Original title:
Fylogeneze východoafrických ještěrek rodu Latastia
Translated title:
Phylogeny of the eastern African lacertid genus Latastia
Authors:
Hlaváč, Denis ; Šmíd, Jiří (advisor) ; Veselý, Milan (referee) Document type: Master’s theses
Year:
2025
Language:
slo Abstract:
[eng][cze] The East African genus Latastia is a taxon within the family Lacertidae, with a distribution covering a broad region of sub-Saharan Africa. This genus is relatively diverse and currently comprises ten recognized species. However, the morphology of these species is quite variable and often reflects the environmental conditions in which they occur. To date, no comprehensive molecular-level assessment of the genus's taxonomy has been conducted, leaving its classification unresolved. To address these outstanding questions, we reconstructed the first phylogeny of the genus Latastia, covering seven recognized species and five subspecies, with a total of 84 sequenced individuals. Phylogenetic trees were constructed from two datasets combining five mitochondrial (12S, 16S, COI, ND4, cytb) and four nuclear (c-mos, RAG1, RAG2, ACM4) markers, using Maximum Likelihood (ML) and Bayesian Inference (BI) analyses. These results were further supported by genealogical analyses of haplotype networks based on the four nuclear markers. The molecular results were subsequently visualized on maps illustrating individual phylogenetic lineages along with their inferred distribution ranges, including unsampled taxa. The molecular analyses support the expected hypothesis that phylogenetic conclusions differ from the currently...Východoafrický rod Latastia je taxónom z čeľade Lacertidae, ktorého areál výskytu zahŕňa rozsiahlu oblasť subsaharskej Afriky. Tento rod je pomerne diverzifikovaný a tvorí desať recentne rozpoznávaných druhov. Morfológia týchto druhov je však pomerne variabilná a odpovedá často podmienkam prostredia, v ktorých žijú. Doposiaľ sa však na molekulárnej úrovni nikto nezaoberal celkovou taxonómiou tohto rodu a tá zostáva preto nevyriešená. Na podklade týchto nezodpovedaných otázok bola zrekonštruovaná prvá fylogenetická rekonštrukcia rodu Latastia, ktorá pokrýva sedem rozpoznávaných druhov a päť poddruhov v celkovom počte 84 sekvenovaných jedincov. Zo získaných molekulárnych dát boli zostrojené fylogenetické stromy z dvoch datasetov, kombinujúce päť mitochondriálnych (12S, 16S, COI, ND4, cytb) a štyri nukleárne (c-mos, RAG1, RAG2, ACM4) markery, a to pomocou analýz maximálnej vierohodnosti (ML) a Bayesovskej analýzy (BI). Tieto výsledky boli doplnené genealogickými analýzami haplotypových sietí štyroch použitých nukleárnych markrov (c- mos, RAG1, RAG2, ACM4). Výsledky molekulárnych analýz boli následne vizualizované prostredníctvom máp fylogenetických línií spolu s ich predpokladanými areálmi výskytu vrátane máp nesekvenovaných taxónov. Výsledky molekulárnych analýz podporujú očakávaný predpoklad, ktorý...
Keywords:
distribution ranges; genealogy; hybridization; ILS; Latastia; phylogeny; areály výskytu; fylogenéza; genealógia; hybridizácia; ILS; Latastia
Institution: Charles University Faculties (theses)
(web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository. Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/203934