|
|
Protizánětlivé účinky přírodních i syntetických triterpenoidních sloučenin.
Spáčilová, Pavla ; Hajdúch, Marián (vedoucí práce) ; Džubák, Petr (oponent)
Práce je zaměřena na in vitro testování biologických aktivit souvisejících se zánětlivými procesy, jako je inhibice produkce oxidu dusnatého a reaktivních forem kyslíku v aktivovaných buňkách. V experimentální části práce bylo testováno 65 triterpenoidních derivátů na inhibici produkce oxidu dusnatého buňkami B10R stimulovanými lipopolysacharidem. Bylo nalezeno 15 sloučenin s terapeutickým indexem vyšším než 4, včetně tří sloučenin s hodnotou IC50 nižší než 10 μmol/l. Inhibice produkce reaktivních forem kyslíku buňkami RAW 264.7 stimulovanými opsonizovaným zymosanem byla testována u 115 triterpenoidních sloučenin. U dvou derivátů byla hodnota IC50 nižší než 10 μmol/l. Žádná ze 115 testovaných sloučenin nezhášela NO·. Byly nalezeny čtyři sloučeniny, které mírně zhášely O2-·. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
|
|
Exprese a prognostický význam mikroRNA u pacientek s časným karcinomem prsu.
Sochor, Marek ; Tesařová, Petra (vedoucí práce) ; Slabý, Ondřej (oponent) ; Hajdúch, Marián (oponent)
Karcinom prsu je nejčastější zhoubné nádorové onemocnění žen, které je z hlediska prognózy velice heterogenní. Časný karcinom prsu má celkově vynikající prognózu s dlouhodobým přežitím přes 90%. V této skupině se však vyskytují pacientky s vysoce nepříznivým vývojem a rizikem budoucího návratu nemoci. Vzhledem k účinným možnostem protinádorové léčby, je hlavním úkolem správného léčebného rozhodování určení rizika relapsu zhoubného onemocnění. Ke stanovení prognózy máme k dispozici markery klinické (velikost nádoru, postižení uzlin) a patologické (grade, ER, PgR, HER2 a Ki-67), všechny vykazují nízkou individuální specificitu a senzitivitu. Molekulární testy založené na vícegenovém hodnocení DNA nebo RNA vykazují vyšší senzitivitu a specificitu, ale jejich vzájemná shoda je nízká. Jedním z hlavních směrů výzkumu karcinomu prsu je hledání dostatečně specifických a senzitivních prognostických biomarkerů. MikroRNA jsou malé, vysoce stabilní, nekódující RNA, které ovlivňují současně desítky mRNA a proteinů uvnitř buněk. V kancerogenezi mohou fungovat jako onkogeny nebo tumor supresorové geny a ovlivňují základní děje vzniku a udržení nádorového procesu. Jedním ze směrů výzkumu mikroRNA je jejich využití jako prognostické biomarkery. Bylo publikováno mnoho prací, které definovaly jejich využitelnost při...
|
|
|
Zpracování dat z vysokokapacitního DNA sekvenování pro studium variability genomu a transkriptomu.
Vojta, Petr ; Hajdúch, Marián (vedoucí práce) ; Budinská, Eva (oponent) ; Mokrejš, Martin (oponent)
Procesy analýzy dat z masivního paralelního sekvenování (MPS) jsou často náročné na výkon výpočetní infrastruktury a dobu počítání. Existuje tedy potřeba automatizace a paralelizace jednotlivých úloh na výkonných počítačových klastrech (HPC). V první kapitole představujeme nově vytvořenou platformu určenou pro resekvenační analýzu MPS dat-MOLDIMED a nový anotační nástroj, který je určen k nasazení na HPC. Druhá kapitola popisuje použití MPS v případě Diamond-Blackfanovy anémie (DBA), které je zapříčiněno mutacemi v genech ribozomálních proteinů (RP). Přes známou molekulární patologii, zhruba 25 % případů DBA zůstává neobjasněno na molekulární úrovni. U pacientky s neznámou příčinou DBA jsme provedli RP panelové sekvenování a popsali jsme novou nesynonymní mutacikódující RPS7 p.V134F. Mutace byla následně potvrzena i u dvou asymptomatických rodinných příslušníků, u kterých následně byla potvrzena slabá anémie. Dále jsme provedli komparativní transkriptomovou analýzu všech nositelů RPS7 mutace ve srovnání se zdravým kontrolním souborem a DBA pacientů se známou mutací v RPS19, kde byla sledována dysregulace signálních drah především v procesech translace, rRNA procesování, regulace buněčného cyklu a imunitního systému. Třetí kapitola představuje transkriptomovou studii transgenních odrůd ječmene s...
|
|
| |
|
| |
|
| |
|
|
Protizánětlivé účinky přírodních i syntetických triterpenoidních sloučenin.
Spáčilová, Pavla ; Hajdúch, Marián (vedoucí práce) ; Džubák, Petr (oponent)
Práce je zaměřena na in vitro testování biologických aktivit souvisejících se zánětlivými procesy, jako je inhibice produkce oxidu dusnatého a reaktivních forem kyslíku v aktivovaných buňkách. V experimentální části práce bylo testováno 65 triterpenoidních derivátů na inhibici produkce oxidu dusnatého buňkami B10R stimulovanými lipopolysacharidem. Bylo nalezeno 15 sloučenin s terapeutickým indexem vyšším než 4, včetně tří sloučenin s hodnotou IC50 nižší než 10 μmol/l. Inhibice produkce reaktivních forem kyslíku buňkami RAW 264.7 stimulovanými opsonizovaným zymosanem byla testována u 115 triterpenoidních sloučenin. U dvou derivátů byla hodnota IC50 nižší než 10 μmol/l. Žádná ze 115 testovaných sloučenin nezhášela NO·. Byly nalezeny čtyři sloučeniny, které mírně zhášely O2-·. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
|
| |
|
| |
|
| |
host ::
RSS.