Original title: Vyhledávání LTR retrotranspozonů v lidském genomu
Translated title: Identification of LTR retrotransposons in human genome
Authors: Trott, Eduard ; Maděránková, Denisa (referee) ; Sedlář, Karel (advisor)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2016
Language: eng
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract: [eng] [cze]
Cílem této práce je zpracování literární rešerše na téma vyhledávání LTR retrotranspozonů v lidském genomu. Práce popisuje možné problémy spojedné s danou tématikou a obsahuje implementaci nového vhodného algoritmu pro vyhledávání. Výsledky tohoto algoritmu, obsahující všechny nalezené LTRs byly statisticky porovnány s existujícími algoritmy pro vyhledávání nových retroelementů. The goal of this thesis is to provide a literature review on methods for searching of LTR retrotransposons in the human genome. The thesis characterizes the potential problems related to a given topic and provides implementation of novel suitable searching algorithm. The result of algorithms containing all found LTRs were statistically compared with several existing tools for de novo identification of retroelements.
Keywords: LTR; retrotranspozony; de novo; long terminal repeat; LTR; retrotransposon

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/61691

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-255230


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses