Original title:
Určování genetické odlišnosti biologických sekvencí DNA
Translated title:
Determination of genetic differences of biological DNA sequences
Authors:
Sliž, Ladislav ; Škutková, Helena (referee) ; Provazník, Ivo (advisor) Document type: Master’s theses
Language:
cze Publisher:
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií Abstract:
[cze][eng]
Práce na téma určování genetické odlišnosti zarovnáváním signálu biologických sekvencí DNA, se bude zabývat stručným popisem skladby DNA. Následovat bude základní informace o bioinformatické analýze. Poté bude práce popisovat možnosti zarovnávání sekvencí DNA. Práce se zaměří především na globální Needlemanův-Wunschův algoritmus a lokální Smit – Watermanovův algoritmus. Dále se tato práce zaměří na zarovnávání DNA sekvencí pomocí metod CGR a FCGR. Na závěr bude práce popisovat praktickou aplikaci určování genetické odlišnosti pomocí zarovnávání sekvencí
Work on determining the genetic diversity of biological signal aligning DNA sequences, will address a brief description of the composition of DNA. Following is basic information on the bioinformatics analysis. Then the work will describe the possibility of aligning DNA sequences. Work will focus primarily on global Needleman-Wunsch algorithm and local Smit - Watermanovův algorithm. Furthermore, this work will focus on aligning DNA sequences using methods CGR and FCGR. At the end of the work will describe the practical application of identifying genetic differences by aligning the sequences.
Keywords:
CGR (Chaos Game Representation); DNA; FCGR (Chaos Game Representation of Frequencies); global; local; Needleman-Wunsch algorithm; sequence alignment; CGR (Chaos Game Reprezentece); DNA; FCGR (Frekvenční Chaos Game Reprezentace); globální; lokální; Needlemanův-Wunschův algoritmus; zarovnávání sekvencí
Institution: Brno University of Technology
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library. Original record: http://hdl.handle.net/11012/71197