Hlavní stránka > Výsledky hledání: Navarro, Gonzalo
Hledej:
Tipy pro vyhledávaní :: Rozšířené hledání
Hledej ve sbírkách:
Seřadit podle: Zobrazit výsledky: Výstupní formát:
Národní úložiště šedé literatury Nalezeno 2 záznamů.  Hledání trvalo 0.00 vteřin. 
Similarity Search in Protein Databases
 Hoksza, David ; Skopal, Tomáš (vedoucí práce) ; Navarro, Gonzalo (oponent) ; Svozil, Daniel (oponent)
Jedna z hlavních operací v oblasti bioinformatiky je prirazení podobnosti proteinových sekvencí a struktur. Toto prirazení se využívá v širokém spektru aplikací jako je predikce proteinové struktury, prirazení funkce, automatická klasifikace, atd. Proteinové databáze zaznamenaly v posledních letech exponenciální rust dat, címž se stávající metody pro extrakci podobnosti stávají nevhodnými vzhledem k objemu dat. V této práci se zabýváme podobnostním vyhledáváním na úrovni proteinové sekvence a struktury. Na obou úrovních navrhujeme vylepšení stávajících metod, stejne jako nové metody pro práci s proteiny z hlediska podobnosti. V první cásti se zabýváme podobnostním vyhledáváním na úrovni proteinové sekvence. Nejdríve zkoumáme možnosti aplikace metrických prístupových metod pro efektivní uložení a vyhledávání sekvencí. Poté se zamerujeme na podobnostní míru proteinových sekvencí jako takovou. Výpocet podobnosti proteinových sekvencí je založen na dynamickém programování a proto navrhujeme vylepšení za úcelem zrychlení vyhledávání znovuvyužíváním cástí matice dynamického programování pri zachování presnosti vyhledávání. Druhá cást práce se zabývá podobností proteinových struktur. Predstavujeme nový prístup k reprezentaci proteinových struktur, který je invariantní s ohledem na posun a rotaci. Invariance...
Úplný záznam
Similarity Search in Protein Databases
 Hoksza, David ; Skopal, Tomáš (vedoucí práce) ; Navarro, Gonzalo (oponent) ; Svozil, Daniel (oponent)
Jedna z hlavních operací v oblasti bioinformatiky je prirazení podobnosti proteinových sekvencí a struktur. Toto prirazení se využívá v širokém spektru aplikací jako je predikce proteinové struktury, prirazení funkce, automatická klasifikace, atd. Proteinové databáze zaznamenaly v posledních letech exponenciální rust dat, címž se stávající metody pro extrakci podobnosti stávají nevhodnými vzhledem k objemu dat. V této práci se zabýváme podobnostním vyhledáváním na úrovni proteinové sekvence a struktury. Na obou úrovních navrhujeme vylepšení stávajících metod, stejne jako nové metody pro práci s proteiny z hlediska podobnosti. V první cásti se zabýváme podobnostním vyhledáváním na úrovni proteinové sekvence. Nejdríve zkoumáme možnosti aplikace metrických prístupových metod pro efektivní uložení a vyhledávání sekvencí. Poté se zamerujeme na podobnostní míru proteinových sekvencí jako takovou. Výpocet podobnosti proteinových sekvencí je založen na dynamickém programování a proto navrhujeme vylepšení za úcelem zrychlení vyhledávání znovuvyužíváním cástí matice dynamického programování pri zachování presnosti vyhledávání. Druhá cást práce se zabývá podobností proteinových struktur. Predstavujeme nový prístup k reprezentaci proteinových struktur, který je invariantní s ohledem na posun a rotaci. Invariance...
Úplný záznam

Chcete být upozorněni, pokud se objeví nové záznamy odpovídající tomuto dotazu?
Přihlásit se k odběru RSS.
Digitální repozitář :: Hledej :: Nový záznam :: Personalizace :: Nápověda
Powered by Invenio v1.1.2
Spravuje admin.invenio@techlib.cz
Tato stránka je dostupná také v následujících jazycích:
Česky  English