Název:
Návrh, syntéza a biologické hodnocení 2,3-disubstituovaných pyrazinů
Překlad názvu:
Design, synthesis and biological evaluation of 2,3-disubstituted pyrazines
Autoři:
Kerda, Marek ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Kučerová, Marta (oponent) Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok:
2020
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Vedoucí diplomové práce: doc. PharmDr. Jan Zitko, PhD. Řešitel: Marek Kerda Název diplomové práci: Návrh, syntéza a biologické hodnocení 2,3-disubstituovaných pyrazinů Tato práce se zabývá problematikou tuberkulózy. V teoretické části jsou shrnuty základní vědomosti a poznatky o onemocnění, současná epidemiologie a léčiva, která se při její léčbě využívají. Popsány jsou i látky, které jsou momentálně v různých fázích klinických testů a mohly by se v budoucnu na léčbu tuberkulózy používat. Vyhledané informace byly využity z dostupných učebních textů a v odborných publikacích na webech PubMed a Web of Science. Jsou zde také shrnuty základní metody počítačového designu nových léčiv. V rámci praktické části práce byla věnována pozornost objevu nového inhibitoru lidské prolyl- tRNA synthetasy, který je strukturně odvozený od antituberkulotika pyrazinamidu. Byla vytvořena in silico virtuální knihovna nových potenciálních ligandů odvozených od pyrazinamidu. Následný molekulární docking do struktur lidské prolyl-tRNA synthetasy (pdb: 5VAD), do bakteriální verze enzymu (pdb: 2J3M) a vyhodnocení proběhly v programu Molecular Operating Environment (Chemical Computing Group, Canada). Z výsledků byly předurčeny některé ze základních rysů struktury s...Charles University in Prague, Faculty of Pharmacy in Hradec Králové Supervisor: Assoc. Prof. PharmD. Jan Zitko, PhD. Author: Marek Kerda Title of diploma thesis: Design, synthesis and biological evaluation of 2,3-disubstituted pyrazines This thesis deals with problem of tuberculosis. In a theoretical part are summarized information and knowledge about tuberculosis, nowadays epidemiology and drugs used in current treatment. There are also described drugs in the different stage of clinical trials and could be used for treatment of tuberculosis in the future. Searched information were used from accessible learning materials and in articles in online databases as Web of Science and PubMed. There are also summarized basic methods of computer design of new drugs. In practical part of this thesis was focus on novel inhibitor of prolyl-tRNA synthetase, which is based on structure of pyrazinamide. There was prepared in silico virtual library of pyrazine-based new potential ligands. Related docking to the structure of human prolyl t-RNA (pdb: 5VAD) and the bacterial version of this enzyme (pdb: 2J3M) and evaluation was performed in Molecular Operating Environment (Chemical Computing Group, Canada). From the results were predicted some of the relations between structure and activity. Virtual library of the...
Klíčová slova:
antibakteriální; antimikrobiální; antimykobakteriální; cytotoxicita; pyrazin; antibacterial; antimicrobial; antimycobacterial; cytotoxicity; pyrazine