RNDr. Jin' /ahradnik, DrSc. e-mail vcdoucnio:jz(a)karel.lroja.mff.cuni.cz Abstrakt: V teto praci je sludovana dlouhopcriodicka porucha vyskytujici se v seismogramcch blizkych zemetfeseni na horizontalnich slozkach, projevujfci sc jako jednostranny puls. Porucha je numericky modelovana jako rcakcc sirokopasmoveho seismometru na skokovou /menu /rychleni. Modclova porucha je potom ze zaznamu odcctcna. Modclova porucha je charaklerizovana dvema parametry, casein nasa/cni a amplitudou skoku /rychleni. Postup zpracovani je uka/an na scdmi /emetfesenich zoblasti Korinlskcho /alivu, za/namcnanych na stanicich v Sergoule a Mamousii, spolecne provozovanych UK-MFI-" a univer/ilou v Patrasu. Z vysledku vyplyva, ze parametry poruchy jsou obecne ruzne pro dve hori/ontalm' slozky zaznamu tehoz zemetreseni na dane stanici. Ve zkoumanych pfipadcch mela vzdy porucha na slozce F,W vfil§i amplitudu ncz na slozce NS. V budoucnosti by bylo vhodne mctodu modelovani a odstraneni poruchy, popsanou v teto praci, automatizovat. Odstraneni poruch je ne/.bytnou podminkou pro pouzitelnost zaznamu pro dalsi fyzikalni vyzkum. Klieova slova: zemelrescnf, dlouhoperiodicka porucha,...
|
host ::
RSS.