Original title: In-silico modelování signální dráhy v Arabidopsis thaliana
Translated title: In-silico signaling pathway modeling in Arabidopsis thaliana
Authors: Havlíčková, Sabina ; Provazník, Valentýna (referee) ; Schwarzerová, Jana (advisor)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2025
Language: eng
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract: [eng] [cze]
Tato bakalářská práce se zabývá studiem mechanismů rostlinných signálních drah se zaměřením na jejich roli v reakcích na abiotický stres a strategie přežití v nepříznivých podmínkách. Kombinuje teoretické poznatky s praktickými aplikacemi, včetně in-silico modelování signálních drah kyseliny abscisové (ABA) pomocí nástrojů AEON a GINsim. Práce zdůrazňuje význam výpočetních přístupů pro pochopení dynamiky vybraných drah a srovnává jednotlivé modelovací metody. Za využití dat z databáze KEGG a odborné literatury poskytuje text základ pro analýzu booleovských vztahů mezi proměnnými a nabízí možnosti dalšího výzkumu v oblasti rostlinné biologie a počítačového modelování. This bachelor's thesis deals with the study of plant signaling pathway mechanisms, with an emphasis on their role in responses to abiotic stress and survival strategies under adverse conditions. It combines theoretical knowledge with practical applications, including in-silico modeling of abscisic acid (ABA) signaling pathways using the AEON and GINsim tools. The thesis highlights the importance of computational approaches for understanding the dynamics of selected pathways and compares various modeling techniques. Utilizing data from the KEGG database and scientific literature, the text lays the groundwork for Boolean relationship analysis between variables and offers opportunities for further research in plant biology and computational modeling.
Keywords: Boolean analýza; In-silico modelování; Kyselina abscisová; Signální dráhy; Výpočetní biologie rostlin; Abscisic acid; Boolean analysis; In-silico modeling; Plant computational biology; Signaling pathways

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/253014

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-682226


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses