Translated title:
Taxonomic characterization of new Halorubrum isolates from hypersaline soils.
Authors:
Horáčková, Markéta ; Jílek, Petr (advisor) ; Konečná, Klára (referee) Document type: Master’s theses
Year:
2016
Language:
eng Abstract:
[eng][cze] Candidate: Markéta Horáčková Title of diploma thesis: Taxonomic characterization of new Halorubrum isolates from hypersaline soils. Charles University, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Department of Biological and Medicinal Sciences University of Sevilla, Faculty of Pharmacy Department of Microbiology and Parasitology Study program: Pharmacy The aim of this work is to continue in taxonomic characterization of new strains of the genus Halorubrum isolated from hypersaline soils from Paraje Natural Marismas del Odiel, Huelva, Spain. These Archaea are micro-organisms that require high salt concentration in their environment. With the characterization started Ana Durán Viseras last year and I participated on continuation of this characterization. To complete phylogenetic study we performed MLSA of rpoB gene of each sample to create phylogenetic trees. Based on results of the phylogenetic study we inferred that studied strains could constitute new species. We determined the guanine plus cytosine content in DNA and also carried out phenotypic studies as important part of the taxonomic characterization of the new species.Kandidát: Markéta Horáčková Název diplomové práce: Taxonomická charakterizace nových izolátů rodu Halorubrum z hypersalinních půd. Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd University of Sevilla, Faculty of Pharmacy Department of Microbiology and Parasitology Studijní program: Farmacie Cílem této práce je pokračovat v charakterizaci nových Archaeí rodu Halorubrum izolovaných z hypersalinních půd lokalizovaných u města Huelva v jihozápadním Španělsku. Tato Archaea jsou mikroorganismy vyžadující ke svému životu vysokou koncentraci solí v okolním prostředí. S jejich charakterizací začala minulý rok Ana Durán Viseras a během svého pobytu jsem se podílela na pokračování této charakterizace. Pro doplnění fylogenetické studie jsme amplifikovali gen rpoB jednotlivých Archeí pomocí MLSA a vytvořili fylogenetický strom. Na základě výsledků této studie jsme usoudili, že se jedná o nový druh a započali jsme s fenotypickou charakterizací. U izolované DNA jsme určili obsah guaninových a cytosinových bazí, jež je součástí taxonomických charakterizací nových druhů.
Institution: Charles University Faculties (theses)
(web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository. Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/78029