Original title: Interakce PI(4,5)P2-RNA-Protein při Fázové Separaci Transkripce RNA Pol II
Translated title: PI(4,5)P2-RNA-Protein Interactions in the Phase Separation of RNA Pol II Transcription
Authors: Antiga, Ludovica ; Hozák, Pavel (advisor) ; Vassetzky, Yegor S. (referee) ; Malínský, Jan (referee)
Document type: Doctoral theses
Year: 2025
Language: eng
Abstract: (Česky) Fosfoinositidy, podskupina fosfolipidů obsahujících inositol a mastné kyseliny, jsou homogenně přítomny v eukaryotických buňkách. Inositol ve fosfoinositidech může podléhat reverzibilní fosforylaci a vytvářet izoformy s různými buněčnými funkcemi. Tyto amfifilní molekuly hrají klíčovou roli v buněčné signalizaci, transportu vezikul, organizaci cytoskeletu a jaderné architektuře. Zejména fosfatidylinositol 4,5-bisfosfát (PI(4,5)P2) se ukázal jako klíčový regulátor genové exprese tím, že moduluje prostorovou a funkční organizaci jaderných kompartmentů. V jádře vytváří PIP2odlišné, fázově oddělené struktury bohaté na PI(4,5)P2, nazývané jaderné lipidové ostrůvky (NLI). Úzké spojení aktivní RNA polymerázy II s těmito strukturami podtrhuje klíčovou roli tohoto lipidu v regulaci jaderné architektury a genové exprese. Tato dizertační práce se zabývá souhrou PI(4,5)P2, RNA a proteinových efektorů, které společně regulují transkripci RNA polymerázy II prostřednictvím fázové separace kapalina-kapalina (LLPS). Pomocí kvantitativní hmotnostní spektrometrie, mikroskopie a biochemických testů jsme prokázali, že PIP2přednostně váže RNA bohatou na AU nukleotidy a interaguje s klíčovými jadernými proteiny, včetně proteinů rodiny BET a podjednotky MED1 Mediátorového komplexu. Ukázalo se, že tyto interakce...
Keywords: nuclear; nuclear processes; Phosphoinositides; Fosfoinositidy; jaderné procesy; jádro

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/203322

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-688783


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Doctoral theses