|
|
Kvantifikace T1 pro preklinické MRI
Dvořáková, Lenka ; Macíček, Ondřej (oponent) ; Jiřík, Radovan (vedoucí práce)
Kvantifikace T1 mapy myokardu je důležité pro diagnostiku myokardické fibrózy. Kardiální magnetická rezonance malých zvířat je obtížná z důvodu vysoké srdeční a respirační frekvence. Pulsní sekvence navržené v této práci jsou typu IR FLASH a Intragate FLASH. Sekvence IR FLASH byla porovnána s referenční sekvencí RARE na statickém fantomu. Obě sekvence byly aplikovány během měření myokardu potkana. Pro kvantifikaci T1 byl vyvinut software v prostředí Matlab. Pomocí tohoto softwaru byly vyhodnoceny T1 mapy myokardu potkana.
|
|
|
Monitorování a návrh optimalizace provozu systému Cobas 8000 na OKB FN Brno
Dvořáková, Lenka ; Frančík, Vladimír (oponent) ; Sekora, Jiří (vedoucí práce)
Přístroj Cobas 8000 je modulární biochemický automatický analyzátor. Podle složení modulů umožňuje stanovovat výsledky klinické chemie (modul c 501 nebo c 702), imunochemickou analýzu (modul e 602) a pomocí ISE modulu koncentraci sodných, draselných a chloridových iontů. V biochemické laboratoři ve Fakultní nemocnici Brno je nainstalovaný přístroj složený z jedné jednotky ISE, dvou modulů c 702 a dvou modulů e 602. Bakalářská práce monitoruje chod přístroje Cobas 8000 a navrhuje jeho optimalizaci, která je testována v reálném provozu. Softwarové nástroje vytvořené v rámci této práce usnadňují kontrolu správného chodu přístroje a analýzu přístrojové časové odezvy. Časová odezva přístroje je doba mezi vložením vzorku do přístroje a odesláním výsledků. Pro potřeby laboratoře byla vytvořeny dva programy v prostředí Visual Basic. První program je určen pro analýzu rozsáhlého souboru dat přístrojové časové odezvy. Výsledky tohoto programu jsou důležitou součástí hodnocení laboratoře. Druhý program je určen pro základní každodenní statistiku časové odezvy statimových vzorků. Optimalizace přístroje je provedena pomocí programu vytvořeného v prostředí Matlab. Program simuluje pracovní tok přístroje. Pro optimalizaci je nejdůležitější rozložení metod na jednotlivé segmenty přístroje. Správné rozdělení zajišťuje rychlejší a plynulejší činnost a delší životnost jednotlivých součástí přístroje.
|
|
|
Monitorování populace CAR-T lymfocytů během léčby krevních malignit
Dvořáková, Lenka ; Souček, Ondřej (vedoucí práce) ; Řezáčová, Vladimíra (oponent)
Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd Autor Bc. Lenka Dvořáková Vedoucí RNDr. Ondřej Souček, Ph.D. Název diplomové práce Monitorování populace CAR-T lymfocytů během léčby krevních malignit Diplomová práce se zabývá terapií T lymfocytů s chimérickým antigenním receptorem (CAR) u léčby krevních malignit. Konkrétně se zaměřuje na monitorování populace CAR-T lymfocytů u pacientů v čase, po podání léčebného přípravku. Měření bylo prováděno ze vzorků plné krve měřením na průtokovém cytometru. Teoretická část je věnována hematologickým malignitám: jejich diagnostice a léčbě, dále CAR-T lymfocytům: historii, výrobě, klinickému využití, nežádoucím účinkům a stanovením. Experimentální část je potom věnována zpracování naměřených výsledků. Cílem diplomové práce bylo zpracovat odbornou rešerši o daném tématu a vyhodnotit výsledky sledování populace CAR-T lymfocytů v čase. Provedenou technikou se podařilo prokázat CAR-T lymfocyty v krvi u všech pacientů, průtoková cytometrie s využitím zkumavky od firmy Exbio a použitím protilátky antiFMC63 scFv od firmy Acro Biosystems se jeví jako vhodná metoda. Míra expanze CAR-T lymfocytů byla u jednotlivých pacientů individuální. U dvou pacientek byly...
|
|
|
Role sekvenace nové generace v diagnostice a prognóze X-vázaných lysosomálních střádavých onemocnění
Řeboun, Martin ; Dvořáková, Lenka (vedoucí práce) ; Fajkusová, Lenka (oponent) ; Krejčí, Jan (oponent)
Charakterizace molekulárně genetické podstaty monogenních onemocnění spočívá nejen v identifikaci patogenní varianty, ale i v popisu jejího vlivu na strukturu a stabilitu vznikající RNA. Kromě toho u X-vázaných onemocnění vstupuje u heterozygotních pacientek do hry X- inaktivace. V předkládané disertační práci jsme využili metody sekvenování nové generace ke studiu tří X-vázaných lysosomálních onemocnění (mukopolysacharidóza typ II, MPS II; Danonova choroba, DD; Fabryho choroba, FD). Využili jsme dva metodické postupy: 1) panelové sekvenování s použitím hybridizačních prób pro identifikaci malých a strukturních variant (rozsáhlé delece a duplikace) 2) amplikonové sekvenování pro vyšetření somatického mozaicismu a alelově specifické exprese. Panelové sekvenování umožnilo na molekulárně genetické úrovni potvrzení Danonovy choroby u dvou pacientů, u kterých byla identifikována duplikace dvou exonů a delece pěti exonů v genu LAMP2. Amplikonovým sekvenováním jsme analyzovali somatický mozaicismus v rodinách pacientů s Danonovou chorobou a mukopolysacharidózou typu II a identifikovali první případ somatického mozaicismu u pacienta s Danonovou chorobou. Metoda alelově specifické exprese rozšířila paletu metod používaných při vyšetření X- inaktivace a její přínos se projevil zejména při minimalizaci chybné...
|
|
|
Molekulárně genetická analýza u Niemann-Pickovy choroby typu C
Marešová, Ivona ; Dvořáková, Lenka (vedoucí práce) ; Hřebíček, Martin (oponent)
Niemann-Pickova choroba typu C je velice závažné onemocnění s autozomálně recesivním typem dědičnosti. Příčinou nemoci jsou patogenní mutace nacházející se v genech NPC1/NPC2. Tyto geny kódují lysozomální neenzymatické NPC1/NPC2 proteiny, které se podílejí na transportu lipidů. V důsledku deficitu těchto proteinů dochází k intracelulárnímu hromadění lipidů, především neesterifikovaného cholesterolu a glykolipidů. Kauzální terapie je v současnosti neuspokojivá, vyvíjejí se proto nové léčebné postupy. Některé z nich závisí na tom, zda se v buňkách pacientů vyskytuje alespoň zbytkové množství transkriptu genu NPC1. U vybraných pacientů, u kterých byla k dispozici kultura kožních fibroblastů, jsem charakterizovala vliv patogenních mutací na množství transkriptu. Výsledky ukázaly, že u všech patogenních mutací je množství transkriptu detekovatelné. Současně jsem charakterizovala strukturu promotoru genu NPC1. Sekvenační analýzou jsem v promotoru nalezla polymorfizmy rs8099071, rs28403610, rs2981422, rs1652354, rs1788774, rs1788772. Analyzovala jsem skladbu polymorfizmů u jednotlivých pacientů, výsledky svědční pro existenci šesti různých haplotypů. U nově diagnostikované pacientky jsem mutační analýzu nalezla pouze jednu patogenní mutaci p.I1061T (c.3182T>C) v genu NPC1. Z tohoto důvodu jsem pomocí...
|
|
|
Termální analýza interakcí epidermálních lipidů III
Dvořáková, Lenka ; Musilová, Marie (vedoucí práce) ; Doležal, Pavel (oponent)
Termální analýza interakcí epidermálních lipidů III Lenka Dvořáková, diplomová práce, červen 2008 Abstrakt Kůže je orgán chránící lidské tělo před nežádoucími vlivy okolního prostředí. Fyzikálně chemické vlastnosti, struktura a uspořádání epidermálních lipidů, především ve stratum corneum, hrají klíčovou roli v bariérové funkci kůže. V této vrstvě jsou hlavními lipidy ceramidy, cholesterol a volné mastné kyseliny. My jsme použili vzorky napodobující toto nejčastěji uváděné složení epidermálních lipidů, obsahovaly pseudo- ceramid, kyselinu olejovou, cholesterol a cholesterol sulfát. Jelikož vzorky s kyselinou olejovou mohou při vyšších teplotách ovlivňovat chování jednotlivých složek směsi, provedli jsme hodnocení i obsahově jednodušších vzorků, které se skládaly z cholesterolu a pseudo-ceramidu. Snažili jsme se směsi hydratovat v in vitro prostředí různými postupy. A sledovali jejich charakteristiky a interakce pomocí diferenciální skenovací kalorimetrie. Současně jsme se zabývali i hodnocením jednotlivých surovin a dvousložkových směsí. Pomocí těchto studií jsme ověřili a detailněji propracovali v literatuře ne zcela jednoznačně uváděné pracovní postupy.
|
|
| |
|
|
Kvalita doplňků stravy s obsahem šišáku bajkalského
Dvořáková, Lenka ; Martin, Jan (vedoucí práce) ; Tůmová, Lenka (oponent)
Název práce: Kvalita doplňků stravy s obsahem šišáku bajkalského Autor: Lenka Dvořáková Práce byla zaměřena na stanovení hlavních flavonoidů ze Scutellaria baicalensis a nejčastěji se vyskytujících flavonoidech v dalších drogách, jež byly součástí polykomponentních doplňků stravy analyzovaných v této práci. Ze zkoumaných preparátů byly vždy připraveny tři extrakty, které se lišily koncentrací použitého methanolu a teplotou při přípravě. Z výsledků vyplývá, že vyšší obsah sledovaných látek byl ve většině případů u extraktů připravených pomocí ultrazvuku za nižší teploty. Tyto extrakty byly připraveny z tvrdých tobolek - capsulae durae. Naopak u extraktu získaného z měkkých tobolek - capsulae moles, byly naměřené hodnoty vyšší u extraktu připraveného za pomoci lázně. Mezi firmami byly značné rozdíly v naměřených hodnotách a také informace uváděné na etiketě byly rozdílně obsáhlé.
|
|
| |
|
|
Význam proteinů tepelného šoku v diagnostice a prognostice těhotenských komplikací
Dvořáková, Lenka ; Hromadníková, Ilona (vedoucí práce) ; Růžičková, Šárka (oponent)
Proteiny tepelného šoku zvyšují svou genovou expresi po vystavení buňky, respektive organismu, určité formě stresu, kterou může být vysoká teplota, infekce, zánět, hypoxie, nedostatek živin nebo vody. Stresovou situací pro organismus jsou i těhotenské komplikace související s placentární insuficiencí - preeklampsie a intrauterinní růstová retardace, ale i další těhotenské komplikace jako fetální růstová retardace a gestační hypertenze. Proto jsem také ve své diplomové práci zjišťovala, zda má výskyt těhotenských komplikací (preeklampsie, fetální růstová retardace, gestační hypertenze) vliv na genovou expresi proteinů tepelného šoku. Detekovala jsem 5 hsp systémů, kterými byly Hsp27, Hsp60, Hsp70, Hsp90 a HspBP1. Detekci jsem prováděla na vzorcích placentární tkáně a plné periferní krve matky. K dispozici jsem měla vzorky jak od žen s fyziologickým průběhem těhotenství, tak od žen, u kterých se během gravidity vyvinula určitá komplikace (PE, FGR, GH). Ze vzorků jsem izolovala RNA. Detekce hsp exprese byla provedena pomocí RT-PCR v reálném čase s využitím komparativní Ct metody. Zjišťovala jsem změny genové exprese testovaného vzorku oproti vzorku referenčnímu. K posouzení rozdílu exprese hsp mezi fyziologickými graviditami a graviditami s vybranými těhotenskými komplikacemi jsem využila analýzy...
|
host ::
RSS.