Original title:
Isolace, identifikace a charakterizace extremofilů schopných produkce PHA
Translated title:
Isolation, identification and characterization of extremophiles capable of PHA production
Authors:
Vlasáková, Terézia ; Turková, Kristýna (referee) ; Obruča, Stanislav (advisor) Document type: Master’s theses
Year:
2018
Language:
cze Publisher:
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická Abstract:
[cze][eng]
Predložená diplomová práca sa zameriava na izoláciu a identifikáciu termofilných mikroorganizmov schopných produkcie polyhydroxyalkanoátov (PHA) vo vzorke aktivovaného kalu z čističky odpadových vôd. Z aktivovaného kalu bolo pomocou kultivačných techník a metód molekulárnej biológie vyizolovaných 6 vzoriek, ktoré boli na základe nukleotidových sekvencií génu 16S rRNA bližšie identifikované a zaradené k bakteriálnemu rodu Anoxybacillus. Tieto vzorky obsahovali gén phaC kódujúci PHA syntázu a poskytovali pozitívnu odozvu na detekciu intracelulárnych lipidických štruktúr farbením kolónií Nílskou červeňou. Produkcia PHA s vybranými izolátmi však nebola úspešná. Dôvodom mohlo byť nevyhovujúce produkčné médium či nastavené podmienky produkcie. Pozitívny fenotypový výsledok pri farbení Nílskou červeňou bol zrejme spôsobený produkciou veľkého množstva lipidu poskytujúceho podobnú fluorescenciu ako granule PHA.
This diploma thesis is focused on isolation and identification of thermophilic microorganisms capable of production of polyhydroxyalkanoates (PHA) in the sample of activated sludge from wastewater treatment. 6 culture samples were isolated from activated sludge by means of cultivation technics and methods of molecular biology. They were closer specified by comparing nucleotide sequences of 16S-rRNA gene and assigned to bacterial genus Anoxybacillus. The production of PHA by this genus was not reported in literature so far. Samples were confirmed to contain phaC gene that codes the enzyme PHA-synthase and they also gave a positive response to staining colonies with Nile red, what refers to presence of intracellular lipidic structures. However, the PHA production by isolates was not successful. The reason should be an inappropriate production medium or conditions. The positive phenotype result of Nile red dyeing was probably achieved by production of huge amount of lipids by bacterial cells that provides similar fluorescence than PHA granules.
Keywords:
activated sludge; Anoxybacillus; extremophile microorganisms; PHA-synthase; Polyhydroxyalkanoate (PHA); thermophiles; aktivovaný kal; Anoxybacillus; extrémofilné mikroorganizmy; PHA syntáza; Polyhydroxyalkanoáty (PHA); termofily
Institution: Brno University of Technology
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library. Original record: http://hdl.handle.net/11012/80706