Original title: Zavedení CRISPR metody u modelového organizmu huseníčku rolního (Arabidopsis thaliana)
Authors: Šamaj, Matej
Document type: Bachelor's theses
Year: 2021
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
CRISPR/Cas systémy představují důležitý mechanismus molekulárních nůžek, kterým se prokaryotické organizmy mohou bránit vůči virovým patogenům. Vzhledem na jeho schopnost velmi přesného zacílení na vybraná místa v genomu se tento mechanismus velmi rychle prakticky uplatnil při genové editaci a mutacích u různých druhů organizmů včetně živočichů a rostlin. Záměrem této bakalářské práce bylo navrhnout a připravit CRISPR/Cas9 konstrukty na vyřazení genů CYP98A3 a PDS1 pomocí dvou typů klonovaní. Tyto konstrukty byly zaklonovány do vhodných vektorů a přeneseny do bakterií Escherichia coli a Agrobacterium tumefaciens. Transgenní rostliny Arabidopsis thaliana byly připraveny pomocí stabilní transformace Agrobacteriem a poté úspěšně vyselektovány na mediích obsahujících herbicid fosfinotricin. CRISPR/Cas systems represent an important mechanism of molecular scissors, by which bacteria can defend themselves against viral pathogens. This mechanism, due to its very precise targeting of selected sites in the genome, was very quickly practically applied in gene editing and mutations in various species of organisms, including animals and plants. The aim of this bachelor thesis was to design and prepare constructs for CRISPR/Cas9 to knockout CYP98A3 and PDS1 genes using two types of cloning. These constructs were cloned into appropriate vectors and transfected into Escherichia coli and Agrobacterium tumefaciens. Transgenic plants of Arabidopsis thaliana were prepared by stable Agrobacterium transformation, and then successfully selected on media containing the herbicide phosphinothricin.
Keywords: Arabidopsis thaliana; CRISPR/Cas9; editace genů; Gateway; gene editing; molecular cloning; molekulární klonování

Institution: Mendel University in Brno (web)
Document availability information: Available in the digital repository of Mendel University.
Original record: https://is.mendelu.cz/zp/index.pl?podrobnosti=103309

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-646761


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Mendel University in Brno
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses