Original title:
Detekce cizích objektů v rentgenových snímcích hrudníku s využitím metod strojového učení
Translated title:
Detection of foreign objects in X-ray chest images using machine learning methods
Authors:
Matoušková, Barbora ; Kolář, Radim (referee) ; Chmelík, Jiří (advisor) Document type: Master’s theses
Year:
2021
Language:
cze Publisher:
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií Abstract:
[cze][eng]
Cizí objekty v RTG snímcích hrudníku způsobují komplikace během automatického zpracování snímku. Abychom zabránily chybám, které vznikají právě kvůli těmto cizím objektům, je třeba je nejprve automaticky vyhledat a z následné analýzy je vynechat. Jedná se především o knoflíky, šperky, implantáty, dráty či trubičky. Zároveň nalezení pacemakerů a jiných voperovaných zařízení může pomoct při automatickém zpracování. Cílem této práce bylo navrhnout metodu pro detekci cizích objektů v RTG snímcích hrudníku. Pro tento úkol byla zvolena metoda Faster R-CNN s předtrénovanou sítí ResNet50 pro extrakci příznaků, která byla natrénována na 4 000 snímcích a následně otestována na 1 000 snímcích z veřejně dostupné databáze. Po nalezení optimálních učících parametrů se podařilo natrénovat síť, která dosahuje 75% přesnosti, 77% senzitivity a 76% F1 skóre. Určitá část chyby je ovšem tvořena nejednotnými anotacemi objektů v datech, kdy ne všechny anotované cizí objekty se nachází v oblasti plic, jak je udáno v popisu.
Foreign objects in Chest X-ray (CXR) cause complications during automatic image processing. To prevent errors caused by these foreign objects, it is necessary to automatically find them and ommit them in the analysis. These are mainly buttons, jewellery, implants, wires and tubes. At the same time, finding pacemakers and other placed devices can help with automatic processing. The aim of this work was to design a method for the detection of foreign objects in CXR. For this task, Faster R-CNN method with a pre-trained ResNet50 network for feature extraction was chosen which was trained on 4 000 images and lately tested on 1 000 images from a publicly available database. After finding the optimal learning parameters, it was managed to train the network, which achieves 75% precision, 77% recall and 76% F1 score. However, a certain part of the error is formed by non-uniform annotations of objects in the data because not all annotated foreign objects are located in the lung area, as stated in the description.
Keywords:
deep learning; Faster R-CNN; lungs; machine learning; object detection in images; RPN; X-ray; detekce objektů v obrazech; Faster R-CNN; hluboké učení; plíce; RPN; RTG; strojové učení
Institution: Brno University of Technology
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library. Original record: http://hdl.handle.net/11012/197012