|
|
Convolutional Networks for Lip Reading
Kadleček, Josef ; Kišš, Martin (referee) ; Hradiš, Michal (advisor)
This thesis deals with current methods for automatic speech recognition and lip reading via neural networks. Furthermore it deals with similarities in the architectures of neural networks for audio and visual data and available datasets in the field of audiovisual automatic speech recognition. The main contribution of this thesis is set of experiments comparing different changes in neural network architecture and its impact on results. The thesis includes an implementation of a system for automatic speech recognition from audio (CER: 12.6 %) and visual (CER: 57,7 %) data. The architectures of both systems are based on features extraction via convolutional networks followed by recurrent layers LSTM, another layer of convolutions and loss function CTC.
|
|
|
Computational Workflow for the Prediction and Design of Stable Proteins
Kadleček, Josef ; Martínek, Tomáš (referee) ; Musil, Miloš (advisor)
Tato práce se soustředí na rozšíření výpočetního nástroje pro predikci mutací proteinů za účelem zvýšení jejich stability. Stabilizace proteinů je nezbytnou součástí návrhu léčiv, a jelikož experimentální vyhodnocení přínosu jednotlivých mutací na stabilitu proteinu je nákladné a zdlouhavé, byl vyvinut nástroj FireProt. FireProt využívá kombinaci evolučních a energetických přístupů pro identifikaci potencionálně stabilizujících mutací. Tato práce rozšiřuje nástroj FireProt o možnost zadat vlastní mutace k analýze, integruje predikční nástroj FireProt ASR a dává možnost uživateli vybrat z několika strategií pro detekci stabilizujících mutací. Tato práce dále rozšiřuje nástroj FireProt o další informace k jednotlivým residuím (jako je například relativní B-faktor), umožňuje využít homologní modelování k vytvoření struktury proteinu na základě jeho sekvence, a v neposlední řadě představuje nový přístup k návrhu vícebodových mutantů.
|
|
|
Computational Workflow for the Prediction and Design of Stable Proteins
Kadleček, Josef ; Martínek, Tomáš (referee) ; Musil, Miloš (advisor)
Tato práce se soustředí na rozšíření výpočetního nástroje pro predikci mutací proteinů za účelem zvýšení jejich stability. Stabilizace proteinů je nezbytnou součástí návrhu léčiv, a jelikož experimentální vyhodnocení přínosu jednotlivých mutací na stabilitu proteinu je nákladné a zdlouhavé, byl vyvinut nástroj FireProt. FireProt využívá kombinaci evolučních a energetických přístupů pro identifikaci potencionálně stabilizujících mutací. Tato práce rozšiřuje nástroj FireProt o možnost zadat vlastní mutace k analýze, integruje predikční nástroj FireProt ASR a dává možnost uživateli vybrat z několika strategií pro detekci stabilizujících mutací. Tato práce dále rozšiřuje nástroj FireProt o další informace k jednotlivým residuím (jako je například relativní B-faktor), umožňuje využít homologní modelování k vytvoření struktury proteinu na základě jeho sekvence, a v neposlední řadě představuje nový přístup k návrhu vícebodových mutantů.
|
|
|
Convolutional Networks for Lip Reading
Kadleček, Josef ; Kišš, Martin (referee) ; Hradiš, Michal (advisor)
This thesis deals with current methods for automatic speech recognition and lip reading via neural networks. Furthermore it deals with similarities in the architectures of neural networks for audio and visual data and available datasets in the field of audiovisual automatic speech recognition. The main contribution of this thesis is set of experiments comparing different changes in neural network architecture and its impact on results. The thesis includes an implementation of a system for automatic speech recognition from audio (CER: 12.6 %) and visual (CER: 57,7 %) data. The architectures of both systems are based on features extraction via convolutional networks followed by recurrent layers LSTM, another layer of convolutions and loss function CTC.
|
guest ::
RSS feed.