Original title: Molekulárně-dynamické simulace komplexů sestávajících z nukleových kyselin a proteinů
Translated title: Molecular dynamics simulations of complexes consisting of proteins and nucleic acids
Authors: Šmít, Daniel ; Barvík, Ivan (advisor) ; Štěpánek, Petr (referee)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2008
Language: cze
Abstract: Na/ev pracc: Molekularne-dynamicke simulace komplcxu sestavajicich z nukleovyeh kyselin a proleinu Autor: Daniel Snu't Katedra (ustav): Fy/ikalni ustav UK Vedouci hukalafskc prace: RNDr. Ivan Barvik. Ph.D. e-mail vedoueiho: iharvikiY/'karlov.mff.euni.c/ Abstrakt: Prace od /akladu se/namujc s biochemickymi principy. struklurou nukleovych kysclin a aminokyselin, stavbou proleinu a mechanismem jejich synte/y. /vlastni zfetel jc kladen na /pusoby replikacc nukleovych kysclin ruznyeh viru a na mo/nosli lerapie zalozene na interferenci s toulo replikaci. Dale jsou nastmeny i jine moderni melody lerapie spoci'vajici v modulaci imunity ei vyu/ili RNA interference. Struklura viru IICV je podrobne popsana. Replikacni en7\'in viru. IK'V RNA depcndenlni KNA polymcra/a, je podrt>bne popsan spolu s pfedpokladunym prubehcm jelut iniciace a poKmeracni akiiviiy. Dale jsou popsans /aklady molekularne dynamickych (Ml)) simulaci. ktere jsou v ranici bakalafske prace denionstrovany na jednoduchem modelovem systemu argonoveho clusteru. V druhe polovinc prace jsou provedeny MD simulace inhihice IK'V RclRp prostrednictvim lalek PMIXi, PMPG a IIPMPG. Struklura a stabilita komplexu je dctailnc analy/ovana na atomarni urovni. Klicova slova: molekularni dynamika. nuklcove kyseliny, IICV. IIPMIJ(j Title: Molecular dynamics simulations...

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/16416

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-501037


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses