|
|
Electrochemical Reduction and Oxidation of Nucleic Acids Bases and their Analogues: a Brief Overview
Fojta, Miroslav ; Špaček, Jan ; Dudová, Zdenka ; Pivoňková, Hana ; Daňhel, Aleš ; Fojt, Lukáš ; Havran, Luděk
Nucleic acids are known as electroactive biomacromolecules containing electrochemically reducible or oxidizable constituents. Nucleobases cytosine, 5-methylcytosine, adenine and guanine can be reduced in aqueous media on mercury or silver amalgam electrodes. Oxidation of all natural nucleic acids bases (in addition to the above mentioned ones, also uracil and thymine) was demonstrated using various types of carbon electrodes. Some of synthetic nucleobases or nucleotide analogues (e g., 7-deazapurines, cytidine analogues used as epigenetic modulators, etc.) exhibit specific electrochemical properties that differ from those of the parent bases and can be utilized to determine the given substance in the presence of natural nucleic acids or their components.
|
|
|
Electrochemical Analysis of Sybr Green I and its Interaction with DNA
Dudová, Zdenka ; Pivoňková, Hana ; Havran, Luděk ; Fojta, Miroslav
There are used many methods such real-time PCR and electrophoresis in molecular biology and biochemistry which are based on utilization of a fluorescent dye Sybr Green I (SG) for selective detection of double stranded (ds) DNA and its quantification. SG is a planar molecule (see Fig. 1) that intercalates into the DNA double helix and simultaneously can bind into minor groove of dsDNA. In our work we focused on electrochemical behavior of SG on a pyrolytic graphite electrode (PGE) using square-wave voltammetry (SWV). The voltammetric method was used in measurements of SG interactions with DNA at the PGE.
|
|
|
Analysis of Denatured PCR Products Modified with 7-deazapurine Bases at Hanging Mercury Drop Electrode
Dudová, Zdenka ; Špaček, Jan ; Havran, Luděk ; Pivoňková, Hana ; Fojta, Miroslav
7-deazapunines are synthetic analogues of natural purine nucleobases which can pair with pyrimidines, retaining pairing complementarity of their parent purines. There is replaced N7 atom by CH group in 7-deazapurines so that DNA modified with them don't participate in Hoogsteen basepairing and don't form alternative structures. Here is a study of 7-deazapurines incorpotated into DNA measured at HMDE by CV and ACV. While 7-deazaadenine was reduced at the HMDE, giving rise to a similar irreversible cathodic peak as the natural adenine, 7-deazaguanine didn't yield any peak analogous to the peak G due to Guanine, in Agreement with a loss of corresponding redox in 7-deazaguanine.
|
|
|
Sebehodnocení na 1.stupni ZŠ se zaměřením na integrované žáky
Dudová, Zdeňka ; Tomková, Anna (vedoucí práce) ; Krčmářová, Tereza (oponent)
Diplomová práce je členěna do dvou hlavních částí. První teoretickou část tvoří vymezení pojmu sebehodnocení se zaměřením na jeho význam, formy a faktory provázející jeho zavádění do výuky. Dále zde nalezneme poznatky z odborné literatury, analyzující vztah hodnocení a sebehodnocení směrem k individualizaci. Druhá praktická část má charakter akčního výzkumu a jejím cílem je sledování průběhu zavádění sebehodnocení u konkrétního žáka se specifickou poruchou učení. Sledování probíhá ve dvou různých vzdělávacích prostředích a hledá možnosti sebehodnocení. Prakticky popisuje, jak naučit integrovaného žáka sebehodnotit. Celkově práce potvrzuje, že zkoumaný žák dokáže sebehodnotit svoji práci a popisuje v jakých krocích. Klíčová slova hodnocení, sebehodnocení, žák se speciálními vzdělávacími potřebami, integrovaný žák, popisný jazyk, kritérium hodnocení, indikátor kvality, formy sebehodnocení, akční výzkum
|
host ::
RSS.