Original title: Systémy editace mitochondriální RNA - diverzita a evoluce
Translated title: Mitochondrial RNA Editing Systems - diversity and evolution
Authors: Biroščák, Martin ; Pánek, Tomáš (advisor) ; Jurčenko, Vjačeslav (referee)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2025
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
Mitochondrial RNA editing alters RNA sequences relative to their DNA templates. The process affects rRNA, tRNA, and especially mRNA across diverse eukaryotic lineages through nucleotide insertions, deletions, and C→U, U→C, A→I substitutions. This thesis reflects four decades of research and describes how methodological advances progressively revealed the breadth and mechanistic diversity of editing systems; presents mechanisms including guide-RNA-directed uridine editing, protein-mediated base conversions, polymerase-driven insertions, and hybrid systems; evaluates functions of this system ranging from key error corrections to developmental regulation and stress response; and maps occurrences of this phenomenon across the phylogenetic tree and describes evolutionary trends. Keywords RNA editing, evolution, mitochondrion, eukaryotes 1 Mitochondriální editace RNA mění RNA sekvence vůči jejich zdrojovým DNA. Tento proces ovlivňuje rRNA, tRNA a zejména mRNA napříč různorodými eukaryotickými liniemi prostřed- nictvím nukleotidových inzercí, delecí a C→U, U→C, A→I substitucí. Tato práce odráží čtyři desetiletí výzkumu a popisuje, jak metodologické pokroky postupně odhalily šíři a mechanistickou rozmanitost editačních systémů; představuje mechanismy včetně guide-RNA řízené uridinové ed- itace, proteiny zprostředkovaných konverzí bází, polymerázou řízených inzercí a hybridních sys- témů; hodnotí funkce tohoto systému sahající od klíčových oprav chyb až po vývojovou regulaci a reakci na stres a prostředí; a v neposlední řadě mapuje výskyty tohoto jevu napříč fylogenetickým stromem a popisuje evoluční trendy. Klíčová slova RNA editing, evoluce, mitochondrie, eukaryota 1
Keywords: eukaryotes; evolution; mitochondrion; RNA editing; eukaryota; evoluce; mitochondrie; RNA editing

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/203790

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-690076


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses