Original title:
Studium polymorfizmu DNA konopí
Authors:
Balgová, Barbora Document type: Bachelor's theses
Year:
2016
Language:
cze Abstract:
[cze][eng] Tato práce je zaměřena na studium genetické variability mezi jednotlivými vzorky kolekce konopí. Analyzováno bylo celkem 22 vybraných vzorků konopí pomocí 24 mikrosatelitních markerů založených na PCR. Bylo nalezeno celkem 105 alel jejichž velikost se pohybovala od 100 do 320bp. Současně byl detekován jeden uniformní marker (CAN1690B), který není vhodný pro identifikaci vzorků konopí. Index diverzity (DI), polymorfní informační obsah (PIC) a index pravděpodobnosti (PI) byly vypočteny pro každý z mikrosatelitů. Na základě statistického vyhodnocení byl sestaven dendrogram podobnosti. Vzorky technického konopí a Cannabis sativa se podařilo oddělit od ostatních genotypů. Výsledky ukazují, že mikrosatelitní markery jsou užitečné pro detekci genetické rozmanitosti u konopí.This work is focused on the study of genetic variability between Cannabis samples. 22 genotypes of hemp were analyzed with 24 microsatellite markers based on PCR. We found 105 alleles whose size ranged from 100 to 320bp. Uniform marker was detected (CAN1690B) and this marker was not suitable for identification genotypes of Cannabis. The diversity index (DI), the polymorphic information content (PIC) and the probability of identity (PI) were calculated for every microsatellite marker. Dendrogram of similarity was constructed based on statistical evaluation. The samples of industrial hemp varieties and Cannabis sativa were separated from other genotypes. Results showed usefulness of microsatellite markers for detection of genetic diversity in Cannabis.
Keywords:
cannabis sativa L.; genetická variabilita; mikrosatelitní markery; PCR