|
|
Drop coating deposition Raman spectroscopy of liposomes with different compositions
Antalík, Andrej ; Kočišová, Eva (vedoucí práce) ; Holoubek, Aleš (oponent)
Metóda kvapkovo nanášaných povlakov je špeciálna technika Ramano- vej spektroskopie spočívajúca v nanesení malého množstva vzorky na hy- drofóbny povrch s následným odparením rozpúšt'adla. Po vyschnutí dochádza k sústredeniu materiálu v homogénnom krúžku na okraji kvapky. Použitie tejto techniky sa ukázalo ako vhodné na štúdium lipozómov pri nízkych koncentráciách. Jej využitím sme skúmali prejavy cholesterolu v spektrách prevažne fosfatidylcholínových lipozómov, a tiež jeho vplyv na tvorbu krúžkov. Vyššia koncentrácia cholesterolu nespôsobila výraznejšie zmeny štruktúry membrány, ako napríklad zmenu fázy, avšak nedochádzalo k vytvoreniu krúž- kov. V druhej časti bakalárskej práce sme sa zaoberali hl'adaním vhodnej alternatívy k doteraz používanému a už nedostupnému DCDR povrchu - doštičkám SpectRIM TM od firmy Tienta Sciences,Inc. Z testovaných povr- chov sa ako najvhodnejší na d'alšie použitie javí sklíčko fluoridu vápenatého (CaF2). Signál z ostatných povrchov bol príliš slabý, alebo boli v spektrách pozorované spektrálne pásy nepríslušiace lipidu.
|
|
|
Coupled clusters tailored by matrix product state wave functions
Antalík, Andrej ; Pittner, Jiří (vedoucí práce) ; Noga, Jozef (oponent) ; Soldán, Pavel (oponent)
Ústředním problémem teorie elektronové struktury je přesný výpočet korelačních energií, který může být poněkud komplikovaný, vzhledem k odlišnému původu statické a dynam- ické korelace. V této práci představuji soubor metod kombinujících efektivitu popisu dynamické korelace pomocí teorie spřažených klastrů (CC) s metodou renormalizační grupy matice hustoty, která je vhodná zejména pro popis silně korelovaných systémů. Spojení těchto přístupů je dosaženo pomocí externě korigované CC metody (tailored CC), která má tu výhodu, že nezvyšuje výpočetní náročnost nad rámec těchto dvou přís- tupů. Metoda byla úspěšně otestována na malých molekulách a následně implementována ve výpočetně efektivnější formě založené na lokálních párových přirozených orbitalech, umožňující výpočet molekul s tisíci bázových funkcí. Pro vyhodnocení přesnosti jsme vykonali řadu testovacích výpočtů, počínaje malými, leč náročnými systémy jakými jsou molekula dusíku nebo diradikál tetramethylenethanu, až po větší molekuly jako oxo- Mn(salen) či model Fe(II)-porfyrinu. 1
|
|
|
Density matrix renormalization group calculations and entanglement optimization in quantum chemistry
Antalík, Andrej ; Pittner, Jiří (vedoucí práce) ; Chalupský, Jaromír (oponent)
Renormalizační grupa matice hustoty (DMRG) je numerická metoda s původem ve fyzice pevné fáze. Od svého uvedení na poli kvantové chemie byla úspěšně aplikována na řadu netriviálních problémů, přičemž se ukázala zvláště účinná pro systémy silně multireferenčního charakteru. Jelikož není invariantní vůči změně pořadí orbitalů, implementovali jsme automatickou proceduru využívající analýzy entanglementu a Fiedlerovy metody. Dále jsme navrhli techniku výběru aktivního prostoru založenou na zkoumání jednoor- bitálních entropií. Vycházeli jsme ze studie Berarda a spol., ve které zkou- mali excitované stavy klastrů TiO2 metodami EOM-CC. Spočetli jsme čtyři nejnižší singletní excitované stavy pro monomer, dimer a trimer metodou DMRG. Pro monomer jsme dosáhli dobré shody pro dva stavy, ukázalo se však, že pro přesnější výsledky bude nezbytné zahrnout dynamickou korelaci. V případě dimeru jsme dosáhli shody s výsledky EOM-CCSDT výpočtů a pro trimer je potřeba dodatečných výpočtů. 1
|
|
|
Drop coating deposition Raman spectroscopy of liposomes with different compositions
Antalík, Andrej ; Kočišová, Eva (vedoucí práce) ; Holoubek, Aleš (oponent)
Metóda kvapkovo nanášaných povlakov je špeciálna technika Ramano- vej spektroskopie spočívajúca v nanesení malého množstva vzorky na hy- drofóbny povrch s následným odparením rozpúšt'adla. Po vyschnutí dochádza k sústredeniu materiálu v homogénnom krúžku na okraji kvapky. Použitie tejto techniky sa ukázalo ako vhodné na štúdium lipozómov pri nízkych koncentráciách. Jej využitím sme skúmali prejavy cholesterolu v spektrách prevažne fosfatidylcholínových lipozómov, a tiež jeho vplyv na tvorbu krúžkov. Vyššia koncentrácia cholesterolu nespôsobila výraznejšie zmeny štruktúry membrány, ako napríklad zmenu fázy, avšak nedochádzalo k vytvoreniu krúž- kov. V druhej časti bakalárskej práce sme sa zaoberali hl'adaním vhodnej alternatívy k doteraz používanému a už nedostupnému DCDR povrchu - doštičkám SpectRIM TM od firmy Tienta Sciences,Inc. Z testovaných povr- chov sa ako najvhodnejší na d'alšie použitie javí sklíčko fluoridu vápenatého (CaF2). Signál z ostatných povrchov bol príliš slabý, alebo boli v spektrách pozorované spektrálne pásy nepríslušiace lipidu.
|
host ::
RSS.