Original title: Detekce genů a drah u C. elegans jako modelového organismu pro kardiovaskulární nemoci
Translated title: Detection of genes and pathways in C. elegans as a model organism for cardiovascular diseases
Authors: Janáčková, Alena ; Schwarzerová, Jana (referee) ; Provazník, Valentýna (advisor)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2026
Language: eng
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract: [eng] [cze]
Kardiovaskulární onemocnění jsou celosvětově nejčastější příčinou úmrtí, a hlubší porozumění molekulárním procesům, které za nimi stojí, je klíčovým krokem pro zlepšení léčebných postupů. Tato práce cílí na identifikování ortologních genů u C. elegans spojovaných s vybranými kardiovaskulárními onemocněními, a nalezení konzervovaných drah mezi člověkem a tímto modelovým organismem. Z genů, jejichž exprimace se liší u nemocných a kontrolních vzorků, byly vytvořeny PPI sítě. Analýzou těchto sítí byly nalezeny centrální a dobře propojené uzly, které byly identifikovány jako hub geny a klíčové regulátory. Tyto geny byly použity jako základ při tvorbě ortologní PPI sítě u C. elegans. Dohromady bylo u C. elegans nalezeno 176 ortologních genů spojovaných s kardiovaskulárními nemocemi, z toho 7 hub genů; pozoruhodně 3 z nich odpovídají lidským ortologům, které byly rovněž označeny jako hub geny. Tyto výsledky odhalují konzervované dráhy mezi člověkem a C. elegans, a zároveň podporují význam tohoto modelového organismu pro výzkum molekulárních mechanismů spojovaných s kardiovaskulárními onemocněními. Cardiovascular disease is the leading cause of death worldwide, and a deeper understanding of the molecular processes underlying it is crucial to improve treatment strategies. This thesis aims to identify CVD-related orthologous genes in C. elegans and to explore conserved pathways shared between humans and this model organism. PPI networks were constructed from differentially expressed genes in diseased samples and healthy controls. PPI network analysis was used to identify central, well-connected nodes as hubs and key regulators. These genes then served as a basis for the construction of an orthologous network in C. elegans. A total of 176 CVD-related orthologous genes were identified in C. elegans, of which 7 were designated as hub genes; notably, 3 of these hub genes corresponded to human orthologs that were also identified as hub genes in their respective network. The results reveal conserved network components between humans and C. elegans and support the relevance of this model organism for investigating CVD-associated molecular mechanisms.
Keywords: C. elegans; hub geny; Kardiovaskulární onemocnění; klíčové regulační geny; konzervované dráhy; PPI sítě; C. elegans; Cardiovascular disease; conserved pathways; hub genes; key regulatory genes; PPI network

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/258392

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-775622


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses