Original title:
Genetická diverzita afrických plchů rodu \kur{Graphiurus} (Rodentia, Gliridae)
Authors:
LIŠKOVÁ, Edita Document type: Bachelor's theses
Year:
2021
Language:
cze Abstract:
[cze][eng] Afričtí plši rodu Graphiurus jsou endemickým rodem pro subsaharskou Afriky. Obývají široké spektrum habitatů od tropických deštných pralesů až po aridní oblasti. Taxonomie rodu Graphiurus ještě zdaleka není definitivní. Doposud je známých 15 druhů. V mé bakalářské práci jsem osekvenovala mitochondriální cytochrom b ze získaného materiálu, většinou z východní a západní Afriky. Vymezení druhů s maximální pravděpodobností a Markovovým řetězcem Monte Carlo odhalily přítomnost 22 molekulárních taxonomických jednotek (MOTU). Fylogenetická analýza založená na bayesiánském závěru statisticky nevyřešila všechny vztahy mezi identifikovanými MOTU. Budoucí studie týkající se taxonomie a fylogenetických vztahů druhů rodu Graphiurus by proto měly zahrnovat více genetických údajů.The African dormice from genus Graphiurus are endemic in sub-Saharan Africa and could be found in a variety of habitats from tropical lowland rainforests to arid savanna woodlands. The taxonomy and systematics of this genus are still unclear because no genetic study has included all known taxa. There are 15 species currently recognized. For my thesis, I sequenced mitochondrial cytochrome b from the most comprehensive up-to-date material, mostly from eastern and western Africa. Species delimitation under maximum likelihood and Markov chain Monte Carlo revealed the presence of 22 molecular taxonomic units (MOTUs). Phylogenetic analysis based on bayesian inference did not statistically resolve all relationships among identified MOTUs. Future studies concerning taxonomy and phylogenetic relationships of Graphiurus species should therefore include more genetic data.
Keywords:
cytochrome b; Genus graphiurus; taxonomy; cytochrom b; Rod Graphiurus; taxonomie Citation: LIŠKOVÁ, Edita. Genetická diverzita afrických plchů rodu \kur{Graphiurus} (Rodentia, Gliridae). České Budějovice, 2021. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta
Institution: University of South Bohemia in České Budějovice
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Original record: http://www.jcu.cz/vskp/52535