Název:
Srovnávací analýza genomů dvoudomých rostlin
Autoři:
Bačovská, Nela Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok:
2017
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] V rámci rostlinné říše je asi desetina druhů s odlišitelnými pohlavími. Protože jsou obecně rostlinné pohlavní chromozomy (pokud jsou vůbec odlišitelné od autozomů) řádově mnohem mladší než ty živočišné, je zajímavé využít jejich analýzu pro genomické studie. Tyto poznatky lze aplikovat i pro agronomické účely, jež v některých případech využívají právě pohlavní odlišnosti mezi pěstovanými rostlinami, případně se snaží šlechtit na různé sex-vázané znaky. Kvůli časté polyploidizaci a dlouhodobému výběru pouze zemědělsky výhodných znaků je vhodné najít rostlinný model, který nepodléhal lidské selekci a lze tak na něm studovat přirozený vývoj genomů. V této práci byl pro tento účel zvolen druh Mercurialis annua a pro srovnání jeho blízký příbuzný Mercurialis huetii, jejichž pohlavní chromozomy se pravděpodobně nacházejí na počátku diferenciace.In the plant kingdom, only about one tenth of the species have different sexes. Since plant sex chromosomes are in general younger (and not always distinguishable from autosomes) than animal sex chromosomes, it is interesting to analyze them. This data can then be used in agricultural research in terms of growing exlusively one type of sex or using sex-linked genes for breeding. Because of polyploidization and long-term selection of only agriculturaly advantageous features, it seems fit to find a model plant which has not been subjected to artificial selection and could be used for the study of natural genome evolution. In this study, we chose Mercurialis annua and its close relative Mercurialis huetii for comparative analysis of their genomes and sex chromosomes which seem to be undergoing the first stage of degeneration.
Klíčová slova:
annua; genome; huetii; Mercurialis; pohlavní chromozomy; repetitivní sekvence