|
|
Ab initio molecular dynamics with non-adiabatic and spin-orbit effects applied to time-dependent fluorescence
Pederzoli, Marek ; Pittner, Jiří (vedoucí práce) ; Mitric, Roland (oponent) ; Gonzáles, Leticia (oponent)
Ab initio molekulová dynamika s neadiabatickými a spin-orbitálními efekty aplikovaná na časově závislou fluorescenci Marek Pederzoli1,2 1Charles University in Prague, Faculty of Science, Department of Physical and Macromolecular Chemistry, Hlavova 8, 12840 Prague 2, Czech Republic 2J. Heyrovský Institute of Physical Chemistry, Czech Academy of Sciences, Dolejškova 3, 18223 Prague 8, Czech Republic Fluorescenční sondy jsou nepostradatelné pro mnoho experimentálních technik používa- ných v biochemii a mikrobiologii. Přesné simulace těchto molekul jsou z teoretického hlediska výzvou, protože mohou zahrnovat konické intersekce a mezisystémové přechody i interakce s prostředím. Tato práce je souborem publikací týkajících se vývoje, implementace a aplikace technik ab initio molekulové dynamiky s neadiabatickými a spin-orbitálními interakcemi, které jsou použitelné pro modelování fluorescenčních sond nejen v plynné fázi, ale také v komplexním prostředí biomembrán. Úvodní část se týká studia 9H-adeninu pomocí ab initio molekulové dynamiky s neadi- abatickou vazbou na TD-DFT úrovni a s použitím dvou single-referenčních metod CC2 a ADC(2). Hlavní část práce pak popisuje implementaci spin-orbitální vazby do dynamiky s využitím Tullyho...
|
|
|
Ab initio molecular dynamics with non-adiabatic and spin-orbit effects applied to time-dependent fluorescence
Pederzoli, Marek ; Pittner, Jiří (vedoucí práce) ; Mitric, Roland (oponent) ; Gonzáles, Leticia (oponent)
Ab initio molekulová dynamika s neadiabatickými a spin-orbitálními efekty aplikovaná na časově závislou fluorescenci Marek Pederzoli1,2 1Charles University in Prague, Faculty of Science, Department of Physical and Macromolecular Chemistry, Hlavova 8, 12840 Prague 2, Czech Republic 2J. Heyrovský Institute of Physical Chemistry, Czech Academy of Sciences, Dolejškova 3, 18223 Prague 8, Czech Republic Fluorescenční sondy jsou nepostradatelné pro mnoho experimentálních technik používa- ných v biochemii a mikrobiologii. Přesné simulace těchto molekul jsou z teoretického hlediska výzvou, protože mohou zahrnovat konické intersekce a mezisystémové přechody i interakce s prostředím. Tato práce je souborem publikací týkajících se vývoje, implementace a aplikace technik ab initio molekulové dynamiky s neadiabatickými a spin-orbitálními interakcemi, které jsou použitelné pro modelování fluorescenčních sond nejen v plynné fázi, ale také v komplexním prostředí biomembrán. Úvodní část se týká studia 9H-adeninu pomocí ab initio molekulové dynamiky s neadi- abatickou vazbou na TD-DFT úrovni a s použitím dvou single-referenčních metod CC2 a ADC(2). Hlavní část práce pak popisuje implementaci spin-orbitální vazby do dynamiky s využitím Tullyho...
|
host ::
RSS.