Original title: Úloha vápníku a proteinu 14-3-3 v regulaci lidské ubikvitin ligasy Nedd4-2
Translated title: The role of calcium and 14-3-3 in the regulation of human ubiquitin ligase Nedd4-2
Authors: Janošev, Maša ; Obšilová, Veronika (advisor) ; Rozbeský, Daniel (referee) ; Pavlíček, Jiří (referee)
Document type: Doctoral theses
Year: 2026
Language: eng
Abstract: Nedd4-2 (neuronal precursor cell-exprimed developmentally down-regulated 4-like) ubikvitin ligáza je členem podrodiny Nedd4 HECT E3. Je všudypřítomně exprimována a reguluje řadu cílů, primárně integrální membránové proteiny, čímž moduluje různé signální dráhy a přispívá k rozvoji patologických stavů (např. hypertenze, onemocnění ledvin, cystická fibróza, epilepsie a kardiomyopatie). Nedd4-2 podléhá regulaci prostřednictvím celé škály mechanismů; tato práce se zaměřuje na čtyři klíčové režimy: 1) autoinhibici zprostředkovanou intramolekulární vazbou; 2) vápníkem závislou aktivaci; 3) interakce s membránou; a 4) inhibici závislou na fosforylaci zprostředkovanou homodimerem 14-3-3η, rigidním scaffoldovým proteinem. Experimentální práce kombinovala funkční testy (vazba na lipozomy a ubikvitinační eseje), biofyzikální techniky (diferenciální skenovací fluorimetrii, spektroskopii cirkulárního dichroismu, víceúhlový dynamický rozptyl světla, a analytickou ultracentrifugaci) a strukturní charakterizaci (kryoelektronovou mikroskopii, maloúhlový rozptyl rentgenového záření, a vodíko-deuteriovou výměnu ve spojení s hmotnostní spektrometrií). Výsledky poskytují vhled do regulačních mechanismů Nedd4-2 a mohou být aplikovány při vývoji farmakologických strategií zaměřených na onemocnění spojená s Nedd4-2.
Keywords: 14-3-3 family; 14-3-3η isoform; autoinhibition; biochemistry; calcium ions; cryo-electron microscopy; fluorescent labelling; HECT family; hydrogen-deuterium exchange coupled to mass spectrometry; hydrophobicity analysis; liposome preparation; liposome-binding assays; Nedd4 subfamily; Nedd4-2 ubiquitin ligase; phosphorylation-dependent binding; protein purification; protein-membrane interactions; small-angle X-ray scattering; structural biology; ubiquitination assays; ubiquitination cascade; analýza hydrofobity; autoinhibice; biochemie; fluorescenční značení; fosforylací řízená interakce; interakce protein-membrána; izoforma 14-3-3η; kryoelektronová mikroskopie; maloúhlový rozptyl rentgenového záření; podrodina Nedd4; purifikace proteinů; příprava liposomů; rodina 14-3-3; rodina HECT; strukturní biologie; testy vazby na liposomy; ubikvitin ligáza Nedd4-2; ubikvitinační eseji; ubikvitinační kaskáda; vodíko-deuteriovou výměnu ve spojení s hmotnostní spektrometrií; vápenaté ionty

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/209661

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-780138


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Doctoral theses